华大智造基于CoolMPS技术的测序仪将登陆美国市场

时间:2020年2月28日
来源:生物通

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华大智造(MGI)近日宣布,从今年4月份开始,基于新型CoolMPS™测序技术的测序仪和测序试剂将正式登陆美国市场。早期用户本周在基因组生物学和技术进展大会(AGBT)上介绍了利用此平台获得的数据。

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华大智造(MGI)近日宣布,从今年4月份开始,基于新型CoolMPS™测序技术的测序仪和测序试剂将正式登陆美国市场。早期试用用户本周在基因组生物学和技术进展大会(AGBT)上介绍了利用此平台获得的数据。

英国癌症研究所肿瘤分析部门的主管Nik Matthews博士将基于CoolMPS的测序技术与华大智造现有的WGS技术进行比较。当他第一次查看数据时,“这完全让我震惊”。在替换成CoolMPS试剂后,Q30得分改善,且错误减少。他将其比喻为“几乎不用做任何事情就获得了更多数据,非常酷”。

加拿大不列颠哥伦比亚癌症中心的Steven Jones博士在演讲中分享了他利用DNBSEQ™平台研究肿瘤样本的经验。他比较了华大智造的DNBSEQ-G400和Illumina的HiSeq测序平台在全基因组测序、RNA测序和单细胞ATAC测序上的性能。他表示,结果表明肿瘤的基因组特征“基本相同”。他还表示,对于PCR-free的全基因组测序,华大智造的DNBSEQ平台更具成本效益,因为它产生了更多的可用数据和更少的重复读数。

麦吉尔大学的基因组科学负责人Jiannis Ragoussis教授则介绍了利用DNBSEQ-G400开展单细胞RNA测序的结果,并与Illumina NovaSeq 6000的数据进行比较。结果表明,两个平台有着相当的性能和相似的数据,但DNBSEQ-400实际上更灵活,并且更具成本效益。“我们不必为了节省成本而混合多个文库,”他说。

华大智造计划今年第2季度在美国市场上推出DNBSEQ家族的G系列测序仪,在第3季度推出T系列测序仪,并将逐步推出其新型CoolMPS™高通量测序试剂盒以及文库制备试剂盒系列,以全面满足用户的全基因组测序、全外显子组测序、RNA测序、宏基因组学测序以及单细胞测序等应用需求。

CoolMPS™技术是一种基于抗体的独特化学方法,在其测序过程中引入了未标记的核苷酸和四种荧光标记的抗体,以识别掺入的碱基。在这一新过程中,每个测序循环中都添加了天然的无标记碱基,可有效避免DNA“疤痕”积聚对后续读取准确性的影响,实现更准确和更长的测序。这一技术已经在中国、美国和欧洲等国家和地区申请了专利。

它的优点包括:信号强,每个抗体能标记多个荧光,碱基检查信号更强,相同拷贝数的DNB用CoolMPS可以获得更高的信号和更好的信噪比,从而使测序更准确。它没有非天然碱基带来的荧光淬灭,因为荧光分子标记在抗体上,测序过程中无多余化学键的残留, 所以准确性更高。此外,它的反应更完全,即DNA聚合酶结合天然碱基的效率更高,测序读长更长。

华大智造首席科学官Rade Drmanac博士表示:“华大智造有基于DNBSEQ™核心技术的测序仪和领先的大规模平行测序化学技术,而美国拥有全球领先的基因组学市场,我们很高兴能够将我们的测序仪和测序技术带入美国,从而更广泛地推动先进的基因组学应用”。

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