优于芯片的数字基因表达谱技术[新品推荐]

NanoString，一家名不见经传的小公司，但是它的技术却不容小觑。2008年3月，《Nature Technology》杂志曾以封面文章的形式报道了NanoString的数字基因表达谱技术，可见其非同一般。生物通这就带大家走近这家公司，走近它的独特技术。

NanoString技术最早诞生于著名的Leroy Hood博士创立的系统生物学研究所（Institute for Systems Biology, ISB）。当时，安贝尔•拉特克利夫（Amber Ratcliffe）、克拉申•季米特洛夫（Krassen Dimitrov）和德韦恩•达纳韦(Dwayne Dunaway)正在ISB学习和工作。拉特克利夫 2001 年离开去攻读工商管理硕士。但在离开之前，当时管理基因芯片实验室的季米特洛夫产生了关于分子条形码的点子。在季米特洛夫和达纳韦在实验室进行“原理验证”的同时，拉特克利夫以季米特洛夫的技术为基础准备了一份商业计划书，并把这份计划书作为其 MBA 课业的一部分。接著，她参加了一些全国性的商业计划书竞赛。在西北大学举办的竞赛中，她的计划书被评为“最佳高增长商业计划书”。在三次竞赛中，她一共赢得了 4.6 万美元。此外，这些年轻人还得到了来自 OVP Venture Partners（一家在西雅图非常知名的风险投资商）提供初始投资的承诺。很快，他们就得到了 800 万美元的风险投资，于是NanoSring公司就成立了。

NanoString的核心技术是nCounter分析系统，它运用了一种全新的分子条形码技术，对基因表达进行直接的多重测定，且具有极高的灵敏度和精确度。该技术应用分子条形码和单分子成像来检测并计数单个反应中的几百个转录本。该系统包含了一个全自动的样品制备工作站（sample prep station）、一个数字分析仪（digital analyzer）、CodeSet（分子条形码）及其它试剂。

nCounter技术原理如下：

 
 
1．NanoString的技术采用两条长度约为50bp的探针与mRNA进行杂交。报告探针(reporter probe)携带信号；捕获探针(capture probe)用于杂交后的复合物固定，以供数据采集。

 
 
2．杂交后，样品被转移到样品制备工作站，在那里过量的探针被洗掉，而探针和目的mRNA的复合物则被固定到nCounter的样品夹上。

 
 
3．将样品夹放置到数据分析仪上进行数据采集。样品夹上不同的颜色编码数将被计算出来，并代表每一种目的分子的数量。

nCounter分析系统无需使用酶，也不需要进行PCR扩增，从而减少误差的产生，因而在表达谱分析领域非常有优势。它能够高度灵敏地检测并定量多种样品类型的基因表达，包括纯化的总RNA、细胞和组织裂解液、提取自FFPE样品的RNA以及血液。

根据那篇发表在《Nature Technology》的文章，其中将此平台与芯片、TaqMan PCR和SYBR Green定量PCR进行了比较，发现nCounter系统比芯片更为灵敏，与实时定量PCR的灵敏度相似。研究证明NanoString技术在所有转录本水平的基因表达模式与实时定量PCR有着极佳的关联。

除了基因表达分析，NanoString最近还推出了miRNA表达分析试剂盒。研究人员能在单碱基分辨率上开展多重的miRNA检测，而不需要PCR扩增。据NanoString介绍，研究人员能够对700余种人和人-病毒miRNA进行图谱分析，其灵敏度和特异性与qPCR相当，而价格却更为便宜。除了miRNA分析，该公司还在开发拷贝数变异分析。

NanoString公司位于美国西雅图，目前在中国还没有设代理商或分支机构。如果你对它的技术感兴趣，可以访问www.nanostring.com。（生物通 余亮）