METTL1 介导的 m7G 修饰通过稳定 ICAM-1 促进结直肠癌转移:开拓抗癌新靶点

时间:2025年4月20日
来源:Molecular and Cellular Biochemistry

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结直肠癌(CRC)转移预后差,RNA 修饰与癌症关系备受关注。研究人员探究 METTL1 介导的 m7G 修饰在 CRC 转移中的作用。结果发现 METTL1 通过 m7G 修饰稳定 ICAM-1 促进 CRC 转移。该研究为 CRC 治疗提供新靶点。

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在癌症的世界里,结直肠癌(CRC)就像一个顽固的 “敌人”,严重威胁着人类的健康。全球范围内,CRC 是最常见的肿瘤之一,2022 年新诊断的癌症病例中,CRC 占比达到 9.6% 。一旦癌症发生转移,情况更是雪上加霜,患者的 5 年生存率大幅下降,生活质量也严重受损,而且目前针对转移性 CRC 的多种治疗手段效果都不尽如人意,患者对这些治疗的反应较差,这就迫切需要寻找新的治疗靶点来对抗这个 “敌人”。
随着科学技术的不断发展,人们对生命奥秘的探索也越来越深入。在分子生物学领域,RNA 修饰逐渐走进了科学家们的视野。RNA 修饰就像是给 RNA 分子加上了各种 “小标签”,这些 “标签” 在 RNA 的生命周期中起着至关重要的作用,它们可以影响 RNA 的结构、稳定性以及与蛋白质的相互作用,进而调控基因表达等重要过程。其中,N7 - 甲基鸟苷(m7G)是一种常见的 RNA 甲基化修饰,而甲基转移酶 1(METTL1)是催化 m7G 修饰的关键酶。已有研究发现,METTL1 在多种癌症中表达增加,暗示着 m7G 修饰和 METTL1 在癌症发展进程中有着重要作用。但在转移性 CRC 中,m7G 修饰究竟扮演着怎样的角色,还不得而知。

为了揭开这个谜团,浙江大学医学院附属第二医院的研究人员展开了一系列研究。他们通过生物信息分析、体外和体内实验等多种手段,深入探究了 METTL1 在 CRC 进展中的作用。研究发现,METTL1 在转移性 CRC 中显著上调,并且通过 m7G 修饰稳定细胞间黏附分子 - 1(ICAM-1),在 CRC 转移过程中发挥着关键作用。这一发现意义重大,为转移性 CRC 的治疗提供了新的潜在靶点,有望为患者带来新的希望。该研究成果发表在《Molecular and Cellular Biochemistry》杂志上。

研究人员开展研究时运用了多种关键技术方法。首先,通过分析公共数据库中的单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据,筛选出与 CRC 转移相关的基因;接着进行细胞实验,对 CRC 细胞系 HCT116 和 RKO 进行转染操作,改变 METTL1 的表达水平;同时构建体内小鼠转移模型,模拟 CRC 转移过程;还利用甲基化 RNA 免疫沉淀(MeRIP)技术检测 m7G 修饰水平,通过 RNA 降解实验探究 ICAM-1 mRNA 的稳定性 。

下面来看具体的研究结果:

  • METTL1 与 CRC 进展的关联:分析 23 个 CRC 样本的 scRNA-seq 数据,发现 28 号细胞簇与晚期 CRC 阶段密切相关。通过交集分析确定了 5 个候选基因,RT-qPCR 分析显示肿瘤组织中 METTL1 表达显著高于正常组织。孟德尔随机化(MR)分析表明 METTL1 表达与 CRC 风险呈正相关,且高表达 METTL1 的患者总体生存率较差。
  • METTL1 在 CRC 转移中的作用:转染靶向 METTL1 的 siRNA 后,HCT116 和 RKO 细胞的迁移能力显著下降;过表达 METTL1 则增强细胞迁移和侵袭能力。构建 METTL1 稳定敲除细胞系,其迁移和侵袭率也明显降低。体内实验也证实,METTL1 敲除的小鼠生物发光信号强度显著降低,说明 METTL1 可诱导 CRC 体内转移。此外,通过拯救实验发现,野生型 METTL1 可恢复细胞迁移能力,而催化失活的突变体则不能,证明了 METTL1 甲基转移酶活性在促进 CRC 转移中的关键作用。
  • ICAM-1 是 CRC 中 METTL1 的潜在下游靶点:对 METTL1 敲除的 HCT116 细胞进行转录组测序,确定了差异表达基因。RT-qPCR 验证发现,ICAM-1 在 METTL1 敲除的细胞中表达显著降低,过表达 METTL1 则使 ICAM-1 表达增加。分析 TCGA 数据库发现,在晚期 CRC 中 METTL1 与 ICAM-1 表达呈正相关。MeRIP-qPCR 分析表明,METTL1 过表达显著提高 ICAM-1 mRNA 的 m7G 修饰水平,且肿瘤组织中 m7G 修饰的 ICAM-1 mRNA 比正常组织更丰富。
  • METTL1 通过稳定 ICAM-1 mRNA 促进 CRC 转移:在 METTL1 敲除的 CRC 细胞中过表达 ICAM-1,细胞迁移能力显著增加,小鼠体内生物发光信号也更强。MeRIP-qPCR 显示,METTL1 敲除降低 ICAM-1 mRNA 的 m7G 水平,野生型 METTL1 可恢复,而酶活性丧失的 METTL1 则无此作用。RNA 降解实验表明,野生型 METTL1 延长 ICAM-1 mRNA 的半衰期,而 METTL1 沉默则缩短其半衰期,突变体无明显影响,说明 METTL1 通过 m7G 修饰稳定 ICAM-1 mRNA,促进 CRC 转移。

研究结论和讨论部分指出,本研究揭示了 METTL1 介导的 m7G 修饰通过稳定 ICAM-1 促进 CRC 转移。METTL1 在 CRC 中显著上调,与患者预后不良相关。m7G 修饰可以稳定 ICAM-1 mRNA,增加其稳定性,减少降解,从而提高 ICAM-1 蛋白水平,增强其促转移作用。此外,研究还发现 METTL1 影响上皮 - 间质转化(EMT)相关蛋白表达,ICAM-1 可能通过激活相关信号通路调控 EMT 过程,而 METTL1 可能通过稳定 ICAM-1 mRNA 进一步增强这些信号通路 。

这项研究为理解 CRC 转移的分子机制提供了新的视角,METTL1 有望成为转移性 CRC 治疗的潜在靶点。未来还需要进一步研究 METTL1 相关的分子相互作用,并在临床前和临床研究中评估 METTL1 抑制剂的效果,为改善晚期 CRC 患者的治疗效果带来新的希望。

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