新型靶向Keap1的疏水标签(HyT)降解剂的发现:这些降解剂具备强大的Nrf2激活活性

时间:2026年2月19日
来源:European Journal of Medicinal Chemistry

编辑推荐:

靶向蛋白降解策略调控氧化应激相关疾病的研究进展 | 分子内双途径降解机制 | Keap1-Nrf2轴调控 | 炎症性肠病治疗候选物 | 水溶性标签靶向技术

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李志英|刘明杰|赵海阳|张伟|王龙|张燕|徐佳欣|沈涛|任东梅|王晓宁
化学生物学重点实验室(教育部),山东大学齐鲁医学院药学院,中国济南250012

摘要

靶向蛋白质降解已成为调节氧化还原稳态的强大策略。基于CRBN的PROTACs通过靶向Keap1成功促进了Nrf2的激活,但其翻译潜力受到CRBN相关耐药机制和较大分子大小的限制。基于共价Keap1配体CDDO设计了两系列疏水标签连接降解剂(HyTTDs)。在多种细胞系中评估了降解效率,最终确定NBE5(一种含有norbornene标签的降解剂)是最有效的化合物。NBE5能有效降解Keap1并激活Nrf2的抗氧化反应。机制研究表明,其降解过程涉及泛素-蛋白酶体系统和自噬-溶酶体两条途径。我们的发现不仅证实了HyTTD作为Keap1降解策略的可行性,还表明NBE5是治疗与氧化还原相关的疾病(如炎症性肠病)的有希望的候选药物。

引言

转录因子核因子红细胞2相关因子2(Nrf2)及其主要负调节因子Cullin3-E3连接酶适配器Kelch样ECH相关蛋白1(Keap1)是调节细胞氧化还原、代谢和蛋白质稳态的关键因素[1]、[2]。现在普遍认为,Nrf2的激活可对许多以氧化应激或炎症为病理特征的疾病提供全面的细胞保护,包括代谢性疾病、炎症性疾病和自身免疫性疾病[3]。
作为富含半胱氨酸的蛋白质,Keap1在生理条件下作为氧化剂和亲电试剂的传感器,直接与Nrf2结合并使其被蛋白酶体降解。在氧化应激或暴露于某些亲电试剂时,Keap1的特定半胱氨酸会被氧化,导致其构象变化并失去与Nrf2结合的能力。随后,Nrf2被释放并激活[4]。因此,修饰Keap1的半胱氨酸或抑制Keap1-Nrf2的蛋白质-蛋白质相互作用都可以激活Nrf2,这分别促进了共价Keap1修饰剂和非共价Keap1-Nrf2 PPI抑制剂的发现[5]、[6]。作为一种新兴的药物发现和治疗方式,靶向蛋白质降解(TPD)因其强大的蛋白质降解能力而受到广泛关注,尤其是对于那些难以用传统小分子靶向的蛋白质[7]、[8]。近年来,已经开发了几种以Keap1为靶点(POI)的蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)(图1),这些PROTACs均通过招募E3连接酶cereblon(CRBN)在不同细胞系中表现出强大的Keap1降解和Nrf2通路激活作用[9]、[10]、[11]、[12]。
作为一种替代的TPD方法,疏水标签(HyT)连接降解剂(HyTTDs)相比PROTACs具有多个优势,如较低的分子量和较低的因特定E3连接酶突变而导致耐药性的风险[13]。与PROTACs类似,HyTTDs也被认为是双功能分子,由一个与靶蛋白结合的配体和一个模拟蛋白质错误折叠的疏水标签组成。HyTTD介导的靶蛋白降解机制较为复杂,尚未完全明了。目前提出两种主要途径:一种是HyT使靶蛋白不稳定,从而招募内源性伴侣蛋白到错误折叠的靶蛋白上,然后触发蛋白酶体降解;另一种是伴侣蛋白可能直接识别HyT,进而介导带有HyT标签的靶蛋白的蛋白酶体降解[14]、[15]、[16]、[17]。
在这项研究中,我们设计并合成了两系列针对Keap1的HyTTDs,使用了典型的金刚烷类和新型的norbornene作为HyT,其中一些降解剂表现出强烈的Keap1降解活性。最有效的HyTTDNBE5被选中进行体外体内验证其Keap1降解机制和Nrf2激活能力。我们的发现表明NBE5可能是治疗与氧化还原失衡相关的炎症性肠病(IBD)的新候选药物,同时也是一种用于研究Keap1降解的化学生物学工具。

章节片段

针对Keap1的HyTTDs的设计、合成和构效关系

为了设计针对Keap1的HyTTDs,需要将Keap1结合剂通过不同的连接器与HyT连接起来。作为典型的Keap1共价修饰剂,氰酮三萜类化合物bardoxolone(CDDO)已被证明能与Keap1的Cys151形成共价加合物(PDB ID:4CXT)[18]。因此,选择CDDO作为HyTTDs的Keap1结合配体。对于HyT,选择了两种不同的标签以确保降解效率。第一种是典型的HyT

讨论与结论

Nrf2已成为蛋白质稳态、代谢稳定性和铁稳态的主要调节因子[35]。通过抑制Keap1来激活Nrf2是治疗由氧化还原失衡引起的慢性疾病的有前景的方法。作为靶向蛋白质降解的典型技术,PROTAC通过降解蛋白质提供了新的药物发现途径,并已在体外体内实现了有效的Nrf2激活[36]。然而,这些异双功能PROTACs

化学

所有试剂和溶剂均从商业供应商处购买,除非另有说明,否则无需进一步纯化。反应进程通过薄层色谱(TLC,青岛海阳化工有限公司)进行监测,并在紫外光(254和365 nm)下观察。所有化合物均通过硅胶柱层析(200−300目)进行纯化。核磁共振光谱在Bruker Avance DRX-600或400光谱仪上记录,所用溶剂为指定溶剂。

CRediT作者贡献声明

张燕:方法学研究。王龙:数据管理。张伟:数据管理。赵海阳:方法学研究、数据分析、数据管理。沈涛:撰写、审稿与编辑、验证、监督。徐佳欣:数据分析、数据管理。任东梅:撰写、审稿与编辑、项目管理。刘明杰:方法学研究、数据分析。李志英:撰写、初稿撰写、方法学研究、数据分析。王晓宁:撰写、审稿与编辑

数据获取

数据可应要求提供。

利益冲突声明

作者声明不存在任何利益冲突。

致谢

感谢国家自然科学基金(编号:22377066)和山东省重点研发计划(编号:2025CXPT146和2025CXGC010617)的财政支持。

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