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  • 三氧核糖核酸修饰的三核苷酸帽类似物的合成、整合及翻译特性

    mRNA 5'帽修饰通过引入TNA结构可显著提升翻译效率并保持生物稳定性,同时不引起明显炎症因子释放。研究发现TNA修饰在首核苷酸位置时能增强翻译活性,而在m7G位置则可能影响eIF4E结合。经分子动力学模拟证实,TNA修饰的帽结构在eIF4E结合 pocket中具有良好适应性。该修饰技术已成功应用于SpCas9基因编辑系统的mRNA设计,为下一代疫苗和基因治疗提供了高效稳定的递送方案。

    来源:ACS Omega

    时间:2025-10-28

  • 基于生物传感器的恶臭假单胞菌工程改造揭示最大化异戊二烯醇生产的关键细胞过程

    本刊推荐:针对短链醇类生物燃料开发中高通量筛选与生产瓶颈的难题,研究人员开展了基于生物传感器的恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)菌株工程研究。他们发现并表征了一条非典型信号通路,揭示了一种混合组氨酸激酶(HHK)与醇脱氢酶(YiaY)的功能性物理复合体,并通过异源二聚化调节其活性。利用该生物传感器进行CRISPRi文库筛选,鉴定出关键的宿主限制因素。通过迭代组合菌株工程,使异戊二烯醇(isoprenol)滴度提高36倍至约900 mg/L。整合组学分析表明,代谢重编程转向氨基酸分解代谢是这一改进的关键。该模块化工作流程为优化复杂异源途径和揭示宿主生物学新机制提供了强大策略。

    来源:SCIENCE ADVANCES

    时间:2025-10-27

  • 综述:通过先进递送系统用于体内靶向治疗的工程化RNA器件

    本综述系统阐述了工程化RNA器件(如toehold开关、miRNA分子开关、ADAR传感器等)与先进递送系统(如LNP、AAV、SORT LNP等)相结合,在精准医疗领域的最新进展。文章重点探讨了这些器件如何通过识别疾病特异性标志物(如miRNA、特定转录本)实现细胞水平精准基因调控,并分析了其在疾病诊断和治疗中的应用潜力、当前局限性及未来发展方向,为开发可编程生物平台提供了重要见解。

    来源:Aggregate

    时间:2025-10-27

  • 利用CASX2Max增强基因组CCR5的切割效果

    CRISPR/Cas系统通过gRNA与Cas蛋白结合实现基因编辑,其中CasX2(PlmCas12e)因较小的尺寸、不同的PAM序列(TTCN)和5'过hang断裂特性备受关注。本文比较了CasX2与改良版CasX2Max在CCR5基因编辑中的效率,发现CasX2Max通过三个氨基酸突变(T26R、K610R、K808R)显著增强基因组切割能力,其机制涉及增强sgRNA-DNA结合稳定性及优化DNA折叠结构,使MMEJ修复介导的16-32bp缺失更高效。实验通过纳米孔测序验证了结构变化与功能提升的关联性,并证实CasX2Max与SaCas9相当。

    来源:RNA Biology

    时间:2025-10-27

  • MAPK3 在急性髓系白血病中调节 SKAP2 的增强子-启动子相互作用

    调控急性髓系白血病(AML)中基因表达的关键机制是CTCF介导的染色质相互作用,MAPK3通过影响CTCF结合上游SKAP2区域的增强子-启动子染色质互作发挥作用。研究采用IP-MS鉴定CTCF结合蛋白,发现MAPK3是重要结合蛋白;通过ChIP-seq验证MAPK3激活剂/抑制剂处理后CTCF在远端非编码区域的结合变化;3C-qPCR证实MAPK3活性调控CTCF介导的SKAP2增强子-启动子互作;CRISPR-Cas9敲除E4、E6增强子导致SKAP2表达下降。这为靶向MAPK3-CTCF染色质重塑治疗AML提供了新思路。

    来源:Carcinogenesis

    时间:2025-10-27

  • TSSKL对蛾类精子的线粒体形态发生以及雄性生育能力至关重要

    昆虫精子形态发生与能量代谢调控机制研究:以TSSKL基因为例,通过CRISPR/Cas9技术构建家蚕(Bombyx mori)和甘蓝夜蛾(Plutella xylostella)的TSSKL基因敲除株,发现该基因在雄性生殖中起关键作用。突变体表现为完全雄性不育,雌性正常,精子束呈现核定位异常、线粒体衍生体结构紊乱及自噬体积累,并通过RNA-seq和KEGG通路分析揭示其通过调控线粒体融合/分裂(如DLP1、FIS1、MIB1等基因)和能量代谢(三羧酸循环、氧化磷酸化相关基因)影响精子功能。进化保守性实验证实该机制在鳞翅目昆虫中普遍存在,为精准灭活害虫提供了新靶点。

    来源:PLOS Genetics

    时间:2025-10-27

  • Natterin通过CRFB1/Gbp4介导途径,同时连接IFN-φ1信号通路和非典型炎症小体通路,从而激活Caspy2介导的抗菌免疫反应

    干扰素信号与非经典炎症小体激活在斑马鱼抗沙门氏菌免疫中起关键作用,Natterin作为上游调控分子整合两者。摘要:Natterin缺失导致干扰素-φ1(IFN-φ1)信号和 Caspy2/GBP4 非经典炎症小体通路中断,显著削弱斑马鱼对沙门氏菌的免疫应答,增加死亡率,验证其作为免疫核心调控分子的作用。

    来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    时间:2025-10-27

  • 来自镰刀菌属(Fusarium spp.)的合成聚酯降解角质酶在黑曲霉(Aspergillus niger)中的异源表达与特性研究

    本研究筛选并鉴定了两种镰刀菌(F. oxysporum和F. redolens)的四类切割酶(Cut1和Cut5),利用CRISPR-Cas9系统在黑曲霉中高效表达,发现Cut5酶对合成聚酯Impranil-DLN和BHET具有显著降解活性,且结构特征与已知酶高度相似,为塑料生物降解提供了新候选酶。

    来源:Microbiology Spectrum

    时间:2025-10-27

  • BnaKINβ1通过招募E3连接酶来调控种子的大小,并参与菜籽(Brassica napus)中KIN10的稳定控制

    本研究通过CRISPR/Cas9编辑向日葵BnaKINβ1基因,结合表型分析、电镜观察及转录/代谢组学分析,揭示其通过调控糖代谢途径影响种子千粒重,并发现BnaJUL1介导的泛素化降解机制,为高产品种培育提供理论依据。

    来源:Journal of Agricultural and Food Chemistry

    时间:2025-10-27

  • 基于相似性的迁移学习与深度学习网络结合,用于精确预测CRISPR-Cas9的脱靶效应

    CRISPR-Cas9脱靶预测通过相似性分析优化源数据集选择,比较了余弦、欧氏和曼哈顿距离,发现余弦距离最有效。MLP和RNN-GRU模型表现最佳,提出的双层级框架显著提升预测精度。

    来源:PLOS Computational Biology

    时间:2025-10-27


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