毒素-抗毒素(TA)系统是普遍存在于细菌染色体和质粒中的遗传模块,由稳定的毒素和不稳定的抗毒素组成。最初这些系统被描述为通过分离后杀伤(PSK)维持稳定性的质粒“依赖模块”1。此外,TA系统现在被认为是细菌应激适应、持久性和生物膜动态的关键调节因子。根据毒素-抗毒素的相互作用机制,已将其分为八种类型2。在II型系统中,毒素和抗毒素都是蛋白质,抗毒素通过与毒素的结构域结合来中和它们。在八种TA系统中,II型是最常见且研究最广泛的类别。II型毒素通常具有核酸内切酶活性,能够降解mRNA或抑制核糖体功能3。II型抗毒素通常由两个结构域组成:一个是DNA结合结构域,可用于自我调节;另一个是毒素结合结构域,用于结合毒素以中和其活性4。抗毒素容易发生部分折叠,使其容易受到宿主蛋白酶Lon或Clp的降解。抗毒素的降解会释放出更稳定的毒素4。为了防止过多毒素破坏细胞稳态,抗毒素的产量通常高于毒素。因此,在大多数II型TA系统中,抗毒素基因位于毒素基因之前,确保抗毒素的合成先于毒素的产生。
最常见的II型TA系统包括VapBC、MazEF、RelBE、HigBA和MqsRA等。大多数II型毒素具有核糖核酸内切酶活性,这种性质可以抑制翻译过程。一些II型毒素(如MazF和MqsR毒素)作为全局调节因子,能够以序列特异性方式识别并切割游离mRNA,导致翻译暂停和细胞休眠。相比之下,MazE抗毒素会包裹在MazF毒素表面,迫使毒素解离核糖体的S1-S2环<5, 6>。RelE毒素等毒素则针对核糖体相关的mRNA进行切割,而由大肠杆菌编码的II型RelB抗毒素通过改变位于第87位的碳端酪氨酸残基上的柔性α螺旋来破坏毒素结构<7, 8, 9>。显然,某些II型毒素能够干扰翻译过程。弗莱克斯纳志贺菌和鼠伤寒沙门菌的VapC毒素已被证明能够切割起始tRNA。结核分枝杆菌的VapB5抗毒素通过改变Arg112侧链的构象来抑制VapC5的活性,使Glu57残基无法与Mg2+(VapC5激活所需的辅因子)结合<10, 11, 12>。结核分枝杆菌中的II型HipA毒素是一种激酶,通过磷酸化谷氨酰-tRNA合成酶来抑制翻译。抗毒素HipB是一种具有螺旋-转角-螺旋(HTH)结构的转录因子,它可以结合hipBA启动子或与HipA形成复合物,从而抑制转录并中和HipA的毒性<13>。某些II型毒素(如CcdB和ParE)通过直接抑制DNA旋转酶的活性来影响DNA复制,从而显著减缓复制叉的形成过程<14>。
VII型TA系统是一类新的系统,其特征是具有蛋白质毒素和酶促抗毒素,后者通过翻译后修饰(PTMs)使毒素失活。这一机制使它们与其他TA类型区分开来。典型的VII型TA系统包括Hha-TomB系统、HepT-MntA系统和TglT-TglA系统,这些系统在应激条件下被激活并执行重要的生理功能<15>。
大肠杆菌中的抗毒素TomB能够氧化修饰Hha毒素中的保守第18位半胱氨酸残基,从而对抗毒素蛋白产生拮抗作用<16>。然而,
鼠伤寒沙门菌中Hha-TomB系统的确切分类仍存在争议,现有文献对其分类意见不一。HEPN和MntA结构域最早于2015年在海洋细菌中被发现。
MntA抗毒素具有核苷酸转移酶活性,能够将三个连续的AMP转移到毒素蛋白HepT的酪氨酸位点,这种多聚腺苷酸化修饰对于中和毒素毒性至关重要<17, 18>。TglT-TglA最初在结核分枝杆菌中被发现,后来被归类为VII型TA系统。在这种情况下,抗毒素表现为一种非典型的丝氨酸蛋白激酶,能够磷酸化毒素蛋白的丝氨酸位点,使其失活。图1展示了II型和VII型TA系统的示意图(https://app.biorender.com/account/admin)。生物膜的形成是一个多阶段过程,包括初始附着、微群体聚集、胞外聚合物物质(EPS)的形成、生物膜的成熟和扩散19。上述EPS包含蛋白质、多糖、脂质和胞外DNA(eDNA),在长期营养匮乏的情况下为细菌提供营养来源。据估计,80%的慢性难治性感染与生物膜形成有关20。生物膜的致密结构使得细菌对抗生素的通透性降低,从而产生多重耐药性,逃避宿主免疫系统的攻击,并允许细菌发展成持久性感染21>。已证实纤维素是大肠杆菌、沙门菌和结核分枝杆菌生物膜中的EPS成分。此外,同时使用纤维素酶和蛋白酶可以抑制结核分枝杆菌的生物膜形成<22, 23>。此外,DNA降解也是铜绿假单胞菌生物膜分解的关键因素24。总之,生物膜结构的形成依赖于纤维素、蛋白质和DNA。