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通过工程改造的紫色细菌(Chromobacterium violaceum)实现壳聚糖废物的一步生物升级转化生成紫罗兰素
通过构建CRISPR编辑的工程菌株Chromobacterium violaceum,成功将壳废物中的壳聚糖转化为高价值 violacein。筛选出cv_4240、cv_1440、cv_2935为关键水解基因,并验证PTS途径在氮吸收中的核心作用。工程菌株WT/pBAD-4实现结晶/非结晶壳聚糖最高159.78 mg/L产率,为环保型壳废物高值化提供新路径。
来源:ACS Synthetic Biology
时间:2025-11-25
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通过理性工程改造谷氨酸棒状杆菌以实现L-谷氨酰胺的生物合成
L-Gln产量通过代谢工程策略提升至58.96 g/L,包括CRISPR/Cas12a敲除、异源GS筛选、RBS优化、sRNA抑制glnE、定点突变GS及动态调控ODHC。
来源:Biochemical Engineering Journal
时间:2025-11-25
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从基因组信号到预测工具:噬菌体-宿主预测的关键特征分析与严格基准测试
本研究针对病毒-宿主相互作用预测工具性能评估标准不一、可用性差异大的现状,系统回顾并严格评估了27种预测工具。研究人员构建了RefSeq-VHDB和MetaHiC-VHDB两个基准数据集,发现CHERRY和iPHoP等工具具有广泛适用性,而RaFAH和PHIST在特定场景表现优异,揭示了预测准确性、预测率与计算成本之间的关键平衡,为研究者选择工具和推动方法创新提供了实用指南。
来源:Briefings in Bioinformatics
时间:2025-11-25
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利用CRISPR/Cas9系统对人类纤维肉瘤细胞中的I型胶原α基因进行突变
衰老相关胶原蛋白信号通路与细胞周期调控研究,通过CRISPR/Cas9编辑COL1A1基因验证突变,发现编辑后细胞胶原蛋白减少、SA-β-gal活性升高,并伴随CDC2/CDk2/cyclin D表达上调及MMP-1/-2/-9、AKT/p-mTOR表达下降,揭示胶原蛋白代谢与衰老表型的关联性。
来源:Biochemistry
时间:2025-11-25
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G-四联增强型DNA银纳米簇使CRISPR/Cas12a系统能够实现对鼠伤寒沙门氏菌的超灵敏检测
CRISPR/Cas12a检测系统通过引入G-四联体激活DNA提升银纳米团簇发光强度,优化合成后构建G-DACA平台,实现沙门氏菌检测限1 CFU/mL、动态范围10-10^8 CFU/mL,在巴氏杀菌乳中验证回收率81.06%-102.33%及低标准偏差(7.17%-14.84%),为食品和临床诊断提供经济灵活方案。
来源:Journal of Agricultural and Food Chemistry
时间:2025-11-25
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一种与食品相关的耐热醋酸杆菌(Acetobacter oryzifermentans)AAB5菌株的功能基因组学:应激反应的遗传决定因素、纤维素酶(CAZyme)库以及CRISPR-Cas系统
嗜温菌Acetobacter oryzifermentans AAB5基因组揭示其代谢多样性及工业发酵潜力,含2,986个CDSs,携带4个CRISPR阵列及罕见的I-F型CRISPR-Cas系统,并含17.7kb噬菌体区。基因组解析显示其拥有69个CAZyme基因,以GTs和GHs为主,支持纤维素合成、酚类降解及复杂碳水化合物利用,为传统酿造工艺提供新菌种资源。
来源:Functional & Integrative Genomics
时间:2025-11-25
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生成一种三标签敲入小鼠模型,以可视化大脑发育过程中II型经典黏附蛋白的精确定位模式
钙黏蛋白Cdh6和Cdh8在胚胎大脑发育中通过CRISPR/Cas9敲入技术验证其动态蛋白表达与亚细胞定位,发现其在中线隔区域和轴突中的生理积累,揭示类型II经典钙黏蛋白对脑区分隔的关键作用。
来源:Genes to Cells
时间:2025-11-25
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SpCas9内部结构域替换的结构与功能解析:为蛋白质工程开发新型碱基编辑工具
本研究针对CRISPR-Cas9系统功能扩展中结构完整性保持的挑战,通过结构生物学和生化分析鉴定出SpCas9 C端区域(1242-1263)可作为功能域替换位点。研究人员成功将TadA8e脱氨酶整合至该区域,构建的Cas9-CTD-ABE变体在体外和体内均展现与ABE8e相当的编辑效率,且可通过 linker设计调控编辑窗口,为开发更精准的基因组编辑工具提供了新策略。
来源:Scientific Reports
时间:2025-11-25
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CRISPR/Cas9介导的epsA基因敲除证实了其在乳酸菌外多糖合成中的关键作用
本研究以新疆传统发酵乳制品中分离的三株高产胞外多糖(EPS)乳酸菌为对象,通过全基因组测序和比较基因组分析,发现epsA基因是调控EPS合成的关键基因。采用CRISPR/Cas9技术敲除该基因后,EPS产量显著降低,证实其重要性。研究结果为乳酸菌EPS高产菌株的筛选和遗传改良提供了理论依据。
来源:Food Bioscience
时间:2025-11-25
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一种一体化光控CRISPR-Cas12b系统,结合环介导等温扩增技术,用于肺炎支原体的即时检测
本研究通过NPOM修饰gRNA解决HOLMESv2系统因CRISPR过早切割导致的灵敏度低问题,光控激活后检测MP肺炎病原体灵敏度达133倍(7.5 copies/μL),结合手机读取器实现便携低成本诊断,临床样本检测显示99.0%敏感性和100.0%特异性。
来源:ACS Sensors
时间:2025-11-25