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沉迷大数据,NGS挑战重重[心得点评]
在这个时代,各行各业都对大数据痴迷,基因组学也不例外。也许,这源于一种与生俱来的需求,我们渴望了解遗传组成如何控制人类生活的方方面面。近日,Jeffrey S. Buguliskis博士在GEN网站上讨论了大数据带来的挑战。
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靶向测序:表达谱分析的新选择
靶向测序让研究人员能够最大限度利用他们的测序运行,将精力集中在那些感兴趣的序列上。例如,Moreno正在测试一种109个基因的集合,其中包括他之前鉴定出的24个基因。为了获得那些数据,Moreno利用Cellular Research的Precise Molecular Indexing分析,来捕获样本中的目标序列。
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Oxford Nanopore这次又发布了什么?
近日,Oxford Nanopore公司在伦敦举行了London Calling用户会议,发布了一些新产品。其中,最受期待的还是首席技术官Clive Brown的报告。当然,他也没让大家失望。与会者称这次发布会是“改变游戏规则的”,形容当时的气氛就像2007年苹果发布iPhone一样。这会不会有些夸张?让我们来看这次会议的一些亮点。
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遗传病家系的高通量测序:您需要了解的一些事
高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。
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癌症研究中的数据挖掘工具[选购宝典]
对于癌症研究人员而言,采集数据仅仅是个开始;找到引起或促进疾病的基因才是“压力山大”。关键的挑战在于找出特定的突变,它们引发正常细胞癌变。此时此刻,大多数的癌症驱动突变都隐藏在遗传信息的海洋之中。如何大海捞针?这些新的计算和生物信息学工具也许能帮助你。
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如何理解PacBio的准确度?
第三代测序中的PacBio单分子实时(Single Molecule Real-Time, SMRT)DNA测序可以实现超过99.999%(QV50)的高度精确测序,且不受DNA序列中GC和AT含量的影响,平均读长可达10-15kb(*长>40kb),这是如何实现的呢?这是因为SMRT技术在与DNA测序精确度相关的三个方面均有独到之处……
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华大基因发布基因组数据分析云计算平台BGI Online
2015年4月20日,全球最大的基因组学研发机构华大基因在全球发布一款强大且具高安全性的基因组数据分析云计算平台服务产品 -- BGI Online。BGI Online为新一代测序项目的管理提供一站式解决方案,让用户可以轻松创建和运行复杂的数据分析流程。
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追赶微生物组的热潮,你准备好了吗?(下)[创新技巧]
有了新型的测序仪,人们开始着手研究健康的人体中生活着哪些类型的微生物。当然,同样是健康的人,你和我的微生物群落就大不相同,就算同一个人,不同部位的微生物也大相径庭。这种差异性使得人们难以描述“正常的”微生物组。于是,研究人员从数百名个体中采样,提取信息。他们关注各个部位,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠道,以及泌尿生殖道。
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追赶微生物组的热潮,你准备好了吗?(上)[创新技巧]
有了新型的测序仪,人们开始着手研究健康的人体中生活着哪些类型的微生物。当然,同样是健康的人,你和我的微生物群落就大不相同,就算同一个人,不同部位的微生物也大相径庭。这种差异性使得人们难以描述“正常的”微生物组。于是,研究人员从数百名个体中采样,提取信息。他们关注各个部位,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠道,以及泌尿生殖道。
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赛默飞发布Ion Torrent技术更新和新产品预览
赛默飞世尔科技于上周在佛洛里达州马可岛举办的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了Ion Torrent测序技术的最新进展情况,充分展示赛默飞在研发新一代测序业务上的努力和成果,从而进一步表明其致力于将新技术应用于临床研究的决心。