中国广西壮族自治区新报告HIV-1重组型CRF120_0107与CRF149_01B的出现:分子证据与公共卫生挑战

时间:2026年5月16日
来源:Biosafety and Health

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广西壮族自治区位于中国西南与南部交界区域,是人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1, HIV-1)高流行区,明确当地流行毒株的基因组特征与传播动态对疫情防控至关重要。研究人员旨在分析广西新报告的重组型CRF

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广西壮族自治区位于中国西南与南部交界区域,是人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1, HIV-1)高流行区,明确当地流行毒株的基因组特征与传播动态对疫情防控至关重要。研究人员旨在分析广西新报告的重组型CRF120_0107与CRF149_01B的近全长基因组(near-full-length genomic, NFLG)特征、重组模式及跨省传播关系。研究从2019–2024年南宁与百色采集的508份样本中筛选出6条长度为8483–8732 bp的HIV-1近全长基因组序列进行系统分析。系统进化分析显示,样本GX.NN55.HET.2024、GX.NN152.MSM.2019与GX.NN130.HET.2024与广东省2022年10月报告的CRF120_0107毒株聚于同一分支;重组断点分析表明CRF120_0107由CRF07_BC与CRF01_AE重组形成。样本GX.BS401.HET.2024、GX.NN59.HET.2024与GX.NN118.HET.2024与云南省2025年4月报告的CRF149_01B毒株高度同源,后者由CRF55_01B与B亚型重组而成。亚区系统进化分析进一步证实各片段均与对应亚型参考株聚类(自举值>90%)。这是广西首次基于6条序列鉴定到CRF120_0107与CRF149_01B,提示HIV-1重组毒株存在跨省传播,凸显分子监测与针对性干预对阻断病毒扩散的重要性。
该研究发表于《Biosafety and Health》,围绕广西HIV-1流行株的演化与传播展开。广西是中国HIV-1疫情最严重的地区之一,截至2023年底累计报告约18.9万例艾滋病病例、7.4万例死亡,且毒株与广东、云南及越南存在传播关联,但既往研究多局限于gag与pol区,缺乏近全长基因组的系统解析,难以全面揭示重组与演化规律。在此背景下,研究人员针对2019–2024年南宁与百色508份感染者外周血样本,筛选并解析6条近全长基因组序列,首次在广西发现CRF120_0107与CRF149_01B两种新型循环重组型,证实其与广东、云南流行株的高度同源性,为跨省传播网络提供了直接分子证据,对区域联防联控具有重要警示意义。
研究人员采用的关键技术方法包括:基于中国HIV基因组序列数据库平台完成初始亚型分型,对未定型样本利用洛杉矶HIV数据库重组识别程序(RIP)初步判定重组模式;采用巢式PCR扩增HIV-1近全长基因组,通过二代测序获得一致性序列;利用HIVAlign工具完成序列比对后,以MEGA X软件构建邻接(neighbor-joining, NJ)系统进化树(Kimura 2-参数模型+Gamma分布率异质性校正,1000次自举检验);通过SimPlot与跳跃剖面隐马尔可夫模型(jpHMM-HIV)工具解析重组断点,并基于断点提取亚区片段构建亚区进化树验证重组结构。
研究结果分为三部分。3.1节HIV-1近全长基因组的系统进化分析显示,6例感染者均为男性,年龄25–61岁,以异性传播为主,无直接流行病学关联;3条南宁样本与广东CRF120_0107聚为独立分支(自举值>90%),3条南宁与百色样本与云南CRF149_01B聚为另一分支(自举值>90%),证实两类毒株已进入广西流行。3.2节与CRF120_0107密切相关的广西HIV-1重组毒株分析表明,3条序列均呈现与广东CRF120_0107一致的重组模式:CRF07_BC骨架中插入两段CRF01_AE片段,断点位置分别为776–5798 nt(CRF07_BC)、5799–6188 nt(CRF01_AE)、6189–8362 nt(CRF07_BC)、8363–9555 nt(CRF01_AE);亚区进化树验证各片段分别与对应亚型参考株聚类(自举值>90%),确证广西首次检出CRF120_0107。3.3节与CRF149_01B密切相关的广西HIV-1重组毒株分析显示,3条广西序列与云南CRF149_01B具有高度相似的嵌合结构:CRF55_01B骨架的pol区插入一段B亚型片段,断点为776–4472 nt(CRF55_01B)、4473–4782 nt(B亚型)、4783–9555 nt(CRF55_01B);亚区进化树验证片段亚型归属(自举值>90%),确认为典型的CRF55_01B/B重组型。
讨论部分指出,广西地处西南与华南连接枢纽,两类新型重组型的出现反映病毒演化复杂性提升,跨省传播持续活跃。CRF120_0107由国内优势流行株CRF01_AE与CRF07_BC重组而成,已在南宁男男性行为者(men who have sex with men, MSM)与异性传播人群中同时检出,提示可能从核心高危人群向普通人群扩散,叠加粤桂人员流动频繁,需加强高危人群分子监测。CRF149_01B由CRF55_01B与B亚型重组而成,本次在异性传播人群中检出,结合其母株CRF55_01B在国内沿交通干线快速扩散的特征,提示异性传播可能成为该毒株跨区域蔓延的重要途径。研究局限性在于样本量较小、仅覆盖南宁与百色、时间跨度不连续,未来需扩大样本量与地理范围、开展连续采样验证。
结论部分强调,基于南宁与百色的6条序列,研究证实广西存在活跃的HIV-1跨省传播网络,区域防控面临严峻挑战;强化高危人群分子监测与早期干预、及时识别重组毒株与跨省传播链,是降低病毒扩散风险、保障公共卫生安全的核心举措。

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