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为解决微生物化石记录稀少、早期微生物演化时间尺度难以确定的问题,研究人员开展了结合机器学习和系统发育调和,将细菌向有氧生活方式的转变与大氧化事件(GOE)联系来校准细菌时间树的研究。结果发现多数细菌门起源于太古宙和元古宙,有氧细菌可能早于 GOE 出现,该研究为探索微生物演化提供新途径。
微生物生命在地球历史中占据主导地位,但留下的化石记录却十分稀少,这极大地阻碍了我们对远古时期生物演化的理解。不过,细菌的新陈代谢在地球化学记录中留下了印记,其中最显著的便是大氧化事件(Great Oxidation Event,GOE)。研究人员将机器学习与系统发育调和相结合,推断细菌祖先向有氧生活方式的转变,并将其与 GOE 相联系,以此校准细菌时间树。现存的细菌门可追溯到太古宙(Archaean)和元古宙(Proterozoic),而细菌科则可追溯到显生宙(Phanerozoic)之前。研究推断,大多数细菌门在祖先时期是厌氧的,在 GOE 之后才采用有氧生活方式。然而,在蓝藻祖先中,有氧代谢可能早于 GOE 出现,这或许促进了蓝藻中含氧光合作用的演化。
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