通过“空间替换时间”的方法,研究人员揭示了在垃圾填埋场渗滤液中,重金属如何影响不同风险级别的抗生素抗性基因的动态变化机制

时间:2026年3月13日
来源:Journal of Hazardous Materials

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垃圾填埋场关闭后渗滤液中抗生素耐药基因(ARGs)时空分布与重金属协同选择机制研究。采用空间代替时间方法,对比北京不同区域不同关闭年限(未关闭、1-5年、>6年)的填埋场渗滤液,发现关闭1-5年阶段ARGs丰度达峰值(1.28 copies/cell),显著高于其他阶段(p<0.05)。镍、铜、砷等重金属通过外排泵介导的交叉耐药和协同耐药机制促进ARG富集,其中IntI1整合子与高风险ARGs(sul1、tetM、ermF)显著关联,表明水平基因转移是主要传播途径。研究揭示关闭后5年是关键监测窗口期,需优先监控高 рискARGs、移动遗传元件(MGEs)、指示菌(假单胞菌属、大肠杆菌)及重金属浓度。

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汤卓瑞|李彦娇|张璐瑜|席北斗|谭文兵|袁颖
中国环境科学研究院环境标准与风险评估国家重点实验室,北京100012,中国

摘要

垃圾填埋场被认为是抗生素抗性基因(ARGs)的持续储存库;然而,其关闭后的风险特征的时间动态仍知之甚少。由于长期监测垃圾填埋场渗滤液中的ARG风险具有挑战性,因此采用“空间替代时间”的方法来研究三种不同阶段的垃圾填埋场渗滤液中的ARGs、金属抗性基因(MRGs)、移动遗传元件(MGEs)和微生物宿主:未关闭的垃圾填埋场(UL)、关闭1至5年的垃圾填埋场(CF)以及关闭超过6年的垃圾填埋场(CS)。宏基因组分析鉴定出22类中的518种ARG亚型。ARG的丰度在CF阶段达到峰值(1.28拷贝/细胞),显著高于UL(0.292拷贝/细胞)和CS(0.597拷贝/细胞)阶段(p < 0.05)。CF阶段镍、铜和砷浓度的升高通过共选择作用促进了ARG的富集,主要归因于外排泵介导的交叉抗性和ARG-MRG簇内的共抗性。intI1与高风险ARGs密切相关,表明水平基因转移是主要的传播途径。关键细菌宿主,包括假单胞菌属和大肠杆菌,同时携带ARGs和MRGs。这些发现强调了关闭后早期阶段(1-5年)作为关键监测窗口的重要性,并支持针对高风险ARGs、MGEs、指示性物种和重金属的监测,以减轻抗生素抗性的环境传播。

引言

抗生素抗性是一个严重的全球公共卫生威胁,削弱了临床治疗的效果并增加了耐药感染的死亡率([37], [4])。抗生素抗性基因(ARGs)编码多种抗性机制,在各种环境介质中被检测到,包括水生系统(地表水和地下水)、陆地基质(土壤)甚至大气气溶胶([47], [30], [28], [27])。人类活动显著加速了ARG的传播[24],城市固体废物(MSW)填埋场被认为是ARG富集的重要储存库[29]。填埋仍然是全球主要的城市固体废物处理方式,每年处理量超过3.5亿吨,仅在中国就有超过20,000个填埋场在运行或已关闭([56], [29])。在填埋场生态系统中,残留的药物、个人护理产品(PPCPs)和重金属(HMs)施加持续的选择压力,促进ARG的积累([33], [17])。此外,设计不完善的填埋场渗滤液泄漏会促进ARG向周围土壤和地下水的迁移[21]。
填埋场的稳定化过程持续数十年[54]。在关闭后的长时间序列中,MSW经历了逐步的腐殖化和稳定化,同时残留抗生素也发生了生物降解([18], [60], [31])。相比之下,由于重金属本身具有抗降解性,它们在渗滤液中持续存在([8], [52])。重金属暴露通过三种机制促进ARG的共选择:(i)共抗性,由共享移动遗传元件(MGEs)上的重金属抗性基因(MRGs)和ARGs的物理连接引起[11];(ii)交叉抗性,通过能够同时排出重金属和抗生素的非特异性外排系统介导[26];(iii)共调控,即MRGs和ARGs在共同的转录控制下同步表达,例如操纵子([3], [17])。然而,尚不确定重金属驱动的共选择是否会在关闭后的长期内继续促进ARG的增殖。
垃圾填埋场渗滤液中含有超过1,000种ARG亚型,给抗菌素耐药性(AMR)风险监测带来了巨大挑战([15], [53])。根据世界卫生组织和张等人的风险框架[59],ARGs根据其移动性、宿主关联性和环境存在情况被分为四个风险等级。在本研究中,风险等级被解释为环境传播潜力的指标,而非直接的人类健康风险。I级ARG具有高移动性,并与致病性或环境适应性宿主相关,表明具有高水平的水平转移和持久性。II级ARG具有高移动性,但与高优先级致病性宿主的关联较弱,而III级和IV级ARG通常具有更有限的移动性和传播潜力。因此,本研究重点关注高风险ARG及其宿主,以更好地了解它们在垃圾填埋场渗滤液中的环境持久性和传播动态。
鉴于填埋场稳定化的时间尺度为数十年,对关闭后垃圾填埋场渗滤液中的抗性组进行长期监测带来了额外挑战。在如此长的时间内,重金属驱动的共选择和MGE介导的水平基因转移(HGT)对不同风险类别中ARG的丰度和分布的影响仍不清楚。确定需要优先监测的关键ARG对于未来填埋场环境中的抗菌素耐药性风险管理策略至关重要。
为了填补这一研究空白,本研究采用“空间替代时间”的方法,选择了位于同一大都市不同区域的具有不同关闭年龄的垃圾填埋场。在同一城市内,这些填埋场接收的有机固体废物输入大致相似,并经历相同的气候条件,从而最小化了外部环境因素的干扰。这种设计使得能够评估重金属暴露对十年时间尺度上ARG分布的影响。从运行中的填埋场和关闭时间不同的地点收集渗滤液样本,以量化重金属浓度,并利用宏基因组测序来分析MRGs、ARGs、MGEs和微生物群落的丰度和组成。宏基因组组装和分箱用于研究MRGs、ARGs和MGEs之间的共现模式,并评估重金属暴露和MGEs在塑造ARG动态中的作用。具体目标是:(i)描述关闭后不同阶段的ARG分布模式;(ii)识别关键的ARG、重金属和MRG特征;(iii)阐明重金属暴露驱动ARG丰度和多样性变化的机制。

章节摘录

垃圾填埋场渗滤液样本的收集和重金属分析

根据“空间替代时间”的策略,选择了北京范围内规模相似但关闭阶段不同的垃圾填埋场,包括未关闭的垃圾填埋场(UL)、关闭1至5年的垃圾填埋场(CF)以及关闭超过6年的垃圾填埋场(CS)。为了最小化地理和气候变异的影响,本研究选择了位于北京不同区域的市政固体废物填埋场。这些地点接收的废物主要为市政固体废物

垃圾填埋场关闭后不同时间序列中抗生素抗性组多样性和相关风险水平的动态

在垃圾填埋场渗滤液样本中鉴定出518种属于22个ARG类的ARG亚型(图1a)。这些ARG在所有填埋场中均被一致检测到,无论其关闭时间如何。最丰富的0.1%的ARGs包含112个亚型,占总ARG相对丰度的94%以上。这些主要ARG属于大环内酯-林可酰胺-链霉素(MLS)、磺胺类、氨基糖苷类、四环素类和多重耐药类。MLS类是最

关闭早期的抗性组风险峰值:垃圾填埋场抗生素抗性的关键监测阶段

尽管越来越多的研究转向资源回收方法,但垃圾填埋场处理仍然是固体废物管理的核心[1]。与其他废物处理方法不同,垃圾填埋场操作的时间跨度通常长达数十年,这使得ARGs的纵向监测变得复杂[54]。在本研究中,我们采用“空间替代时间”的方法来研究垃圾填埋场关闭后不同时间序列中的ARGs分布模式。

结论

本研究表明,垃圾填埋场的关闭持续时间显著影响了ARGs的分布、丰度和风险特征。通过“空间替代时间”的方法,我们发现关闭后五年内ARGs的丰度达到峰值,尤其是涉及高风险亚型如。在这一关键时期,重金属,特别是镍、铜、锌和砷,施加了强烈的共选择压力,促进了通过宿主的垂直传播

环境影响

关闭后五年内,需要对ARGs、MGEs、MRGs和宿主微生物进行严格监管和针对性监测,以防止它们向周围环境扩散。监测应重点关注和关键金属(Ni、Zn、Cu、As),作为核心MGE标志物,< />和<大肠杆菌>作为指示物种。早期、密集的监测可以有效控制风险,而较老的填埋场可以采用较低强度的策略来提高成本效益。

CRediT作者贡献声明

李彦娇:撰写——审稿与编辑、验证、监督。张璐瑜:撰写——审稿与编辑、调查。席北斗:撰写——审稿与编辑、项目管理、方法学。谭文兵:撰写——审稿与编辑、验证。袁颖:撰写——审稿与编辑、初稿撰写、资源获取、项目管理、资金筹集。汤卓瑞:撰写——审稿与编辑、初稿撰写、资金筹集、数据管理、概念构思。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的可能影响本文工作的竞争性财务利益或个人关系。

致谢

中央级基础研究与发展专项基金业务(2025YSKY-64)、中国博士后科学基金会(2023M742879)、重庆博士后科学基金会(2023CQBSHTB3132)、城市水资源与环境国家重点实验室开放项目(ES202424)。

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