浙大蔡新忠组：miRNA如何调控油菜和核盘菌的相互作用？

时间：2016年7月18日

来源：联川生物

编辑推荐：

MicroRNAs（miRNAs）是一种多功能非编码的短核苷酸分子。然而，miRNA在植物和死体营养性病原相互作用中所起到的作用很大程度上是未知的。

在这项研究中，浙江大学蔡新忠课题组鉴定了重要经济油料作物油菜（甘蓝型油菜）的miRNA谱，以及参与甘蓝型油菜和核盘菌相互作用的miRNA谱。首先，研究人员分别对正常甘蓝型油菜叶和经核盘菌侵染的甘蓝型油菜叶进行小RNA测序，结果鉴定出280种甘蓝型油菜的miRNA基因，包括53种新miRNA，以及227种典型miRNA或已知的miRNA家族的变种；其次，对两种样本进行降解组测序进一步鉴定出15种新miRNA的靶基因和222个已知miRNA的靶基因。最后，miRNA芯片分析显示，经核盘菌侵染的叶片和正常叶片之间有68种miRNAs的表达存在差异。

图正常油菜叶和核盘菌侵染的油菜叶miRNA差异表达谱

这些miRNA的靶基因中的一组参与植物菌核病的防御，和/或其他病原体如富亮氨酸重复的核苷酸结合位点（NBS-LRR）R基因、NO和活性氧相关基因。此外，3个miRNA的靶基因AGO1和AGO2是转录后基因沉默（PTGS）的关键元件。几种病毒引起的PTGS抑制基因的表达降低了植物对菌核病的抵抗力。AGO1和AGO2突变的拟南芥表现出抵抗力降低，而AGO1过表达的转基因品种以水平依赖的方式对菌核病的抵抗力增加。此外，miRNA靶基因AGO1和AGO2的瞬时过表达降低油菜对菌核病的抵抗力。

本研究结果表明，甘蓝型油菜和核盘菌的相互作用在miRNA水平具有严密的调控，且可能涉及PTGS。

本研究中的小RNA测序、降解组测序，以及miRNA芯片由联川生物协助完成。

用户文章
Cao JY, et al. （2016）Tight regulation of the interaction between Brassica napus and Sclerotinia sclerotiorum at the microRNA level. Plant Mol Biol. doi 10.1007/s11103-016-0494-3.

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到调控靶基因功能分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413

关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。