CD33/Fab-10C8复合物晶体结构阐明了HBV免疫抑制中的抗体拮抗机制

时间:2026年5月30日
来源:Journal of Biomedical Science

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背景:乙型肝炎病毒(HBV)感染通过免疫逃避策略持续存在,包括HBsAg上的α2,6-连接唾液酸聚糖与抑制性受体CD33(Siglec-3)结合。此相互作用诱导ITIM磷酸化和SHP-1/2(含SH2结构域的蛋白酪氨酸磷酸酶1/2)募集,抑制髓系细胞活化。单克

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背景:乙型肝炎病毒(HBV)感染通过免疫逃避策略持续存在,包括HBsAg上的α2,6-连接唾液酸聚糖与抑制性受体CD33(Siglec-3)结合。此相互作用诱导ITIM磷酸化和SHP-1/2(含SH2结构域的蛋白酪氨酸磷酸酶1/2)募集,抑制髓系细胞活化。单克隆抗体10C8被鉴定为CD33的强效拮抗剂,但其抑制活性的结构基础尚不清楚。方法:研究人员解析了人CD33胞外域(CD33-ECD)与10C8抗体Fab片段(Fab-10C8)复合物的3.2 Å晶体结构。通过尺寸排阻色谱和分析超速离心(AUC)在溶液中验证了复合物的化学计量比和组装状态。通过与apo CD33的结构比较评估了Fab诱导的潜在构象变化,并进行了埋藏表面积分析以表征结合界面。结果:结构显示该复合物为2:2化学计量比,包含两个CD33-ECD分子和两个Fab-10C8片段,与AUC确定的157 kDa分子量一致。每个Fab通过广泛的互补决定区(CDR)相互作用结合V-set结构域,埋藏约612 Å2的表面积,而Fab间的相互作用稳定了CD33-ECD的紧凑二聚体排列。该几何结构与松弛的apo状态显著不同,二聚体角度减少了约21°。抗体结合表位与经典的唾液酸结合槽相邻但不重叠,导致空间位阻,阻止了HBsAg的结合。结合潜在的Fab诱导的胞外域压缩,这种构象限制了CD33聚集,并可能阻止SHP-1/2的募集,为10C8的拮抗活性提供了机制解释。结论:本研究提供了抗体介导抑制CD33的结构见解。通过将CD33锁定在空间位阻、信号传导无反应的构象,10C8有效逆转了HBV诱导的免疫抑制,从而恢复了宿主的抗病毒活性。这些发现为针对慢性病毒感染和其他免疫调节性疾病的Siglec靶向免疫疗法的合理设计建立了结构框架。
乙型肝炎病毒(HBV)感染是重大的全球健康问题,常导致慢性HBV(CHB)感染患者进展为肝硬化和肝细胞癌(HCC)。CHB的特征是四个不同的临床阶段,每个阶段的定义基于不同程度的肝脏炎症、病毒复制和免疫反应。尽管CHB患者能产生针对HBcAg(HBV核心抗原)和HBeAg(HBV e抗原)的抗体,但在感染的所有阶段始终无法产生抗HBsAg(HBV表面抗原)抗体。这一现象与血清中持续存在的HBsAg和HBV DNA密切相关,两者均源于感染肝细胞内共价闭合环状DNA(cccDNA)的活性。虽然理想的治疗目标是清除HBsAg、诱导抗HBsAg抗体并根除cccDNA,但目前获批的抗病毒疗法包括核苷类似物、免疫检查点抑制剂和治疗性疫苗,在实现功能性治愈方面疗效有限。仅少数患者在使用核苷类似物、抗PD-1单克隆抗体(mAbs)或治疗性HBV疫苗治疗后表现出HBsAg的持续减少。值得注意的是,靶向PD-1/PD-L1通路的免疫检查点阻断可能在合并CHB的癌症患者中重新激活HBV,突显了非特异性T细胞介导的免疫激活作为治疗策略的局限性。这些发现凸显了探索CHB替代免疫治疗靶点的迫切需求。一个潜在的靶点是HBsAg,其在Asn-146位点携带的双分支α2,6-连接唾液酸聚糖在结构上与内源性人类α2,6-连接唾液酸聚糖相同。已知唾液酸聚糖通过与唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素(SIGLECs,免疫抑制性受体家族)结合来调节免疫反应。这些受体的胞质区含有基于免疫受体酪氨酸的抑制基序(ITIM),可募集SHP-1和SHP-2磷酸酶以减弱细胞活化。抑制性SIGLECs的信号传导机制与其他含有ITIM的检查点受体(如PD-1和CTLA-4)相似,后者已成功被癌症免疫治疗中的拮抗性mAbs靶向。SIGLEC编码基因的多态性与多种人类疾病相关,进一步支持了其免疫调节重要性。例如,SIGLEC3(CD33)的单核苷酸多态性(SNPs)与阿尔茨海默病相关,而SIGLEC9和SIGLEC8的变异则分别与慢性阻塞性肺疾病(COPD)和支气管哮喘相关。CD33,也称为SIGLEC-3,是一种跨膜受体,主要表达于髓系细胞,包括单核细胞、巨噬细胞和髓系来源的抑制细胞。结构上,CD33是一种单次跨膜I型膜蛋白,包含一个具有两个免疫球蛋白样结构域(V-set和C2-set)的胞外区(ECD)、一个跨膜α螺旋和一个含有两个保守ITIM的胞质尾部。N端V-set结构域介导唾液酸识别,而C2-set结构域可能稳定配体结合并促进蛋白-蛋白相互作用。配体结合诱导ITIM基序磷酸化,募集SHP-1和SHP-2磷酸酶,启动涉及细胞增殖、分化和免疫抑制的下游抑制性信号级联。CD33也经历N-连接糖基化,这可能影响其配体亲和力、细胞运输和稳定性。N端V-set结构域通过一个以保守的Arg119为中心的位点介导唾液酸识别,该位点与唾液酸羧酸盐形成盐桥。该相互作用进一步由一个芳香族簇(Phe21、His45和Tyr127)和STKYSYK基序(残基124-130)稳定,这些共同提供了该受体对α2,6-连接唾液酸聚糖偏好的结构基础。近期研究已确定CD33是被HBV利用以抑制宿主免疫的免疫检查点受体。具体而言,HBsAg上的α2,6-双分支唾液酸聚糖直接与CD33的唾液酸识别结构域结合,触发CD33 ITIM的下游磷酸化并募集SHP-1/-2,从而促进免疫耐受。在研究人员先前的研究中,证明了一种CD33阻断性单克隆抗体10C8破坏了这种相互作用,并恢复了来自CHB患者外周血单个核细胞(PBMCs)的细胞因子产生。为了更好地理解这种治疗机制的分子基础,研究人员旨在确定CD33/10C8复合物的晶体结构。结构阐明将揭示10C8如何与HBV竞争结合CD33并在空间上阻碍HBsAg重新结合受体。这些见解可以促进抗CD33抗体的合理设计,并支持针对CHB及其向HCC进展的新型免疫疗法的开发。为完成这项研究,研究人员主要采用了以下关键技术方法:通过X射线晶体学解析了人CD33胞外域与Fab-10C8复合物在3.2 Å分辨率下的晶体结构;利用分析超速离心(AUC)和尺寸排阻色谱验证了复合物在溶液中的2:2化学计量比和寡聚状态;通过表面等离子共振(SPR)测定了抗体与抗原的结合动力学;并采用了负染色电子显微镜观察复合物在溶液中的整体构象。蛋白质表达和纯化使用了Expi293F™ GnTI-和ExpiCHO-S™细胞系。研究结果主要分为以下几个部分:在“CD33-ECD/Fab-10C8复合物的形成与表征”部分,研究人员通过SPR证实了10C8与人CD33胞外域具有高亲和力结合(KD为52.5 nM)。尺寸排阻色谱和分析超速离心(AUC)实验表明,当CD33-ECD与Fab-10C8混合时,形成了一个稳定的、表观分子量约为132-157 kDa的复合物,对应2:2的化学计量比,这与溶液中的单体CD33-ECD行为不同,提示Fab结合可能稳定了CD33二聚体。在“CD33-ECD/Fab-10C8复合物的整体结构”部分,晶体结构显示不对称单元包含两个CD33-ECD分子和两个Fab-10C8片段,形成伪二重对称的架构。每个CD33-ECD分子通过其V-set结构域被一个独立的Fab-10C8抗体识别,两个Fab分子向外延伸呈V形排列,且Fab重链可变区(VH)之间存在直接相互作用。在“CD33-ECD通过V-set表位与Fab-10C8抗体形成稳定复合物”部分,结构分析表明,每个Fab分子主要通过轻链和重链的CDR1和CDR3环识别CD33 V-set结构域上一个确定的表位,该表位主要由βC和βD链及其邻近环构成。结合界面富含芳香族侧链(尤其是酪氨酸),提供广泛的埋藏表面积和多种非共价相互作用(如芳香族堆积和氢键)。两个Fab分子与CD33-ECD的结合模式几乎相同。在“Fab结合诱导CD33二聚体发生构象转变”部分,将Fab结合的CD33结构与先前报道的apo CD33结构(PDB: 5IHB)进行比较发现,尽管V-set结构域叠合良好,但C2-set结构域发生了明显的内向位移(RMSD = 2.2 Å),导致胞外域压缩和结构域间夹角变窄。整体而言,Fab结合使CD33二聚体的角度减少了约21°。这种构象变化由广泛的Fab-Fab相互作用驱动,其埋藏表面积(约404.6 Å2)相当可观。讨论部分总结并深入探讨了这些结构发现的意义。研究人员提出10C8的拮抗机制通过两种协同模式运作。首先,尽管10C8的表位不直接重叠于经典的唾液酸结合槽,但其Fab片段的巨大体积(约50 kDa)在CD33 V-set结构域的关键区域(B′-C环和F-G环区域)施加了空间位阻,物理性地阻止了大型HBsAg修饰的病毒颗粒接近CD33表面。这得到了先前基于患者样本的竞争性结合实验和FRET分析的支持。其次,研究提示CD33信号传导需要配体诱导的聚集而非简单的二聚化。由10C8稳定的2:2复合物采用刚性且紧凑的几何结构,这种结构施加了双重限制:既阻止了进一步侧向组装成高级聚集体,也限制了ITIM可及性和SHP-1/2募集所需的构象灵活性。通过将CD33稳定在这种特定的2:2排列中,10C8有效地将CD33捕获在信号传导无能力的状态。这些结构约束为观察到的免疫细胞活性(包括增强的抗原呈递和细胞因子分泌)的恢复提供了解释。研究还指出,人CD33与小鼠CD33在抑制功能上存在差异,强调了使用人CD33进行结构和功能研究的重要性。结论部分指出,本研究首次提供了抗体介导CD33拮抗的高分辨率结构基础。通过解析CD33-ECD/Fab-10C8复合物,研究表明抗体结合稳定了一种紧凑的二聚体构象,该构象在空间上阻断病毒聚糖结合,并限制了抑制性信号传导所需的构象灵活性。这些发现建立了一个机制框架,说明靶向抗体如何缓解HBV诱导的免疫抑制,并凸显CD33作为慢性乙型肝炎治疗干预的可靶向检查点。

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