金刚烷烃-四唑杂化衍生物:合成、晶体结构、分子对接、分子动力学模拟以及抗菌、抗真菌和抗增殖活性的体外评估

时间:2026年2月3日
来源:Journal of Molecular Structure

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合成了Adamantane-Tetrazole杂交衍生物,通过核磁共振和X射线晶体学确认结构。5b对金黄色葡萄球菌和大肠杆菌抗菌活性显著,5c对多种癌细胞抑制效果突出,其晶体结构(P-1)和分子对接显示与DHFR、ERα受体高亲和力。化合物5a-c具有良好理化性质和药物相似性。

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Eman T. Warda|Mahmoud B. El-Ashmawy|Mohammed S.M. Abdelbaky|El-Sayed E. Habib|Santiago Garcia-Granda|Annesha Chakraborty|Subbiah Thamotharan|Ali A. El-Emam
埃及曼苏拉大学药学院药物化学系,曼苏拉,35516

摘要

合成了一系列金刚烷-四唑杂化衍生物,并通过1H NMR、13C NMR和X射线晶体学确认了其结构。对这些化合物的体外抗菌活性进行了评估,测试对象包括八种革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌以及致病真菌。化合物5b表现出显著的抗菌活性,尤其是对金黄色葡萄球菌大肠杆菌。此外,化合物5c显示出最佳的抗增殖活性,对所有测试的人类癌细胞系均具有强烈的抑制作用。强效化合物5c的晶体结构属于三斜晶系,空间群为P-1,其稳定性由C–H···N、C–H···S和C–H···π相互作用网络维持。分子对接分析显示,化合物5c对DHFR和ERα受体具有良好的结合亲和力。化合物5a-c表现出令人鼓舞的理化性质和成药性,作为潜在的抗菌和/或抗增殖剂。

引言

分子杂化是药物发现中的一个有前景的概念,它涉及将不同生物活性化合物的药效片段结合在一起,以创造具有改进治疗特性的新杂化物[1,2]。鉴于由抗菌素耐药性引起的全球性问题日益严重以及癌症发病率的上升,迫切需要寻找新的抗菌和抗增殖剂。
四唑杂环是许多药物的重要组成部分,因为它能够模拟羧酸和酰胺结构,从而改善理化性质和稳定性[3,4]。先前已有多种基于四唑的衍生物被鉴定为具有广泛化疗活性的治疗药物[[5], [6], [7], [8]]。泰迪佐利德(Tedizolid)是一种四唑-氧唑利酮杂化物,广泛用于控制由葡萄球菌和肠球菌引起的局部和全身感染[9]。此外,四唑基苯酰胺类似物KKL-55对革兰氏阳性和革兰氏阴性菌种(包括炭疽杆菌)表现出强抗菌活性[10]。奥特塞康唑(Oteseconazole)是一种新型四唑基药物,目前作为口服生物利用度的选择性真菌羊毛甾醇14α-去甲基酶(CYP51)抑制剂,用于治疗复发性外阴阴道念珠菌病[11]。相关衍生物quilseconazole和VT-1598[12]是治疗侵袭性真菌疾病的潜在抗真菌候选药物。GSK-839是一种处于开发早期的候选药物,用于治疗结核病,并且对结核分枝杆菌的色氨酸合成酶具有选择性抑制作用[13]。含有四唑的衍生物VP-14637和HBF-0259分别被鉴定为针对呼吸道合胞病毒和乙型肝炎病毒的强效抗病毒剂[14]。此外,encequidar[15]和BMS-317180[16]也被报道为强效抗癌剂(图1)。
相反,金刚烷笼由于其卓越的物理、化学和药理性质,在药物化学中占据重要地位[17,18]。将金刚烷结构单元整合到各种药效团或活性药物分子中,可以显著改善其理化和药理性质[19]。最初,含有金刚烷结构的药物因其化疗活性而受到关注。阿曼达丁[20,21]和利巴韦林[22]被批准用于治疗甲型流感病毒感染,而托曼达丁(Tromantadine)目前用于治疗单纯疱疹引起的皮肤病毒感染[23]。此外,几种基于金刚烷的衍生物也被报道具有强杀菌和杀菌活性[24,25]。SQ109最近被开发为用于治疗敏感和耐药结核菌株的药物[26]。进一步的研究发现了相关二哌啶衍生物SQ609,它对结核分枝杆菌具有强效的长效活性[27]。还有一些金刚烷衍生物显示出强抗癌活性,合成的视黄醇类化合物CD437被发现是诱导人类头颈部鳞状细胞癌凋亡的强大物质[28]。此外,ABC294640随后被批准用于治疗晚期实体瘤患者[29]。酪氨酸激酶抑制剂adaphostin在治疗慢性髓系白血病方面显示出显著疗效[30]。奥帕加尼布(Opaganib)最近被提出作为治疗重症COVID-19肺炎的有希望的候选药物[31](图2)。
鉴于上述关于四唑和金刚烷衍生物化疗特性的研究结果,本研究描述了新型四唑-金刚烷杂化衍生物的合成、表征、抗菌、抗真菌和抗增殖活性。还展示了强效化合物5c的晶体结构,并对化合物5c与两个重要药物靶点(二氢叶酸还原酶(DHFR)和雌激素受体α(ERα)进行了详细的分子对接分析。

材料与方法

熔点(°C,未经校正)是在开放式玻璃毛细管中使用Stuart SMP30电热熔点仪测得的。NMR谱是在Bruker 400 Avance III上以400.20 MHz频率获取1H信号,在Jeol ECA 500 III上以500.16 MHz频率获取13C信号。化学位移以δ(ppm)表示,以四甲基硅烷(TMS)为内标;耦合常数(J)以Hz表示。使用氘代氯仿(CDCl3)作为溶剂。

化学合成

金刚烷-1-基异硫氰酸酯2是从1-金刚烷胺1开始,采用之前描述的程序[32],并参考Spilovska等人[38]和Munch等人[39]的通用方法制备的,总产率良好。Logvinov等人[33]报道了通过在二氧烷中用叠氮化钠处理金刚烷-1-基异硫氰酸酯2来合成1-(金刚烷-1-基)-1,4-二氢-5H-四唑-5-硫醇3,产率为35%。在本研究中,目标化合物3的产率为55%

结论

本研究合成了一系列新的金刚烷-四唑杂化衍生物3, 4a-c, 5a-c6。对一系列致病细菌和真菌菌株的初步体外抗菌活性评估表明,化合物4a-c, 5a-c6表现出强抗菌活性,尤其是对革兰氏阳性细菌金黄色葡萄球菌和革兰氏阴性细菌大肠杆菌。此外,只有化合物4a表现出明显的抗真菌活性

致谢

M.S.M. Abdelbaky和S. Garcia-Granda感谢国家研究机构(AEI)、西班牙科学、创新和大学部以及阿斯图里亚斯亲王国的Sekuens机构的财政支持。M.S.M. Abdelbaky还感谢萨拉曼卡大学(K257-463AC01)的支持。S. Thamotharan和A. Chakraborty感谢印度政府生物技术部(Grant number: BT/PR40144/BTIS/137/46/2022和BT/BR40150/BTIS/137/81/2023)以及SASTRA的支持

作者贡献

概念构思:M.B.E.-A.和A.A.E.-E.; 方法学:E.T.W., E.E.-S.H.和M.S.M.A.; 软件:S.-G.G.和S.T.; 验证:E.T.W.和M.B.E.-A.; 形式分析:E.T.W., S.T. A.C.和M.S.M.A.; 研究:A.A.E.-E., M.B.E.-A. A.C.和S.-G.G.; 资源:M.S.M.A.和S.G.-G.; 数据管理:E.E.-S.H.和S.T.; 文稿撰写—初稿准备:M.B.E.-A. A.A.E.-E.和S.T; 可视化:S.-G.G.和S.T.; 监督:M.B.E.-A.和A.A.E.-E.; 项目管理:M.B.E.-A.

CRediT作者贡献声明

Eman T. Warda: 验证、方法学、形式分析。Mahmoud B. El-Ashmawy: 文稿撰写—初稿、验证、概念构思。Mohammed S.M. Abdelbaky: 资源、方法学、形式分析。El-Sayed E. Habib: 方法学、数据管理。Santiago Garcia-Granda: 可视化、软件、资源、项目管理、研究、资金获取。Annesha Chakraborty: 研究、形式分析。Subbiah Thamotharan: 文稿撰写—初稿、可视化、软件

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的竞争性财务利益或个人关系可能影响本文所述的工作。

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