机器学习模型助力预测 ICU 患者抗生素治疗适宜性:打破困境,引领精准医疗新方向

时间:2025年2月7日
来源:npj Digital Medicine

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在 ICU 中,抗生素耐药性威胁日增,不恰当经验性抗生素治疗影响患者预后。研究人员开发机器学习模型预测 ICU 获得性血流感染经验性抗生素治疗的适宜性。该模型在多数据集表现良好,还能预测死亡率,为临床合理用药提供支持。

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在医疗领域,抗生素的使用曾是对抗细菌感染的有力武器,但如今却陷入困境。随着抗生素的大量消耗,细菌耐药性问题愈发严重,这不仅使治疗效果大打折扣,还增加了患者的死亡率和医疗成本。在重症监护病房(ICU)中,由于治疗的紧迫性,不恰当的经验性抗生素治疗常常出现,患者的生命健康面临巨大挑战。为了改变这一现状,来自以色列特拉维夫大学(Tel-Aviv University)等机构的研究人员开展了一项重要研究,其成果发表在《npj Digital Medicine》上。
目前,细菌病原体评估的金标准是培养孵育,但这一过程耗时较长,通常需要 48 - 72 小时。在等待结果的过程中,为了挽救患者生命,医生往往会根据临床经验在获取血培养和抗菌药敏试验(AST)结果前就使用经验性抗生素治疗。然而,这种治疗方式存在很大风险,因为使用的抗生素可能并不适合病原体,尤其是 ICU 获得性感染,更容易对广谱抗生素产生耐药性。不合适的抗生素治疗(IAT)会导致治疗失败率升高、死亡率上升以及住院时间延长等不良后果,因此,快速识别 ICU 患者抗生素治疗的适宜性迫在眉睫。

此次研究中,研究人员利用来自 MIMIC - III 数据库的数据,开发了一种机器学习模型,旨在预测 ICU 获得性血流感染患者经验性抗生素治疗的适宜性。该模型在预测时具有独特优势,它在血培养后 24 小时进行预测,此时经验性抗生素已给药约 24 小时,且比药敏试验结果提前约 48 小时,为医生重新评估抗生素选择提供了宝贵时间。

在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。首先,他们从 MIMIC - III 数据库获取数据,该数据库包含大量 ICU 患者的电子病历(EMR)信息。然后,针对数据中存在的缺失值和不平衡问题,研究人员设计了新颖的计算方法和灵活的流程。例如,在处理缺失值时,对于重复测量的值,采用线性回归模型进行插补;对于其他情况,则使用 K 近邻(KNN)算法。在特征工程方面,创建了包括患者人口统计学、实验室测量、生命体征、药物管理、先前实验室培养和医疗程序等六类特征,并通过多种方法对特征进行筛选和处理。最后,经过对多种机器学习模型的评估,选择了随机森林集成(Random Forest DataEnsemble)模型作为最终预测模型。

研究结果如下:

  • 队列描述:研究使用 MIMIC - III 数据库中的数据,最终确定的队列包括 135 名患者,分为训练集和验证集。训练集有 105 名患者,其中 83 名接受了合适的抗生素治疗,22 名接受了不合适的治疗;验证集有 30 名患者,22 名治疗合适,8 名治疗不合适。
  • 抗生素分析:分析血培养结果和患者使用的药物发现,凝固酶阳性金黄色葡萄球菌是最常见的病原体,最常用的抗生素是万古霉素。同时,不同抗生素对不同病原体的耐药情况也有所不同,如粪肠球菌对抗生素的耐药率较高,红霉素的耐药发生率也较高。
  • 适宜性模型评估:通过五重分层交叉验证对多个模型进行评估,随机森林集成模型表现最佳。在训练集上,其受试者工作特征曲线下面积(AUROC)为 82.76 ± 1.46%,精确召回曲线下面积(AUPRC)为 60.61 ± 3.76%;在验证集上,AUROC 为 77.3%,AUPRC 为 40.4%。此外,研究还发现,使用药物干预后的 24 小时数据对模型预测至关重要,仅使用血培养前或血培养后的部分数据会导致模型性能下降。
  • 时间验证和外部验证:利用 MIMIC - IV 数据集进行时间验证,模型的 AUROC 为 73.2%,AUPRC 为 42.3%;在以色列海法的 Rambam 医疗中心(RHCC)的外部数据集上进行验证,模型的 AUROC 为 71.1%,AUPRC 为 54.9%。这些结果表明模型具有一定的稳健性。
  • 特征重要性分析:分析模型特征发现,原始实验室测量和生命体征测量本身并非显著判别特征,而先前的培养,尤其是耐药培养,与不恰当治疗类别显著相关。对模型影响较大的特征多为生命体征和实验室测量的时间序列特征,这些特征能捕捉测量值随时间的变化趋势。
  • 死亡率预测:研究人员利用模型预测死亡率,发现模型风险评分与死亡率相关。在不同数据集上,高风险评分患者的死亡率显著高于低风险评分患者,表明模型在预测死亡率方面具有一定的潜力,即使对于血培养阴性的患者也可能有预测价值。

研究结论和讨论部分指出,该机器学习算法在预测 ICU 获得性菌血症患者不恰当经验性抗生素治疗方面表现出良好的性能。它能够在药敏试验结果出来前 48 小时预测抗生素治疗的适宜性,有助于临床医生评估患者情况,调整抗生素治疗方案。这不仅可以减少不匹配的治疗,还可能为个性化抗生素处方提供指导,降低治疗失败率,减少抗生素的总体使用,从而为全球对抗抗生素耐药性的努力做出贡献。同时,模型在不同数据集上的良好表现也证明了其稳健性。然而,研究也存在一些局限性,如过滤掉了可能的污染菌,模型应针对每个医疗中心进行训练,且主要依赖生理数据而非特定抗生素耐药模式,还需要进行前瞻性评估以确定其在实际临床场景中的性能。未来研究可纳入患者完整的医疗史和先前住院记录,进一步提高模型的预测能力。总体而言,这项研究为抗生素治疗适宜性的预测提供了新的方法和思路,在临床实践和对抗抗生素耐药性方面具有重要意义。

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