果糖-1,6-二磷酸醛缩酶与甘油醛-3-磷酸脱氢酶之间的相互作用调控了与甲基乙二醛生物合成相关的氧化还原过程

时间:2026年3月29日
来源:Free Radical Biology and Medicine

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Candida albicans Fba1-Tdh3复合体通过调控甲基戊二醛代谢影响红氧化平衡和病原性,其相互作用界面具有通道结构特征,为抗真菌药物设计提供新靶点。

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MyungHee Ku|Jaeyoung Son|Yeonju Hong|Jeong Gyeong Shin|Sa-Ouk Kang|Min-Kyu Kwak
韩国首尔国立大学生物科学学院与微生物研究所生物物理学实验室,首尔08826

摘要

白色念珠菌过表达谷胱甘肽还原酶的突变体(GLR1OE)表现出果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(FBA1)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(TDH3)和酒精脱氢酶(ADH1)的表达增加。为了研究FBA1过表达对甲基乙二醛生物合成相关氧化还原调节的影响,我们模拟了Fba1与Tdh3之间的相互作用在不同碳源条件下如何影响氧化还原相关的代谢过程。FBA1OE在诱导菌丝生长的培养基中引发了氧化还原失衡,表现为甲基乙二醛水平下降和谷胱甘肽含量增加。这些变化与细胞增殖和菌丝形成的缺陷相吻合。此外,FBA1OE导致Glr1活性与谷胱甘肽含量之间的代谢通量不一致,且这种不一致性与细胞的分化/增殖模式无关。数据表明,在FBA1OE中,氧化还原调节与菌丝致病性之间存在平行机制,这与由谷胱甘肽介导的氧化还原调节控制的GLR1OE的分化/增殖过程显著不同。这一发现为理解可能由甲基乙二醛诱导的Fba1活性通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)引起的生理代谢变化提供了额外见解,而这些变化独立于谷胱甘肽和碳源的影响。配体筛选和共免疫沉淀实验一致地确定Tdh3是Fba1的主要结合伴侣。纯化的Fba1-Tdh3复合物比缺乏该复合物的反应更有效地抑制了甲基乙二醛的产生,使底物果糖-1,6-二磷酸的平衡偏向于不积累甲基乙二醛的方向。基于网络的分析显示,Fba1具有三个热点区域,这些区域通过氢键和盐桥与Tdh3的β链和环状结构结合,形成了一个稳定的混合疏水-极性网络,类似于粘附界面。我们的研究将Fba1-Tdh3复合物鉴定为一个对氧化还原敏感的粘附型界面,它将甲基乙二醛的解毒作用与白色念珠菌的氧化还原稳态联系起来。这一复合物为设计抗真菌PPI抑制剂提供了结构明确的靶点。

引言

果糖-1,6-二磷酸(F-1,6-P2)醛缩酶(Fba1,EC.4.1.2.13)已被广泛研究其催化F-1,6-P2分解为甘油醛-3-磷酸(G-3-P)和二羟基丙酮磷酸(DHAP)的能力[1]。Fba1的活性不仅限于基本的代谢维护功能,还具有从甲基乙二醛(MG)和DHAP生成二酮磷酸的潜力。这一过程控制着克雷布斯-林格磷酸盐缓冲液中甘油磷酸和G-3-P生成甲基乙二醛的速率[2]。最近的研究表明,在真菌中条件性破坏FBA1会降低其致病性[3]。然而,驱动这种突变体致病性变化的机制仍需进一步阐明[3]。Fba1在糖酵解过程中的功能与非酶促磷酸消除反应密切相关,该反应由G-3-P和DHAP刺激[4]。尽管已知Fba1活性下MG与DHAP之间存在稳定的结合复合物[5],但关于MG-Fba1中间体与F-1,6-P2之间相互作用的文献较少,而这些相互作用对真菌的致病性和氧化还原调节有显著影响[4]。
因此,本研究以白色念珠菌为模型,探讨了Fba1活性与甲基乙二醛生成之间的联系,这两者都可能影响致病性和氧化还原行为。白色念珠菌这种双相酵母能够形成多种极化的细胞形态,如假菌丝和菌丝[6]。白色念珠菌是识别致病性治疗靶点的有用模型。细胞增殖依赖于可用的能量来源,增殖中的细胞通常能够完成其细胞周期[7],[8]。相比之下,白色念珠菌的菌丝形成受到包括Cph1介导的丝裂原活化蛋白激酶和Efg1介导的环腺苷酸/蛋白激酶A通路在内的相互连接的信号通路调控[9]。先前的研究表明,在两种突变体中,即过表达谷胱甘肽(GSH)还原酶的菌株(GLR1OE)以及同时破坏MG氧化还原酶和γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶的菌株(Δmgd1/grp2)/Δgcs1)[10],[11],其管家基因的表达水平相似。有趣的是,这两种突变体在所有能诱导菌丝生长的碳源或促进葡萄糖增殖的培养基中都能刺激酒精脱氢酶(ADH1)和糖酵解关键酶(包括Fba1和G-3-P脱氢酶(TDH3)的表达。已知GLR1OE能维持较高的细胞内GSH水平,对甲基乙二醛和氧化应激具有显著的抑制作用。相比之下,在GSH缺乏的(Δmgd1/grp2)/Δgcs1菌株中,甲基乙二醛和氧化应激会显著积累。
这两种突变体的双相性是由它们各自的氧化还原状态决定的。然而,与GSH介导的信号通路或参与甲基乙二醛和氧化应激剂(包括活性氧物种ROS)解毒的酶的活性相比,这两种突变体中糖酵解基因FBA1TDH3的表达所相关的氧化还原生理学和致病性/毒性并不一致。这些与代谢物含量预测不符的生理现象表明,在甲基乙二醛和氧化应激条件下可能存在糖酵解酶与非糖酵解酶之间的相互作用。这暗示了存在一种与经典氧化还原调节不同的平行调控机制,可能存在于GLR1OE和(Δmgd1/grp2)/Δgcs1突变体中。
假设Tdh3或Adh1可能是Fba1的结合伴侣,从而直接调节白色念珠菌中的甲基乙二醛生物合成。因此,本研究旨在探讨Fba1对与甲基乙二醛和氧化应激相关的代谢调节及其对致病性的影响。为此,研究人员研究了蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)和形态转变。重要的是,对排名最高的复合物进行的可视化分析显示,存在一个连续的溶剂通道,将Fba1产物的释放位点(F-1,6-P2生成G-3-P的位置)与Tdh3的催化裂隙连接起来。这支持了底物通道化的概念。在这种构象下,相互作用路径较短且几乎无障碍,使得Fba1产生的G-3-P能够立即被Tdh3捕获。因此,局部活性三磷酸盐的浓度降低,限制了其磷酸消除,从而减少了甲基乙二醛的生成。这一机制在源头上减少了甲基乙二醛的产生,并解释了在酵母中观察到Fba1和Tdh3相互作用时甲基乙二醛水平下降和致病性表型减弱的现象。这种计算机模拟机制与体内体外研究结果一致:Fba1和Tdh3复合物降低了甲基乙二醛的水平并减少了致病性。
在本研究中,重组酶测定以及通过质谱支持的共免疫沉淀(Co-IP)证实了这些糖酵解酶之间的物理相互作用和功能耦合。参考研究使用了Co-IP、配体筛选和免疫印迹技术来验证Fba1和Tdh3之间的直接相互作用。此外,补充的凝胶分析确认了重组Fba1和Tdh3的天然分子量和酶活性。这一生物学框架为基于结构的分析方法提供了依据,该方法利用分子对接技术生成、排序和验证Fba1-Tdh3复合物的候选模型,以供后续假设评估。本研究为理解白色念珠菌的氧化还原调节与致病性之间的关系提供了宝贵的见解,特别强调了FBA1表达在甲基乙二醛生成中的调控作用。我们通过GSH依赖的氧化还原调节以及Fba1突变体中相关代谢物的变化提供了证据,这些变化是由PPIs促进的。

部分片段

化学物质和试剂

试剂使用三次蒸馏水(TDW)制备,并根据实验要求进行过滤、灭菌或高压灭菌。这些试剂储存在玻璃容器中。GSH、单溴双曼(mBBr)、40%商业甲基乙二醛溶液和异丙基β-D-1-硫代半乳糖吡喃苷(IPTG)购自Sigma-Aldrich(美国密苏里州圣路易斯)。酵母提取物、蛋白胨、D-甘露醇和微琼脂购自Duchefa Biochemie(荷兰)。D-葡萄糖购自其他供应商。

Fba1同源物的比较序列分析和进化保守性

采用MSA方法分析了白色念珠菌(Ca)、汉森德氏酵母(Dh)和酿酒酵母(Sc)的Fba1同源物。白色念珠菌的Fba1基因(CaO19.4618;http://candidagenome.org/)编码一个含有360个氨基酸、分子量为39,215 Da的多肽(http://web.expasy.org/compute_pi/)。为了比较序列和结构域组织的相似性,评估了真菌菌株(图1A)和其他生物体(图S3)。使用多种算法(包括MAFFT、Clustal Omega)生成了MSA。

讨论

选择白色念珠菌的Fba1和Tdh3(GAPDH)作为目标蛋白对是基于实验证据,这些证据表明Fba1作为诱饵蛋白与Tdh3形成化学计量的复合物。这些复合物参与甲基乙二醛水平的调节和致病性。参考研究使用了Co-IP、配体筛选和免疫印迹技术来确认Fba1和Tdh3之间的直接相互作用。这一生物学背景为基于结构的分析提供了依据。

结论

Fba1与Tdh3结合参与甲基乙二醛的生物合成,并通过DHAP作为甲基乙二醛的储存单位。在高碳源流入的情况下,这调节了白色念珠菌的细胞生长和致病性,维持了碳的平衡分布。Fba1-Tdh3结合复合物直接影响细胞的命运决定并调节致病性基因,从而影响白色念珠菌的致病性。值得注意的是,FBA1TDH3基因的调节与ADH1基因的表达同时发生。

CRediT作者贡献声明

Sa-Ouk Kang:撰写——审稿与编辑、验证、监督、资源提供、方法学设计、实验实施、概念构建。MyungHee Ku:撰写——初稿撰写、数据可视化、验证、方法学设计、实验实施、数据分析、概念构建。Min-Kyu Kwak:撰写——审稿与编辑、初稿撰写、数据可视化、验证、软件使用、资源提供、项目管理、方法学设计、实验实施、资金获取、数据分析

伦理批准和参与同意

不适用。

出版同意

不适用。

数据和材料的可用性

本研究中使用和/或分析的数据集可应要求向相应作者索取。

作者披露声明

所有作者均声明与本研究无关的任何利益冲突。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的可能会影响本文工作的利益冲突或个人关系。

数据可用性

数据可应要求提供。

资助

作者声明本研究得到了BK21研究奖学金以及韩国国家研究基金会(NRF)的资助(由韩国政府MSIT提供,项目编号NRF-2021R1F1A1061581)。

致谢

我们感谢W.A. Fonzi、M. Whiteway和G.R. Fink提供白色念珠菌菌株和质粒。同时感谢首尔国立大学NCIRF支持2D-LC MS/MS实验。

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