综述:从糖酵解中间体葡萄糖-6-磷酸和果糖-6-磷酸合成功能性碳水化合物:进展与前景

时间:2026年1月20日
来源:Biotechnology Advances

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微生物合成功能碳水化合物的关键途径为G-6-P和F-6-P重定向的IAD、FGF和FAA模块,需通过代谢工程优化模块构建与碳流调控实现产率提升。

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作者:阮宇、吕学勤、张艳、陈健、刘龙
中国江南大学教育部碳水化合物化学与生物技术重点实验室,无锡 214122

摘要

葡萄糖-6-磷酸(G-6-P)和果糖-6-磷酸(F-6-P)位于糖酵解途径的上游,是关键的中间化合物,为细胞生长提供碳骨架和能量。从头微生物合成功能性碳水化合物涉及对G-6-P和F-6-P的衍生化处理。这一过程常常伴随着对细胞生长的负面影响,从而给高效生产带来了挑战。本文综述了以G-6-P和F-6-P为前体的主要衍生化反应,将其分为三类:IAD(异构化与磷酸化模块)、FGF(F-6-P转化为GDP-FO糖模块)和FAA(F-6-P转乙酰化与转胺基模块)。简要介绍了这些途径产生的代表性功能性碳水化合物,并总结了相关途径的重组与优化方法。此外,还分类总结了G-6-P和F-6-P代谢调控方面的进展。最后,探讨了通过微生物途径对G-6-P和F-6-P进行衍生化以合成功能性碳水化合物的技术。本文有助于理解糖酵解途径中G-6-P和F-6-P转化的策略与核心原理,以及功能性碳水化合物衍生物的从头生物合成方法,对于构建能够高效将G-6-P和F-6-P转化为衍生物并实现其工业生产的微生物细胞工厂具有重要意义。

引言

生物制造是一种重要的新型发展模式,旨在解决气候、能源和粮食危机问题,与传统的石化生产方法相比,它具有原材料可持续性、环境友好性和产品安全性的优势(Keasling, 2010; Sun et al., 2023a)。从头微生物生物合成是一种利用廉价底物通过微生物细胞代谢来合成高附加值化合物的方法(Makaranga et al., 2024; Pierrel et al., 2022; Pressley et al., 2024)。与传统化学催化方法不同,该方法依靠生物体内的多步骤酶促反应来获得目标化合物,无需使用金属催化剂和化学试剂。葡萄糖是最简单且最常用的微生物发酵碳源,也是从头生物合成的廉价底物。葡萄糖-6-磷酸(G-6-P)和果糖-6-磷酸(F-6-P)在进入微生物糖酵解途径后成为前体。这些分子通过糖酵解进入三羧酸循环(TCA)和戊糖磷酸途径(PPP),在此过程中生成NADPH用于生物反应和能量产生。此外,它们还为核苷酸生物合成提供必要的碳骨架(Bachoo et al., 2011; Richhardt et al., 2013; Xu et al., 2020)。通过从头微生物合成生产功能性碳水化合物会增加微生物的正常生理代谢负担。虽然生物合成能力的提升有助于提高目标化合物的产量,但同时也会降低其生长能力。以G-6-P和F-6-P为前体的功能性碳水化合物生物合成过程需要对其进行衍生化处理。生物合成效率主要取决于碳流在衍生化途径与糖酵解途径之间的分配情况,即碳流重定向效率。提高这一效率的策略包括优化合成途径和调控微生物正常生长过程中的代谢流(Lin and Tao, 2017)。G-6-P和F-6-P衍生功能性碳水化合物的从头合成主要涉及衍生化模块的构建与优化以及中心碳代谢的调控(Taylor et al., 2023; You et al., 2020)。
本文将G-6-P和F-6-P向碳水化合物生物合成转化的主要衍生化反应分为三类:IAD(异构化与磷酸化)、FGF(F-6-P转化为GDP-FO糖)和FAA(F-6-P转乙酰化与转胺基)(图1)。总结了涉及这三类衍生化模块的功能性碳水化合物生物合成途径的优化方法,包括IAD模块中的肌醇和D-阿洛糖生产、FGF模块中的岩藻糖生产以及FAA模块中的GlcNAc生产。此外,从两个角度详细分析了通过糖酵解途径化合物的转化实现高价值碳水化合物高效生产的策略:动态调节生长与生产之间的转换以及静态下调G-6-P和F-6-P降解途径。最后,讨论了整合代谢工程和合成生物学技术以促进糖酵解途径化合物衍生化生产的潜力。

IAD模块中肌醇和D-阿洛糖的合成

通过引入异构酶,可以将G-6-P和F-6-P中的碳流导向磷酸化六碳功能性碳水化合物的生成,随后通过去磷酸化获得最终产物。我们将这种合成方法称为IAD模块,并以肌醇(G-6-P衍生物)和D-阿洛糖(F-6-P衍生物)为例来说明该模块的应用。
作为B族维生素的成员,肌醇...

为功能性碳水化合物生产优化G-6-P和F-6-P衍生化模块

通过引入新的生物合成途径,重新分配了微生物的代谢流,实现了生长与生产之间的平衡。这种改造使微生物能够在发酵过程中积累产物。对这些策略的系统性分析为G-6-P/F-6-P转化的代谢工程设计提供了理论参考。

下调G-6-P和F-6-P降解以优化碳流重定向

尽管存在高效的合成途径,但中心碳代谢仍会消耗大量碳流用于生长。因此,下调G-6-P和F-6-P的降解对于提高碳流重定向效率至关重要。然而,下调中心碳代谢会抑制微生物生长,同时减少碳源消耗和功能性碳水化合物的产量。本文系统总结了相关的代谢调控方法...

宿主底盘:从模式生物到未来的生物制造平台

选择合适的微生物底盘需要兼顾遗传可操作性、调控合规性和工业可扩展性。如表1所示,大肠杆菌仍是唯一一个在所有三个模块中都能实现超过100 g/L产量的平台;尽管野生型菌株的致病性限制了其在食品领域的应用,但某些特定衍生株(如大肠杆菌 K-12 MG1655、JM109)已获得特定用途的GRAS认证。枯草芽孢杆菌(GRAS认证)具有无内毒素的特点...

作者贡献声明

阮宇:概念构思、数据整理、初稿撰写。吕学勤:数据整理、审稿与编辑。张艳:数据整理。陈健:数据整理、审稿与编辑。刘龙:概念构思、资金获取、监督、审稿与编辑。

未引用的参考文献

Li et al., 2023
Li et al., 2025
Wang et al., 2022a
Zhang et al., 2019
Zhu et al., 2021

利益冲突声明

作者声明没有已知的财务利益冲突或个人关系可能影响本文的研究结果。
致谢
作者感谢以下项目的支持:中国国家重点研发计划 [2024YFA0918300]; 国家自然科学基金 [32372301]; 江苏省优秀博士后人才资助计划 [2025ZB548]; 江西省重点科技项目 [20244AFH82001]; 山东省重点研发计划 [2024CXGC010917]; 江苏省合成生物学基础研究中心 [BK20233003]。

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