公告 Gordonia rubripertincta 是一种革兰氏阳性细菌，属于放线菌门（
1 ），常见于土壤中，并具有生物修复潜力（
2 ）。通过科学教育联盟-噬菌体猎人推动基因组学和进化科学（SEA-PHAGES）项目，
G. rubripertincta 被用作宿主细菌，用于从德克萨斯州卢博克收集的土壤样本中分离、鉴定、测序和注释噬菌体（
3 ）。
BluerMoon是在2023年8月30日，从坐标为33.58482,-101.87825处的土壤样本中提取的。该样本被悬浮在蛋白胨酵母钙（PYCa）培养基中，并以2,000 × g（3,500 rpm）的离心速度离心10分钟。通过0.22-µm注射器过滤器过滤掉杂质，然后取500 µL上清液加入到
G. rubripertincta NRRL B-16540的液体培养基中。富集后的分离样本在30°C下以220 rpm的转速孵育3天，随后稀释并通过覆盖技术进行接种（
4 ）。选取一个透明的噬菌斑，将其悬浮在400 µL PYCa培养基和400 µL 80%甘油溶液中。接着，将10 µL该混合液加入到3 mL PYCa培养基中。从这10 µL溶液中取出1 µL、10 µL或100 µL，分别与250 µL宿主细菌和3 mL熔化的顶层琼脂混合，使用覆盖技术制备出网状（网状）平板（用于高滴度溶菌液，>1 × 10
9 pfu/mL）（
4 ）。样本的DNA使用Quantabio Extracta Plus DNA试剂盒（目录号95213-050）进行处理。使用BioTek Take3平板读取仪测量DNA浓度。Illumina DNA Prep标签化试剂盒用于准备基因组，以便在Illumina NextSeq 2000平台上进行测序，使用300循环的流动细胞试剂盒生成2 × 150 bp的配对读段。
使用Bowtie2 v2.5.3和一种密切相关的宿主序列（登录号CP136136.1）（
5 ）去除宿主序列污染。使用Fastp v0.23.4（
6 ）检查读取质量。使用SPAdes genome assembler v3.15.5进行基因组组装（
7 ）。使用BEDTools v2.31.0和SAMtools v1.6（
8 ,
9 ）确定深度和覆盖度。使用DNA Master v5.23.3和Phage Evidence Collection and Annotation Network（PECAAN）（
10 ,
11 ）完成基因组注释。在注释过程中，使用Glimmer v3.0和GeneMark v2.5手动验证和预测基因（
12 ）。利用BLAST v2.11.01（
13 ）（参考PhagesDB.org和NCBI非冗余数据库）、Phamerator（
14 ）（使用Actino_draft数据库v578）、NCBI保守结构域数据库（
15 ）、HHPRED v3.0（
16 ）（使用PDB_mmCIF70）和Pfam-v36.0（
17 ）预测基因功能。所有提到的软件均使用默认配置（
表1 ）。
表1 所报道噬菌体的特征参数 分离出的噬菌体BluerMoon的数据 基因组长度（bp） 61,118 测序覆盖度（x） 2,424 预测基因数量 90 tRNA数量 0 未知功能的假设蛋白数量 65 GC含量（%） 68.8% 进行测序的机构 SeqCoast Genomics GenBank登录号 PV251866 SRA登录号 SRR31925873 BioProject登录号 PRJNA488469
BluerMoon是从
G. rubripertincta 的富集培养物中分离得到的。根据Actinobacteriophage数据库PhagesDB（
https://phagesdb.org ），BluerMoon属于DJ簇，且具有裂解性。DJ簇噬菌体的平均GC含量为51.5%，平均基因组大小为60,476 bp，可感染
Gordonia 属细菌。我们手动将其分类为具有3’末端粘性突出结构的基因组（
18 ）。通过tRNAscan-SE v2.0和ARAGORN v1.2.38确认BluerMoon中不存在tRNA，这与DJ簇中的所有噬菌体一致（
19 ,
20 ）。
