Nature子刊:首张Burkitt淋巴瘤遗传图谱

时间:2012年11月14日
来源:生物通

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在第一张绘制的伯奇氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)广泛遗传图谱中,杜克大学医学院的科学家以及他们的合作者们发现了70个突变,其中一些从前并未显示与癌症相关,其中一个新突变为这一疾病所独有。

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生物通报道  在第一张绘制的伯奇氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)广泛遗传图谱中,杜克大学医学院的科学家以及他们的合作者们发现了70个突变,其中一些从前并未显示与癌症相关,其中一个新突变为这一疾病所独有。

针对Burkitt淋巴瘤(一种侵袭性淋巴瘤形式)的基因测序结果可用于开发新药,或利用现有的治疗靶向已知易受影响的突变。研究人员将这些研究结果在线发表在11月11日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

“这项研究阐明了该疾病最常见的遗传改变,让我们了解了这一疾病的生物学,由此我们可以设计出更好的治疗,”研究的资深作者、杜克大学副教授Sandeep S. Dave博士说。

Dave和同事们测序了第一个完整的Burkitt淋巴瘤基因组,加上了来自另外59个Burkitt淋巴瘤病例以及94个弥漫性大B细胞淋巴瘤(Diffuse large B-cell lymphoma)的基因。弥漫性大B细胞淋巴瘤与Burkitt淋巴瘤具有许多相同的特征。恶性肿瘤之间的相似性往往会导致误诊和治疗失败。

研究人员报告称Burkitt淋巴瘤与弥漫性大B细胞淋巴瘤之间的基因突变模式存在显著的差异。

Dave说:“重要的是,医生可以对Burkitt淋巴瘤做出正确的诊断,并用正确的疗法来治愈它。因为如果误诊并给予弥漫性大B细胞淋巴瘤的标准化疗方案,Burkitt淋巴瘤的患者会常常复发。”

分析鉴别了70个在Burkitt淋巴瘤频繁突变的基因,其中一些基因是首次在癌症中被确定。一个新发现的基因突变ID3出现在34%的伯奇氏淋巴瘤病例中,但在弥漫性大B细胞淋巴瘤中却并不明显。这一突变对一个抑制细胞生长的基因产生沉默效应,促使细胞增殖。

Dave说只有这一改变可能并不会引起癌症,但是当它与在Burkitt淋巴瘤和其他恶性肿瘤中常见的MYC基因突变一起发生时,它就会像促进剂一样推动肿瘤生长。这一发现可能有助于开发一种功能上像正常ID3基因的新药,抑制淋巴瘤以及许多其他癌症的癌细胞增殖。

Dave说:“如果我们能找到一种方法模拟ID3,修复这一基因的功能减慢肿瘤生长,这有可能提供一种新的治疗方法。我们的实验表明情况确是如此,但还有必要开展更多额研究。这项工作提供了一个起点。”

(生物通:何嫱) 

生物通推荐原文摘要:

The genetic landscape of mutations in Burkitt lymphoma

Burkitt lymphoma is characterized by deregulation of MYC, but the contribution of other genetic mutations to the disease is largely unknown. Here, we describe the first completely sequenced genome from a Burkitt lymphoma tumor and germline DNA from the same affected individual. We further sequenced the exomes of 59 Burkitt lymphoma tumors and compared them to sequenced exomes from 94 diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) tumors. We identified 70 genes that were recurrently mutated in Burkitt lymphomas, including ID3, GNA13, RET, PIK3R1 and the SWI/SNF genes ARID1A and SMARCA4. Our data implicate a number of genes in cancer for the first time, including CCT6B, SALL3, FTCD and PC. ID3 mutations occurred in 34% of Burkitt lymphomas and not in DLBCLs. We show experimentally that ID3 mutations promote cell cycle progression and proliferation. Our work thus elucidates commonly occurring gene-coding mutations in Burkitt lymphoma and implicates ID3 as a new tumor suppressor gene

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