综述:针对生物膜的新策略:群体感应抑制剂的结构-活性关系综述

时间:2026年1月21日
来源:Journal of Molecular Structure

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生物膜依赖群体感应系统(QS)形成,QS抑制剂(QSIs)通过阻断细菌间信号传递抑制生物膜构建并降低耐药性。本文综述2016-2025年发现的多种小分子QSIs(咪唑、噻唑、吲哚等杂环结构),阐明其结构活性关系及对临床相关细菌(如铜绿假单胞菌)的活性机制,为开发广谱高效QSIs提供参考。

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李贵文|梁康辉|张文|饶国武|郑全
浙江工业大学药学院,中国杭州310014;浙江省化学药物绿色制造技术重点实验室,中国德清313200

摘要

生物膜是细菌附着在表面并分泌细胞外基质后形成的复杂社区结构,是慢性感染和抗菌素耐药性增加的关键因素。群体感应抑制剂(QSIs)通过破坏群体感应(QS)系统来抑制生物膜的形成或促进其分散,从而降低耐药性发展的可能性。近年来,QSIs作为一种新型的抗生物膜策略受到了广泛关注。本综述概述了通过QS系统消除生物膜的策略,包括生物膜、QS以及QSIs调节生物膜的机制。本文重点总结了2016-2025年间具有不同骨架的小分子QSIs的结构-活性关系和生物学评价。这些骨架包括咪唑、噻唑、吲哚、喹啉、喹唑啉、吡啶、呋喃酮、吡唑、吡咯酮和噁唑等。该总结旨在为未来开发具有多重靶点潜力的高效、稳定的QSIs提供参考,以应对与生物膜相关的感染和抗生素耐药性问题。

引言

生物膜的形成是微生物耐药性发展的一个关键因素。据估计,临床环境中约80%的细菌感染与生物膜密切相关[1]。与生物膜相关的感染难以治疗,现有的抗生素在消灭生物膜的同时难以不伤害宿主[2]。这类感染不仅发生在肺部、慢性伤口和泌尿道,还可能定植于手术器械、导管和假体等医疗设备上[3][4][5]。中心静脉导管相关血流感染(CLABSI)是最常见且致命的器械相关感染。统计数据显示,仅在美国,每年就有约25万例CLABSI相关感染,导致约2.8万人死亡[6]。随着与生物膜相关感染的日益增多,迫切需要创新抗生物膜疗法来应对细菌感染。研究人员探索了多种针对生物膜相关细菌感染的治疗策略[7]。其中,破坏细菌的QS系统是一种非常有前景的方法。与传统杀菌方式不同,QSIs通过调节信号分子来减少毒力因子的产生或阻碍生物膜的发展,显著降低抗生素耐药性的风险[8]。
生物膜是由附着在生物或非生物表面的微生物分泌的细胞外聚合物。这些聚合物将微生物包裹起来,通过复杂的机制发展成具有组织样特征和分化的多细胞集合体[9]。对于细菌生物膜而言,其细胞外聚合物包含多糖、蛋白质、脂质和细胞外DNA(eDNA)。由这些成分组成的细胞外基质有助于细菌细胞之间的粘附,从而形成空间有序的聚集体。这种聚集生存策略作为细菌在不利环境中的自我保护机制,提高了它们对这些条件的适应性[10]。与浮游细菌相比,生物膜内的细菌细胞表现出超过1000倍的抗生素耐药性[11]。
最近关于生物膜的研究表明,细菌生物膜的形成是一个多步骤过程,主要分为四个阶段:(i) 当可附着材料的表面靠近浮游细菌细胞时,细菌通过自身的鞭毛或范德华力等分子间相互作用力停留在表面上,这是一个可逆的过程。(ii) 随着微生物的培养和分裂,它们会产生微菌落并释放细胞外聚合物物质(EPS),这些物质在细胞外形成基质,增强对物体表面的粘附。(iii) 随着聚集体内细菌的增殖,微生物群落逐渐形成具有三维框架的成熟生物膜。细胞外基质EPS创造了多功能的伪装环境,而复杂的生物膜结构为被包裹的细菌提供了物质运输、支持和保护。群体感应系统使微生物能够相互交流。(iv) 随着成熟生物膜内细菌浓度的逐渐增加,空间和资源将变得有限,一些微生物会从生物膜中脱离。(v) 细菌重新恢复自由游动状态[12](图1)。此外,生物膜的形成和与生物膜相关的感染主要依赖于细菌的表面粘附能力。细菌的鞭毛、菌毛、EPS和其他粘附素都有助于增强细菌的表面粘附能力[13]。
群体感应(QS)是多种微生物之间普遍存在的细胞间通信系统,表示细菌以细胞密度依赖的方式调节基因表达[14]。随着细菌的增殖,它们不断向周围环境分泌信号分子。这些分子随着种群密度的增加而积累。一旦达到特定的阈值浓度,多个基因的转录会同步进行,使群体能够集体行动[15]。这种可扩散的信号调节生物膜的形成、毒力因子的分泌、集体运动性、蛋白酶的产生和抗生素耐药性[16]。QS信号分子主要包括N-酰基高丝氨酸内酯(AHLs)、自诱导肽(AIPs)、自诱导剂-2(AI-2)、自诱导剂-3(AI-3)等[17]。AI-3是QseBC两组分系统中的类激素信号分子,可诱导QseC结构域的自磷酸化,激活主要的flhDC调控子转录。然而,AI-3诱导生物膜形成的具体机制尚不清楚[18]。AHL介导多种QS系统,包括TofI/R、AfeI/R、BtaI/R、LasI/R、RhlI/R、LbsI/R和EsaI/R[19]。这种信号分子常见于革兰氏阴性细菌[20]。AIPs在革兰氏阳性细菌中作为种内通信的信号[21]。AI-2由LuxS合成,在原核生物中起通用信号分子的作用,常被称为“细菌的通用语言”。已经鉴定出三类AI-2受体:LuxP家族、LsrB家族以及存在于各种跨膜蛋白中的dCACHE结构域,包括化学受体、组氨酸激酶和二氢酶环化酶。AI-2与这些受体结合,调节环二GMP代谢、趋化性和生物膜的形成[22]。除了这些主要信号分子外,还发现了其他信号分子,如铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)产生的2-庚基-3-羟基-4(H)-喹诺酮(PQS)[23]和野油菜黄单胞菌(Xanthomonas campestris pv. campestris)中的DSF(cis-11-甲基-十二烯酸)[24]。
近年来,研究人员发现多种天然和合成的QSIs对生物膜感染具有显著的疗效。来自植物的化合物,包括香豆素衍生物、萜烯、肉桂酸和生物碱,表现出显著的抗QS活性。Mahesh等人对这些天然产品的结构-活性关系(SARs)进行了详细总结[25]。关于合成小分子作为QSIs的研究更为广泛。本综述介绍了QS系统、生物膜以及QS系统对生物膜的调节机制,重点总结了2016年至2025年间具有不同骨架的合成QSIs的结构-活性关系(SARs)和生物学评价。这些化合物包括咪唑、噻唑、吲哚、喹啉、吡啶、呋喃酮、吡唑、吡咯酮和噁唑等。本综述旨在为未来开发高效、稳定的QSIs提供见解,以解决与生物膜相关的感染和抗菌素耐药性问题。

部分摘录

群体感应系统与生物膜形成的关系

在革兰氏阴性细菌中,LuxI/LuxR系统是一种高度保守的QS机制,由luxI基因调控。luxI基因编码自诱导剂合成酶LuxI,该酶合成AHL。作为自诱导剂信号分子,AHL可以自由穿过细菌细胞膜。当种群密度较高时,AHL的浓度达到临界阈值,它会回到细菌细胞内部并与luxR基因编码的受体蛋白LuxR结合,形成复合物。

咪唑

由于其独特的杂环结构和生物活性,咪唑引起了极大的兴趣。作为五元芳香杂环化合物,咪唑环同时具有富电子特性和配位能力,可以利用这些特性通过氢键、π-π堆积或金属螯合作用来靶向细菌QS系统中的关键蛋白质,从而阻断信号分子的产生或阻止它们与受体的结合。

结论与未来展望

抗菌素耐药性已成为全球公共卫生的重大挑战。传统抗生素的广泛使用导致了多重耐药菌株的持续增长以及传统抗生素疗效的持续下降,因此迫切需要开发具有创新作用机制的抗菌策略。QSIs通过干扰细菌的QS系统,从根本上降低了细菌的致病性并延缓了耐药性的出现。

资助

本研究得到了浙江省科学技术计划(重点创新团队)(项目编号:2018R01015)、国家自然科学基金(项目编号:21877101和22177105)以及浙江省自然科学基金(项目编号:LY19B020008)的支持。

CRediT作者贡献声明

李贵文:撰写 – 审稿与编辑、撰写 – 原始草稿、可视化、验证、软件使用、数据分析、数据整理。梁康辉:数据分析。张文:软件使用。饶国武:资金获取。郑全:软件使用。

利益冲突声明

本手稿不存在利益冲突和相关披露。

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