线粒体 tRF-Tyr-GTA001：乳腺癌进展的潜在抑制因子

时间：2025年3月19日

来源：Breast Cancer Research and Treatment

编辑推荐：

研究人员分析 TCGA 数据研究线粒体 tRFs 与乳腺癌的关系，发现 mt-tRF-Tyr-GTA₀₀₁可抑制癌进展。

背景：转运 RNA（tRNA）片段（tRFs）是一类具有生物学功能的小型非编码 RNA。tRNA 在癌症中的作用已得到认可，但大多数研究集中于细胞核 tRFs，对线粒体 tRFs 的研究极少。方法：研究人员分析了癌症基因组图谱（TCGA）的微小 RNA 测序数据，以识别乳腺癌肿瘤中差异表达的线粒体 tRFs（mt-tRFs），并评估它们与疾病预后的关联。采用 Cox 比例风险回归，在调整临床病理变量的同时，确定 mt-tRFs 与患者生存率之间的关系。在验证研究中，开发了定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）来测量特定 tRF 的表达。结果：对来自 TCGA 的 1060 个肿瘤样本分析显示，mt-tRF-Tyr-GTA₀₀₁（tRF-21-X3OJI8EWB 或 t00018104），一种来自线粒体 tRNA（其反密码子为 GTA，对应酪氨酸，即 mt-tRNA-Tyr-GTA）的 tRF，在乳腺癌肿瘤中的表达显著低于癌旁组织（p<0.0001）。无论诊断时年龄、疾病分期、肿瘤分级和激素受体状态如何，mt-tRF-Tyr-GTA₀₀₁低表达的患者死亡风险显著更高（风险比 HR = 1.69，p = 0.0018）。在一项独立研究中，通过 qRT-PCR 测量 mt-tRF-Tyr-GTA₀₀₁的表达，也重现了这种生存关联。进一步分析表明，mt-tRF 的表达与已知能切割 tRNA 且在缺氧条件下上调的核糖核酸酶 ANG 和核糖核酸酶 4 相关。对 mt-tRF-Tyr-GTA₀₀₁表达特征进行的 IPA 分析显示，它对恶性转化、肿瘤生长和细胞侵袭具有抑制作用。计算机模拟分析表明，mt-tRF-Tyr-GTA₀₀₁的结合靶点包括几种致癌转录因子（E2Fs、CCNE1、FOXM1）。研究还发现，mt-tRF 与 M0 巨噬细胞和静息肥大细胞的丰度相关，这两种免疫细胞参与先天免疫。结论：总之，该研究表明，线粒体 tRF——mt-tRF-Tyr-GTA₀₀₁，可能通过参与调节细胞表型和肿瘤免疫来抑制乳腺癌进展。