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为解析空间站微生物潜在风险及适应性机制，来自中国的研究团队通过中国空间站人居区微生物组计划(CHAMP)，首次采用宏基因组与培养组学联用技术，揭示CSS早期以人源微生物为主导的群落特征，发现其与ISS存在显著组成/功能差异，并检测到抗生素耐药性积累及菌株基因组空间适应性突变，为长期载人航天微生物防控提供关键科学依据。
随着中国空间站(CSS)正式投入运行，其微生物组特征研究成为航天医学领域紧迫课题。微生物不仅威胁航天员健康，还可能影响设备正常运行。中国空间站人居区微生物组计划(CHAMP)首次系统解析了CSS早期微生物群落特征：采用宏基因组测序与培养组学相结合的策略，发现空间站微生物组呈现显著的人体共生菌优势特征，其群落组成与功能多样性均与国际空间站(ISS)存在显著差异。尽管两次采样任务显示的菌群结构存在明显异质性，但功能层面未现统计学差异，唯抗生素抗性基因呈现累积趋势。值得注意的是，空间站内微生物表现出强烈的共现网络特征。通过对比装配测试中心(AIT)环境分离株，发现CSS菌株存在大量可能关联空间适应的基因组突变。针对四种高丰度物种的种内变异分析，进一步揭示了微生物在空间站不同区域的传播定植规律。该研究不仅拓展了极端封闭环境微生物生态认知，更为未来长期载人航天任务的微生物风险管理提供了分子层面的决策依据。
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