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Macintyre领导的研究团队与剑桥大学和初创公司Tailor Bio合作，开发出一种方法，可以预测哪些患者不会对常用的化疗药物（如铂类、紫杉类和蒽环类化疗药物）产生应答。
化疗是摧毁肿瘤细胞的一种策略。几十年来，它一直是治疗癌症的标准方法。然而，化疗并非总是有效。
西班牙国家癌症研究中心（CNIO）计算肿瘤学团队负责人Geoff Macintyre解释说：“化疗对某些患者有效，但并非适用于所有病例。20%到50%的癌症患者对这些药物没有应答。他们将承受化疗带来的副作用，却无法获得任何临床收益。”
Macintyre领导的研究团队与剑桥大学和初创公司Tailor Bio合作，开发出一种方法，可以预测哪些患者不会对常用的化疗药物（如铂类、紫杉类和蒽环类化疗药物）产生应答。
这项研究成果于6月23日发表在《Nature Genetics》杂志上。
作者表示： “重要的是，我们的研究为多种药物引入了患者分层的生物标志物，这些药物原本并不是作为靶向疗法开发的。”
共同第一作者、西班牙国家癌症研究中心的Joe Sneath Thompson表示：“我们的基因组检测可以定量三种化疗药物的生物标志物。该检测适用于多种不同类型的癌症，因此，我们的研究成果每年有望惠及数十万名患者。”
众所周知，许多肿瘤细胞的染色体数量会逐渐发生变化，其后果之一是癌细胞缺乏正确数量的遗传物质。
这些染色体变化在每个肿瘤中各不相同，但它们共同形成了染色体不稳定性（CIN）的特征或标记。这项新研究基于这些CIN特征开发出生物标志物。
这些生物标志物让我们能够“提前检测出哪些患者对这些治疗具有耐药性，这样他们就可以避免不必要的副作用”，Macintyre解释道。
研究人员利用靶向捕获基因组合测序、低深度全基因组测序和计算分析，以CIN特征为基础来预测化疗耐药性。他们的分析聚焦于840名接受铂类、紫杉类或蒽环类化疗的癌症患者。
这种方法扩展了人们对化疗药物作用机制的认识。例如，铂类化疗会引入较大的DNA加合物，而核苷酸切除修复功能受损的肿瘤难以修复这些加合物。此外，同源重组功能受损的肿瘤难以修复化疗引起的双链DNA断裂。
研究人员随后利用乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌或肉瘤患者的回顾性数据，在随机对照临床试验中进行模拟。他们发现，CIN标志物能够揭示与三种化疗引入的DNA损伤存在合成致死相互作用的突变是否存在。
具体来说，他们利用CIN标志物筛选出对紫杉类和蒽环类药物存在耐药风险的卵巢癌病例，以及对紫杉类或蒽环类化疗耐药风险增高的转移性乳腺癌和前列腺癌病例。
研究人员表示：“这项研究结果强调了染色体不稳定性特征在预测多种癌症化疗耐药性方面的临床价值，有望将‘一刀切’的化疗方案转变为精准的个性化治疗。”
据Macintyre介绍，Tailor Bio公司是从剑桥大学分拆出来的，旨在基于这些CIN特征构建精准医学平台。
“Tailor Bio打算将该检测商业化，同时利用该技术对患者进行分层，以便尝试新疗法（例如通过与Volastra合作进行KIF18A抑制剂临床试验），” Macintyre说，并指出该公司也在针对染色体不稳定的肿瘤开发治疗方法。
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