黑曲霉的多策略工程改造以实现重组人乳铁蛋白的高水平生产

时间:2026年2月17日
来源:Food Bioscience

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本研究通过优化黑曲霉(Aspergillus niger)宿主系统,包括筛选高效启动子、信号肽及融合表达策略,敲除蛋白酶基因,多基因整合及发酵条件优化,最终实现人乳铁蛋白(HLF)产量达1027.1 mg/L,为工业化生产奠定基础。

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唐雅文|曾伟柱|陈健|张长泰|周敬文
江南大学教育部食品合成生物学工程研究中心,中国江苏省无锡市蠡湖路1800号,214122

摘要

人乳铁蛋白(HLF)属于转铁蛋白家族,是先天免疫系统的重要组成部分。传统上,乳铁蛋白主要从乳清中提取。然而,这种方法效率低且成本高。微生物细胞工厂作为一种重要的替代方案应运而生,以解决这一问题。本研究旨在通过评估两种黑曲霉(Aspergillus niger)宿主菌株以及合适的启动子和信号肽来实现HLF的表达。随后,我们确定了一个合适的葡糖淀粉酶(GlaA)融合片段来增强HLF的表达和分泌。敲除蛋白酶PepA和PepB后,减少了HLF分泌后的降解。接着,采用多基因整合策略将HLF整合到三个高表达位点和两个蛋白酶位点,最终产量达到54.3 mg/L。敲除调控菌丝极性生长的基因racA后,黑曲霉菌丝的分支频率增加,产量提高到97.7 mg/L。最后,在5升生物反应器中通过优化发酵条件,实现了1027.1 mg/L的乳铁蛋白产量。本研究采用的策略为黑曲霉中应用乳铁蛋白提供了基础。

引言

乳铁蛋白(LF)是一种非血红素铁结合糖蛋白,广泛存在于哺乳动物的外分泌液中(如牛奶、唾液和眼泪),也储存在中性粒细胞颗粒中,具有抗菌和抗炎作用,并能调节铁离子的吸收(Zhengyu Hu, 2025)。它属于转铁蛋白家族,分子量约为80 kDa(Bolesławska, Bolesławska-Król, Jakubowski, Przysławski, & Drzymała-Czyż, 2025)。LF由一条多肽链折叠成两个同源的叶状结构(N叶和C叶),每个叶状结构包含一个铁结合位点(Rodwal, Shinwari, Naizi, Sherzad, & Gopi, 2024)。LF具有多种生物功能:它可以螯合游离铁从而抑制病原微生物的增殖,直接裂解细菌细胞膜(依赖阳离子结构域),并抑制生物膜的形成(Uriel A Angulo-Zamudio, 2025)。它还可以阻止病毒附着在宿主细胞上并破坏真菌细胞膜(Gruden & Poklar Ulrih, 2021a)。LF主要从天然来源中提取,如牛乳;离子交换色谱法是主要的纯化技术,通常还包括洗脱、超滤和冻干等步骤(Chen et al., 2022)。然而,由于其效率低、工艺流程复杂和成本过高,这种方法的广泛应用受到限制(Krolitzki, Schwaminger, Pagel, Ostertag, Hinrichs, & Berensmeier, 2022)。因此,利用微生物细胞工厂合成LF受到了广泛关注。
近年来,人们采用了多种策略在各种微生物中建立表达乳铁蛋白的细胞工厂。Choi等人通过优化密码子、启动子和发酵过程,在Pichia pastoris中实现了约99.8 mg/L的LF产量(Choi et al., 2008)。Ward等人将内源性GlaA信号肽与表达盒融合,以提高mRNA稳定性并促进蛋白质折叠和定位,并结合多轮菌株突变,实现了2 g/L的产量(Pauline P. Ward, 1995)。Lv等人通过双启动子调控、信号肽筛选和内质网-高尔基体运输优化,在P. pastoris中将LF的摇瓶产量提高到654.5 mg/L;进一步优化3升发酵罐中的甲醇诱导条件后,产量超过5.38 g/L(Lv et al., 2023)。然而,LF对微生物的细胞毒性导致异源表达不稳定。除了广谱抗菌活性外,LF还会杀死酵母细胞(Abad, Pemán, Pérez, Grasa, & Sánchez, 2024)。它还能诱导Candida的凋亡样死亡,导致线粒体损伤、细胞质中细胞色素c的释放以及核染色质的浓缩。此外,LF会破坏酵母细胞膜,其与两性霉素B的协同作用可增强对真菌的杀灭效果(Kenya E. Fernandes, 2020)。
丝状真菌对LF具有很高的耐受性(Kenya E. Fernandes, 2020),而A. niger是丝状真菌中最常用的蛋白质表达宿主之一。此外,A. niger在蛋白质分泌方面优于其他微生物物种。它能够分泌多种蛋白质,同时具备高效的折叠和翻译后修饰能力、低成本的培养要求以及易于诱导的特点(Madhavan et al., 2022)。这种出色的蛋白质分泌能力使A. niger成为生产内源性和重组酶的理想载体(Q. Li et al., 2022)。因此,人们投入了大量努力在A. niger中开发高效表达系统,以生产同源和异源蛋白质(C. Li, J. Zhou, G. Du, J. Chen, S. Takahashi, & S. Liu, 2020)。此外,已经为几种A. niger物种建立了成熟的工业发酵系统。然而,丝状真菌中异源蛋白质的生产仍远未达到最佳水平,仍有很大的改进和优化潜力(Dujuan Liu, 2023)。因此,克服异源蛋白质产量的瓶颈是一个关键挑战(Q. Wang, Zhong, & Xiao, 2020)。作为解决这一问题的案例研究,我们报告了在A. niger中针对性优化LF表达的方法,这对于其高效和可扩展的生产至关重要。
在本研究中,我们在A. niger中实现了人乳铁蛋白(HLF)的功能表达。通过综合筛选表达宿主、启动子和信号肽,提高了该菌株的蛋白质分泌能力,最终实现了3.78 μg/L的HLF产量。随后,与内源性高分泌蛋白葡糖淀粉酶(GlaA)融合显著增强了HLF的表达能力,测试融合蛋白的长度提高了LF表达的稳定性。此外,敲除蛋白酶显著减少了分泌后的HLF降解,多拷贝整合到基因组中提高了HLF的表达能力。同时,改变菌丝形态也提高了HLF的分泌能力。最终,通过优化分批发酵过程,HLF的产量达到了1027.1 mg/L。这些结果为未来在A. niger中异源表达HLF的研究提供了坚实的基础。

部分摘录

质粒、菌株和培养条件

本研究构建的菌株和质粒详见补充表S1和S2。Escherichia coli DH5α菌株用于质粒的构建,而Aspergillus niger AG11-PK菌株作为HLF表达的宿主。重组E. coli菌株在Luria–Bertani(LB)液体培养基(10 g/L色氨酸、5 g/L酵母提取物和10 g/L NaCl)中于37°C培养。A. niger菌株的摇瓶培养

筛选宿主、启动子和信号肽以实现HLF表达

考虑到HLF的天然信号肽可能在A. niger中的分泌表达过程中无法有效识别和转运蛋白质,我们用内源性信号肽SPglaA替换了其天然信号肽(前24个氨基酸,参考LF的晶体结构),并使用强内源性启动子PglaA来驱动表达。比较了两种A. niger菌株A. niger AG11和A. niger CBS513.88

讨论

乳铁蛋白因其强大的抗菌活性和作为食品添加剂的价值而受到广泛关注。建立微生物细胞工厂进行异源生产HLF可以克服畜牧业的环境限制,并解决HLF提取相关的问题。同时,异源表达的LF在纯化方面更具成本效益。然而,微生物合成LF仍面临挑战,主要是由于其抗菌性

CRediT作者贡献声明

周敬文:撰写 – 审稿与编辑、监督、项目管理、资金获取。张长泰:撰写 – 初稿、验证、监督、方法学、研究、资金获取、概念化。曾伟柱:方法学、研究。陈健:监督、项目管理。唐雅文:撰写 – 初稿、可视化、验证、方法学、研究、数据管理

未引用参考文献

Dinghui Zuo等人,2025;Dujuan Liu和Ronald,2023;Kenya等人,2020;Li等人,2020;Li等人,2020;Li等人,2023;Xiao等人,2023;Pauline等人,1995;Uriel A Angulo-Zamudio等人,2025;Zhengyu Hu和Lingyu Wei,2025。

注释

作者声明没有竞争财务利益。

利益冲突声明

☒ 作者是该期刊的编委会成员/主编/副主编/特邀编辑,未参与本文的审稿或发表决定。
☐ 作者声明以下可能被视为潜在利益冲突的财务利益/个人关系:“作为<主编>,未参与本文的同行评审,也未获取任何关于同行评审的信息。”

致谢

本工作得到了江苏省农业科学技术重大项目、江苏省基础研究计划(BK20251622)、江苏省优秀博士后人才计划2025ZB704)以及江南大学食品科学与技术国家重点实验室(SKLF-ZZB-202310)的支持。

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