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研究揭示了霍乱弧菌O1中驱动霍乱传播和严重程度的关键遗传因素，突出了新的治疗策略的靶点。
霍乱，这一由霍乱弧菌引起的急性腹泻疾病，每年威胁着全球数百万人的生命健康。在孟加拉国等流行地区，霍乱的致死率尤为严重。最近，一项发表在《Nature Communications》上的研究为防治霍乱提供了新的科学依据。
霍乱弧菌的O1血清群，包括稻叶和小川血清型，其变异导致了2022年的霍乱疫情。新变种的出现暗示了细菌的进化，而基因突变增加了细菌的传播性和毒力。因此，了解这些遗传变化对于开发新疗法、降低疾病负担具有重要意义。
研究人员采用了机器学习、基因组尺度代谢建模（GSSM）和三维（3D）分析相结合的方法，以确定霍乱弧菌传播和疾病严重程度的遗传因素。他们分析了2015至2021年间，来自孟加拉国不同地区的129株霍乱弧菌，这些菌株来自腹泻住院患者的粪便样本。研究人员还收集了参与者的临床数据，包括腹泻、腹痛、大便频率、脱水和呕吐等症状。
研究人员首先培养霍乱弧菌，然后使用单克隆抗体进行血清分型，并通过全基因组测序（WGS）确认了分离株。此外，还进行了抗生素敏感性试验，并分析了来自非洲、印度、也门和海地的1140株霍乱弧菌的WGS数据。
在对BD-1.2菌株的遗传特征进行分析时，研究人员考虑了多个决定因素、辅助基因、核心性状和突变或单核苷酸多态性（SNPs）。他们进行了泛基因组分析和系统发育分析，以确定BD-1.2与其他菌株之间的遗传差异。
研究发现，SXT相关整合偶联元件（SXT ICE）、Vibrio致病岛1（VPI-1）、Vibrio第七大流行岛II（VSP-II）、霍乱毒素B亚基（ctxB）和gryA等位基因的突变增加了BD-2和BD-1.2的传播性和毒力。这些基因变化与临床症状和疾病严重程度相关。
此外，与转录调控、蛋白质稳定性和代谢相关的基因之间的相互作用，如易位和组装模块亚基T（tamA）、17千道尔顿蛋白（skp）、半胱氨酸（cysG）和氯通道辅助（clcA）等基因，增加了霍乱弧菌的肠道定植和耐酸性。
这项研究揭示了霍乱弧菌的遗传进化，特别是在孟加拉国，确定了核心基因和辅助基因的基因突变，这些基因增加了该生物体的传播和毒力。基因组分析揭示了与临床症状相关的BD-2和BD-1.2等位基因变异之间的致病性和传播机制差异。
霍乱弧菌的遗传复杂性表明需要先进的技术和战略来管理霍乱暴发。这项研究不仅为理解霍乱弧菌的致病性提供了新的视角，而且为开发新的防治策略奠定了基础。
通过这项研究，我们不仅能够更好地理解霍乱弧菌的传播机制和疾病严重程度的遗传驱动因素，而且为全球范围内的霍乱防治工作提供了重要的科学支持。随着对霍乱弧菌遗传特性的深入了解，我们有望开发出更有效的防治策略，以减少这种疾病对人类健康的影响。
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