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头颈癌症患者来源模型库中HPV阳性和阴性模型的分子差异研究显示，HPV+模型PIK3CA突变率显著更高（47% vs 25%），并伴随E2F靶向、G2M检查点及DNA修复基因集上调，凋亡相关基因下调，与临床特征一致。模型在体内外保持高一致性，为开发靶向HPV相关头颈癌症的新疗法提供工具。
头颈部（HN）癌症是一组罕见的癌症，其定义基于解剖学起源部位，包括口腔、鼻窦、咽喉或鼻子。人乳头瘤病毒（HPV）感染在头颈部癌症中起致病作用，导致其具有与非HPV感染病例不同的临床和分子特征。美国国家癌症研究所（NCI）的患者来源模型库（NCI PDMR；https://pdmr.cancer.gov）建立了包含患者来源异种移植物（PDXs）、类器官（PDOrgs）、肿瘤细胞培养物（PDCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs）的全国性模型库。这些模型附带临床注释和分子信息，并通过公共数据库向外部研究社区开放。迄今为止，已从351名不同患者的各种组织类型（包括唇/口腔、咽部、喉部、唾液腺和鼻窦）中收集到361个头颈部肿瘤样本，总体PDX获取率为48%（322个可评估样本）。NCI PDMR目前拥有来自124名患者的200个公开头颈部PDX、PDOrg和PDC模型。其中33个模型（PDX、PDOrg、PDC）通过PCR检测显示HPV16或HPV18阳性（一个模型同时检测出两种病毒），一个鼻窦PDOrg模型通过NextGenSeq数据检测出HPV33阳性。正如临床文献所报道的，TP53和CDKN2A突变主要出现在非HPV感染（HPV-）的PDX模型中（分别为84%和65%），而在HPV阳性（HPV+）模型中则未见这些突变（分别为0%和0%）；PIK3CA突变在HPV+模型中更为常见（47%对比25%）。在模型中未观察到显著的杂合性丢失现象。然而，与HPV+模型相比，HPV-模型在染色体臂拷贝数变化上存在显著差异（7p、11p和12p染色体拷贝数增加，而3p、9p和18q染色体拷贝数减少 [P值<0.05；Wilcoxon秩和检验]）。基因集富集分析（GSEA）显示，在HPV+模型中E2F_TARGETS、G2M_CHECKPOINT和DNA_REPAIR基因集显著上调，而APOPTOSIS基因集显著下调（使用MSigDB Hallmark数据集，P值<0.05）。无论是在体内PDX模型还是体外PDC/PDOrg模型中，这些差异都是一致的，表明了模型的准确性。这些临床前模型再现了HPV+与HPV-临床病例之间的分子差异，为头颈部癌症的新疗法开发提供了重要工具。该研究由NCI合同编号HHSN261200800001E资助。
引用格式：
Yvonne A. Evrard, Ting-Chia Chang, Jasmine B'Lanton, Gareth Bliss, Alice Chen, Li Chen, Kevin Cooper, Kristin Cox, Natalie Czarra, Isabella Czernia, Biswajit Das, Kelly Dougherty, Aarin Dreyer, Lindsay Dutko, Katie Frey, Marion Gibson, Tara Grinnage-Pulley, Shahanawaz Jiwani, Poorva Juneja, Keegan Kalmbach, Tamikia Lamb, Eva Loewenstein, Candace Mallow, Chelsea McGlynn, Justine Mills, Michael Mullendore, Matthew Murphy, Sandra Navas-Reyes, Michelle Norris, Jessica Park, Kaci Paulus, Kevin Plater, Tia Shearer, Jessica Steed, Luke Stockwin, Howard Stotler, Ruth Thornton, Cindy R. Timme, Shannon Uzelac, Dianne L. Newton, Chris A. Karlovich, Melinda G. Hollingshead, James H. Doroshow. NCI患者来源模型库中的HPV+和HPV-头颈部癌症患者来源模型 [摘要]。载于：2026年美国癌症研究协会年会论文集；第一部分（常规摘要）；2026年4月17-22日；加利福尼亚州圣地亚哥。费城（PA）：AACR；Cancer Res 2026;86(7 Suppl):摘要编号6067。
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