YES1错义多态性c.596C>T与c.868C>T通过隐马尔可夫模型揭示其与血液及生殖系统癌症的关联机制

时间:2025年10月7日
来源:Human Gene

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本文通过隐马尔可夫模型(HMM)筛选出YES1基因中两个关键错义多态性c.596C>T(p.Arg199His)和c.868C>T(p.Glu290Lys),证实其通过破坏SH2与酪氨酸激酶结构域稳定性、影响ATP结合及信号转导,进而促进血液肿瘤与生殖系统恶性肿瘤的发生发展,为靶向YES1的精准疗法提供新方向。

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Highlight
通过多模态生物信息学方法筛选YES1基因错义单核苷酸多态性(SNPs),结合隐马尔可夫模型(HMM)揭示其与癌症发生的潜在机制关联。
Identification of common damaging/deleterious and pathogenic SNPs
共从dbSNP-NCBI数据库筛选出381个错义SNP,经SIFT、PolyPhen-2、PANTHER等六种工具交叉验证,最终锁定7个具有致病性的SNP。其中YES1 c.596C>T(p.Arg199His)和YES1 c.868C>T(p.Glu290Lys)被预测为可降低蛋白质稳定性,并分别与血液癌症、生殖器官实体瘤及胃肠道(GI)癌症相关。这两处突变均位于YES1蛋白高度保守的SH2结构域和酪氨酸激酶活性核心区域,可导致蛋白质空间构象改变、静电相互作用紊乱,并破坏ATP/底物结合能力与激酶活性,进而干扰蛋白质互作网络并激活多条致癌通路。
Discussion
本研究观察到C>T碱基替换驱动了精氨酸向组氨酸(R199H)及谷氨酸向赖氨酸(E290K)的氨基酸变异,引起蛋白质静电性质由正电转为中性、负电转为正电。突变体降低了蛋白质稳定性,出现在中等至高保守性区域,且被高置信度预测为致癌性变异。进一步通过癌症数据库分析发现YES1在血液系统肿瘤、生殖系统癌和胃肠道癌中显著高表达,其突变谱与肿瘤侵袭/转移表型密切相关,佐证了上述SNPs的致癌潜力。
Conclusion
我们得出结论:YES1 c.596C>T(p.Arg199His)和YES1 c.868C>T(p.Glu290Lys)可能是与血液肿瘤和实体瘤(特别是生殖器官或胃肠道癌症)密切相关的潜在SNP标志物。建议在癌症患者中筛查R199H和E290K突变,以建立其与临床表型的关联,进而指导开发针对YES1的精准治疗策略,克服耐药性并提升未来临床获益。

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