-
三篇文章介绍RNA-Seq数据分析的新工具[新品推荐]
新年伊始,RNA-Seq的数据分析方法就如雨后春笋般涌现。在最近的一个月内,三篇介绍RNA-Seq数据分析新方法的文章发表在Nature集团旗下的刊物上,其中一篇发表在《Nature Methods》上,另外两篇都发表在《Nature Biotechnology》上。
-
Illumina推出HLA分型的新模式[创新技巧]
人类白细胞抗原(HLA)区域为各种疾病和状况提供了重要的见解。不幸的是,由于此区域的高度多态性,HLA分型存在不小的挑战。近日,Illumina公司宣布推出TruSight HLA,这个方案通过测序11个HLA基因而全面查看HLA区域,带来准确的HLA分型。
-
新一代测序2015更新:小鲜肉与大叔(下)
小鲜肉常有,而大叔不常有。经过岁月的洗礼,大叔褪去了小鲜肉的稚嫩与青涩,愈发成熟,更显魅力。Illumina、Pacific Biosystems便是这样的帅大叔。他们上市多年,在市场上占据一定的地位,应用也日趋广泛。
-
新一代测序2015更新:小鲜肉与大叔(上)
从2005年454公司首推新一代测序仪以来,转眼已是十年光阴。在这十年间,许多新平台问世,有的昙花一现,有的则从小鲜肉变成了帅大叔。当然,这是一个小鲜肉辈出的时代。新的平台仍在不断上市,带来进步,带来希望。
-
现在有机会试用纳米孔测序仪
英国Oxford Nanopore Technologies公司近日宣布,它重新开放了MinION测序仪的早期试用计划,希望吸纳更多用户来参与。同时,越来越多的计划参与者开始展示和发表他们的结果。
-
让NGS的文库制备一步到位[新品推荐]
在第16届基因组生物学技术进展大会(AGBT)召开前夕,Illumina公司宣布推出NeoPrep文库制备系统。这是一款数字微流体平台,能够大大简化新一代测序(NGS)的文库制备,带来测序即用的高质量文库。
-
单细胞转录组学的研究工具盘点[新品推荐]
近几年,研究人员已经开发出一些工具,能够将几个组学学科的规模降至单细胞水平,包括转录组学。一些方法是基于新一代DNA测序,另一些则依靠显微镜或流式细胞仪。不过,这些方法都发现,细胞群体看似均一,其实是高度异质性的。
-
有一个地方,测序始终难以覆盖[创新技巧]
也许你并不知道,人类基因组并没有测序完全。一些重复区域和难测序的序列始终犹抱琵琶半遮面。同时,遗传变异也是个挑战。在新一期的《BioTechniques》杂志中,Nathan Blow介绍了一些新的技术和方法,能帮助人们绘制这些难以读取的DNA片段。
-
来一次说做就做的测序
虽然高通量新一代测序总体成本大幅下降,但想在二代测序平台上做出好的研究成果也并不便宜,尤其是在样本量大的时候。另外,如何解读海量测序数据的生物学意义也是一个很大的问题。可以说,基因组测序还远远没到想做就做的地步。
-
Illumina推出四款新的测序系统[新品推荐]
一年一度的摩根大通保健大会(JP Morgan Healthcare Conference)于1月12日在旧金山开幕。Illumina的CEO Jay Flatley昨日登上演讲台,宣布推出四款新的测序系统。这四款新平台分别是HiSeq X Five系统,HiSeq 3000和HiSeq 4000系统,以及NextSeq 550系统。