自闭症谱系障碍(ASD)是一种神经发育障碍,其特征是社交沟通缺陷、互动能力受损以及重复性行为(Steer等人,2010年)。目前,ASD的诊断主要依赖于行为观察和临床评估。然而,这种方法缺乏客观的生物标志物,并且容易受到临床经验的影响(Okoye等人,2023年;Qin等人,2024年)。功能性磁共振成像(fMRI)的发展为早期ASD检测开辟了新的途径。fMRI能够无创地监测静息状态下的脑活动,并分析脑区之间的功能连接性,从而揭示ASD患者的网络异常(Li等人,2020年;Power等人,2012年)。脑网络分析已成为研究ASD的宝贵工具,通过连接性映射和图论指标比较ASD患者与神经典型个体的网络拓扑结构,有助于识别潜在的生物标志物(Li等人,2022年;Peng等人,2022年)。然而,脑网络的异质性和多中心数据集中的固有噪声给识别稳定可靠的生物标志物带来了挑战(Wen等人,2022年)。
生物信息学与深度学习的结合成为一个变革性领域,推动了复杂生物数据分析的显著进步(Yang等人,2026年)。近年来,深度学习技术越来越多地应用于基于神经影像数据的ASD诊断。从建模角度来看,现有方法大致可以分为基于向量的模型、规则网格上的卷积模型和图结构模型。每种方法在表征脑网络属性方面都有互补的优势,但也存在固有的局限性。多层感知器(MLP)模型通过将扁平化的功能连接性矩阵或区域级特征映射到诊断标签上来实现ASD分类,提供了简单高效的基线(Sachdeva等人,2024年)。然而,扁平化过程将脑区视为无序的特征集,这削弱了对区域间拓扑结构的显式建模。卷积神经网络(CNN)利用欧几里得网格上的空间局部性有效提取特征,尤其适用于结构性MRI或体素级fMRI数据。然而,直接将CNN应用于连接组数据并不理想,因为强制图像般的邻域可能与脑区之间的非欧几里得关系不一致(Kaur等人,2021年;Lakhan等人,2023年;Tao等人,2019年)。基于Transformer的模型通过自注意力机制处理长距离依赖性,但其有效性很大程度上取决于连接性或图表示的设计,并且可能对上游处理选择敏感(Datta等人,2022年;Deng等人,2022年)。基于扩散的方法通过迭代生成或增强连接性表示来缓解样本量有限的问题,但其临床实用性取决于合成连接组是否保留了有意义的模式而不引入伪影(Travers等人,2012年)。这些局限性促使人们开发出直接在连接组结构上操作的拓扑感知图学习框架,以实现更可靠的ASD预测。
图卷积网络(GCN)在脑连接组建模中越来越受欢迎,因为它们能够直接聚合邻域信息并沿图结构传播节点特征(Kipf和Welling,2016年)。GCN在学习具有区分性的节点表示的同时保留了脑网络拓扑结构,使其适用于ASD诊断。先前的研究提出了动态图建模和多视图嵌入方法来捕捉时空变化并提高分类性能。然而,现有的GCN方法面临若干挑战(Guan等人,2024年;Huang和Chung,2020年;Parisot等人,2017年;Wang等人,2023年):依赖于静态或浅层图结构限制了对复杂交互作用的建模;固定的邻域大小或手动定义的阈值降低了跨数据集的鲁棒性;以及未能充分建模个体变异性和群体间关系,限制了泛化能力和生物学意义。此外,许多流程在应用基于线性变换的消息传递之前将BOLD时间序列简化为静态连接性,这可能无法捕捉特定区域的非线性交互作用,并且在样本量有限时容易受到交叉站点噪声的影响。最近在KAN方面的进展提供了一种有前景的替代方案,即用自适应的基于样条的非线性变换替换固定激活函数。在生物图学习领域,Zhang等人(2026年)证明了KAN增强图注意力网络(KA4GANC)在建模复杂基因调控网络方面的有效性,表明基于KAN的卷积可以有效保留拓扑结构的同时学习非线性模式。
为了解决这些关键问题,并受到KAN增强生物图学习进展的启发,我们提出了一种新的图卷积网络框架KSNet,该框架增强了非线性建模能力,并在脑网络分析中整合了群体级信息。在特征提取层,KSNet引入了KANGCN模块,用基于Kolmogorov-Arnold表示定理的可学习B样条函数替换了传统GCN中的固定激活函数。这使得每条边能够独立建模非线性变换,从而更准确地捕捉脑区之间的复杂功能交互作用。与现有的基于KAN的图模型相比,KANGCN将函数逼近嵌入到图卷积层中,显著提高了非线性建模能力,同时保持了脑网络拓扑的生物学合理性。在多模态融合层,SRGCN模块通过将表型信息(如年龄和性别)编码到个体间亲和图中,然后与功能连接性相似性融合,形成关系群体图,克服了传统特征连接的局限性。SRGCN采用层次化图卷积和可学习的权重聚合,自适应地整合了多个层面的表示,实现了功能成像和表型数据的深度融合。本研究的主要贡献可以总结如下:
(1)我们提出了KANGCN,它结合了Kolmogorov–Arnold网络进行可解释的函数逼近,改善了特征传播过程中的非线性脑连接模式建模。
(2)我们引入了一种节点选择机制,以简化图结构并识别具有区分性的脑区,为ASD生物标志物的发现提供了定量证据。
(3)SRGCN通过结合表型属性和连接性派生的表示,构建了跨个体的异质图,采用层次化融合策略实现多源信息的深度整合,从而增强了模型捕捉具有区分性的ASD模式的能力。
(4)所提出的KSNet框架通过识别与现有医学研究中报告的关键生物标志物位置高度一致的ASD相关脑区,提供了强有力的见解。
本文的其余部分组织如下。第2节简要介绍了科学背景。第3节详细描述了所提出的方法。第4节通过消融研究评估了KSNet关键组件的有效性,并将其与几种现有的ASD预测方法进行了比较。最后,第5节总结了本文并概述了未来的研究方向。