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本研究通过平行代谢组学和[U-13C]葡萄糖同位素示踪技术,系统评估了黑色素瘤患者肿瘤与匹配PDX(患者来源异种移植)模型的代谢特征差异。研究发现PDX模型虽保留原始肿瘤的TCA循环标记特征,但糖酵解代谢物标记增强,并鉴定出100种受宿主生理、饮食和微生物群影响的物种特异性代谢物。值得注意的是,近200个PDX样本中多数能维持跨越6代传代的"代谢指纹",为癌症代谢研究提供了高/低保真度的模型资源。
在癌症研究领域,患者来源异种移植(PDX)模型被誉为临床前研究的"黄金标准",但其代谢特征是否真实反映人类肿瘤特性始终存在争议。黑色素瘤作为代谢高度异质性的癌种,其PDX模型的代谢保真度更缺乏系统评估。这一空白不仅影响基础研究结论的可靠性,更可能误导靶向代谢疗法的开发。
德克萨斯大学西南医学中心(University of Texas Southwestern Medical Center)的研究团队在《Nature Metabolism》发表突破性研究。通过创新性地建立手术中[U-13C]葡萄糖输注的平行工作流程,研究人员首次实现人类黑色素瘤与匹配PDX模型的直接代谢比对。研究纳入33例患者样本(含16例BRAFV600E突变),成功构建23个PDX模型(成功率70%),并采用LC-MS/GC-MS对199个样本进行多组学分析。
关键技术包括:1)术中[U-13C]葡萄糖输注示踪技术;2)PDX模型的连续传代(至第6代);3)基于HILIC色谱-高分辨质谱的代谢组学;4)组织病理学与Ki-67增殖指数分析。研究特别关注淋巴转移灶(占样本61%),通过比较代谢物z-score欧氏距离评估模型保真度。
同位素示踪显示:
通过144种非宿主特异性代谢物构建的代谢图谱显示:
该研究创建了首个PDX代谢保真度评估框架,其发现具有双重价值:
研究同时指出局限性:皮下移植可能低估非黑色素瘤的代谢适应,后续需开展原位移植验证。这些发现为精准选择临床前模型提供了代谢维度的重要依据,将显著提升转化医学研究的可靠性。
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