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针对鸽轮状病毒A型(PiRVA)的RT-RAA-CRISPR/Cas12a可视快速检测方法的首次建立与应用
为解决鸽轮状病毒A型(PiRVA)快速、精准检测的难题,研究人员首次结合逆转录重组酶辅助扩增(RT-RAA)、CRISPR/Cas12a系统与侧向流动试纸条(LFS),建立了一种可视化快速检测方法。该方法特异性好、灵敏度高(16.8 copies/μL)、重复性佳,且无需依赖昂贵仪器,为PiRVA的现场诊断和流行病学监测提供了强有力的技术工具。
来源:Microorganisms
时间:2026-03-27
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I-E型CRISPR-Cas系统的免疫效能:靶点错配类型与crRNA种子序列协同调控干扰与引动作用
本研究关注I-E型CRISPR-Cas系统的免疫活性如何受到靶点突变的影响。针对靶点在PAM(原间隔序列相邻基序)和种子区域(seed region)的错配会如何影响RNA引导的干扰(interference)和引动新间隔序列获取的“引动”(priming)活性,目前缺乏对crRNA序列本身贡献的系统性研究。为此,研究人员构建了携带不同种子序列crRNA的四种E. coli菌株,利用高通量质粒库筛选和体外生物化学方法,系统探究了种子序列组成对错配耐受性的影响。结果表明,虽然靶点突变位点及其碱基类型是决定免疫结果的重要因素,但相应的crRNA序列同样强烈影响着靶点突变后的免疫结局,揭示了错配类型对Cascade-Cas3复合体构象、靶点结合及Cas3招募动力学的综合调控机制,深化了对CRISPR免疫精准性与适应性的理解。
来源:Journal of Biological Chemistry
时间:2026-03-27
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综述:机器学习增强的侧向层析检测用于现场传染病诊断
这篇综述系统探讨了侧向层析检测(LFA)在传染病诊断中的当前应用及其与机器学习(ML)整合的变革潜力。文章指出,尽管传统LFA因快速、便携、低成本而广泛应用,但其灵敏度、定量能力与主观视觉解读仍是局限。新兴的纳米材料、信号放大策略与ML图像分析(如CNN、SVM)正推动LFA向数字化、定量化、高灵敏度的现场诊断(PoC)系统演进,有望提升诊断标准,并支持大规模的疾病监测。
来源:Lab on a Chip
时间:2026-03-27
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综述:CRISPR在现代植物育种中的作用:通过无转基因基因组编辑克服育种障碍和立法挑战
本篇综述系统评述了CRISPR/Cas系统在现代植物育种中的革命性角色,重点关注其如何通过无转基因基因组编辑(transgene-free genome editing)策略,在精准改良作物抗病性、产量、非生物胁迫耐受性等关键农艺性状的同时,有效应对转基因作物(GM crops)所面临的严格立法与监管挑战(如欧盟的GMO法规)。文章对比了传统育种、转基因技术与基因组编辑技术的优劣,并详细阐述了CRISPR/Cas9、碱基编辑(base editing)、核糖核蛋白复合体递送(RNP delivery)及病毒载体递送等前沿技术,旨在为培育符合未来粮食安全需求且易于监管审批的新一代作物品种提供科学路径。
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无痕基因编辑新策略:基于内源性抗性标记的 CRISPR/Cas9pyrR系统在恶性疟原虫研究中的应用
本文为解决现有基因编辑方法依赖外源药物筛选标记导致迭代编辑受限的难题,研究人员开发了一种称为 CRISPR/Cas9pyrR的新型基因编辑策略。该策略通过共转染两个质粒,在对目的基因进行编辑的同时,将乙胺嘧啶(PYR)抗性突变引入内源性pfdhfr-ts基因,从而实现不依赖外源标记的转基因寄生虫筛选。研究人员成功利用该方法对核膜相关蛋白 PfGEX1 和核孔蛋白 PfNUP116 进行了 C 端标记,并揭示了它们在配子体发育中的特异性表达和动态定位,为研究疟原虫有性分化的核周区动态组成变化提供了新工具和新见解。这项工作极大地补充了恶性疟原虫研究的遗传学工具箱,并为连续遗传改造提供了有效新方法。
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甘薯花青素合成与叶形态调控基因簇的全基因组关联分析与功能解析
本研究针对甘薯(Ipomoea batatas)重要的农艺性状——花青素色素沉积和叶片形态的遗传基础不清、调控机制不明的核心问题,整合了全基因组关联分析(GWAS)、转录组学、比较基因组学和功能验证等多种技术手段。研究发现叶片花青素积累受5号染色体上IbMYB2/3等串联MYB转录因子簇的调控,而块根色素沉积则由同一染色体上另一空间上独立的IbAOMT、Ib3GGT、IbLDOX等花青素合成基因簇控制,揭示了器官特异性的调控结构。同时,定位了控制叶片裂叶形态的7号染色体主效位点,并通过CRISPR/Cas9敲除验证了候选基因g26165的功能。该研究不仅为甘薯精准育种提供了关键基因靶点,也为理解复杂性状的遗传结构和演化机制提供了新见解。
来源:Plant Biotechnology Journal
时间:2026-03-26
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番茄CRISPR/Cas9编辑效率与修复特征的大规模解析:染色质可及性、序列偏好及跨物种保守性揭示
本研究针对植物CRISPR/Cas9编辑效率预测模型跨物种适用性差、修复机制不清的问题,构建了包含420个sgRNA靶向137个番茄基因的protoplast数据集,结合ATAC-seq和MARS-seq分析发现:染色质可及性显著正向调控编辑效率,启动子和内含子编辑效率略高于外显子,转录活性无显著影响;高效编辑子集中富集长缺失(>20 bp)和微同源介导的末端连接(MMEJ)特征,且A/T富集序列驱动跨物种保守的修复偏好。结果为植物sgRNA设计提供了表观遗传和序列层面的新依据。
来源:The Plant Journal
时间:2026-03-26
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对大肠杆菌B株和K12株的基因组位点进行系统研究,以探讨其基因组整合机制;该研究在无质粒的虾青素生产中的应用
CRISPR-Cas9方法优化实现E. coli BL21和MG1655高效整合17.5-9.5kbp DNA片段,系统评估10个基因组位点发现宿主和位点选择对表达影响显著,成功构建无质粒虾青素合成菌株产率达426 mg/L。
来源:Metabolic Engineering
时间:2026-03-26
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高亲和力分裂HaloTag系统:活细胞蛋白标记与多色荧光成像的新利器
为解决活细胞内源性蛋白标记依赖大片段标签、难以兼容多色成像的问题,研究人员开发了由14残基短肽标签Hpep与无活性大片段cpHaloΔ3组成的高亲和力分裂HaloTag系统。该系统通过CRISPR/Cas9实现无克隆内源性标记,支持活细胞/固定细胞互补及Expansion microscopy、live-cell STED成像,其变体可通过荧光寿命显微镜同时成像两种Hpep标记蛋白,为化学生物学提供多功能工具。
来源:Nature Communications
时间:2026-03-26
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IscB基于RNA盖子的失活机制及其“踏板式”激活的冷冻电镜结构解析
为解决传统CRISPR-Cas系统(如Cas9)尺寸过大、体内递送效率受限的问题,研究人员以IscB(一种源于转座子相关OMEGA系统、尺寸仅为Cas9约40%的紧凑型RNA引导核酸酶)为研究对象,利用冷冻电镜(cryo-EM)解析了其从静息状态到完全激活状态的结构轨迹。研究揭示了IscB独特的双重RNA盖子自抑制机制,以及一个类似于“汽车踏板”的、由≥11-nt靶向配对触发的逐步激活模型。该工作阐明了IscB调控的分子基础,并鉴定出其铰链(hinge)区域可作为工程化热点,成功构建了在细胞中编辑效率更高的IscBHig1和IscBHig2变体,为设计更紧凑、高效的基因组编辑工具提供了新见解。
来源:Nature Structural & Molecular Biology
时间:2026-03-26