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本研究发现PRDM16(PR结构域蛋白家族成员)在衰老器官和衰老细胞中显著下调,其缺失会加速多器官衰老及相关疾病。机制上,PRDM16通过结合GSTM1启动子区域上调其转录,增强谷胱甘肽代谢,抑制氧化DNA损伤,从而延缓细胞衰老。该研究为抗衰老治疗提供了新的潜在靶点。
研究团队通过分析年轻(2月龄)与老年(24月龄)小鼠的多器官样本,发现PRDM16 mRNA水平在肾脏、心脏、肺和胃中均显著降低。在人类肾脏皮质转录组数据(NephroSeq数据库)中,PRDM16表达与年龄呈负相关。类似趋势也见于心脏、脑 hippocampus、肺和胃组织(基于ADEIP平台数据),但肝脏中未观察到这一现象。免疫组化和Western blot结果进一步证实,PRDM16蛋白在老年小鼠肾脏中表达减少。在体外,通过X射线照射、D-半乳糖(D-gal)、博来霉素(BLM)和阿霉素(DOX)处理诱导人肾小管上皮细胞(HK-2)、支气管上皮细胞(Beas-2B)和心肌细胞(H9C2)衰老后,PRDM16的mRNA和蛋白水平均下降。
研究构建了Prdm16全身性敲除(KO)小鼠。3周龄KO小鼠多个器官(包括肾脏、心脏、肺、海马体、胃和肠道)中衰老标志物(如Cdkn1a、Cdkn2a、Tp53)和衰老相关分泌表型(SASP)相关基因(如Il6、Il1b、Tnf、Tgfb1)表达上调。9月龄KO小鼠血清中IL-1β、CCL2、IL6、G-CSF和CCL4等细胞因子水平升高。单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析显示,KO小鼠肾脏中多种细胞类型(如远曲小管细胞、内皮细胞、巨噬细胞和基质细胞)的差异表达基因显著富集于DNA损伤相关通路。此外,KO小鼠肾脏中衰老相关β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)活性及p21和Bcl-2表达增加,肺中p16阳性细胞比例上升。
与野生型(WT)小鼠相比,9月龄Prdm16 KO小鼠体型更小、体重更轻,且粪便负荷积累率与24月龄WT小鼠相当。scRNA-seq显示KO小鼠肾脏细胞组成比例发生变化,近曲小管(PCT)和内皮细胞的健康标志基因下调,巨噬细胞激活。免疫组化显示肾脏纤维连接蛋白表达增加,透射电镜(TEM)显示肾小管上皮细胞线粒体结构损伤、密度和长度减少。肺中胶原IV沉积增加。心脏超声显示KO小鼠射血分数(EF)、缩短分数(FS)、心输出量和每搏输出量下降,但心重/体重比(HW/BW)和心肌细胞横截面积增加。握力测试、旋转棒实验和莫里斯水迷宫(MWM)测试表明KO小鼠运动能力和学习记忆能力受损。肝脏出现脂滴沉积,皮肤毛囊数量减少。
利用Cre-LoxP系统构建肾小管特异性Prdm16敲除小鼠(Ksp-Cre/Prdm16fl/fl)。8周龄时,这些小鼠肝肾功能、血糖水平与对照组(Prdm16fl/fl)无差异,心脏、肾脏、肺等器官结构正常。通过X射线照射(10 Gy)诱导肾脏衰老后,KO小鼠肾脏中p21、Bcl-2、纤维连接蛋白和α-SMA表达增加,Masson染色显示胶原沉积增多。在照射基础上行单侧缺血再灌注(UIRI)手术,KO小鼠肾功能更差,衰老和纤维化标志物表达更高,SA-β-gal活性和胶原沉积也增加。
在HK-2细胞中,慢病毒过表达PRDM16可改善照射引起的细胞形态学衰老特征(如细胞体积和核体积增大、扁平化),降低SA-β-gal活性、γ-H2AX(DNA损伤标志)表达以及衰老和SASP相关蛋白水平。在D-gal诱导的衰老模型中,PRDM16同样抑制衰老标志物上调。在23月龄老年小鼠肾脏皮质注射PRDM16过表达慢病毒,1个月后检测发现PRDM16表达增加,衰老标志物(Bcl-2、p21)、SA-β-gal、γ-H2AX以及纤维化标志物(纤维连接蛋白、α-SMA)和胶原沉积均减少。
联合分析小鼠肾脏scRNA-seq数据和照射HK-2细胞的RNA-seq数据,发现PRDM16调控氧化应激相关通路。Prdm16缺失加剧照射小鼠肾脏中8-氧代-脱氧鸟苷(8-oxo-dG,氧化DNA损伤标志)表达;在HK-2细胞中,PRDM16过表达降低照射引起的8-oxo-dG和活性氧(ROS)水平。基因集富集分析(GSEA)显示,Prdm16缺失小鼠PCT中“谷胱甘肽代谢过程”相关基因集富集程度下降。Prdm16缺失下调多种谷胱甘肽代谢相关基因表达。PRDM16特异性上调谷胱甘肽合成限速酶Gclc表达,提高照射HK-2细胞和老年小鼠肾脏中的谷胱甘肽/氧化型谷胱甘肽(GSH/GSSG)比值和谷胱甘肽-S-转移酶(GST)活性。
基于Cistrome DB中PRDM16的ChIP-Seq数据,发现PRDM16结合多个GST家族成员启动子区域,其中GSTM1和GSTT2结合得分最高。在衰老小鼠肾脏和心脏中,GSTM1下调程度大于GSTT2。在衰老细胞和老年小鼠肾脏中,GSTM1表达降低,而PRDM16过表达上调其mRNA和蛋白水平。双荧光素酶报告实验显示PRDM16沉默降低GSTM1启动子活性。染色质免疫沉淀(ChIP)实验证实PRDM16结合GSTM1启动子上的两个预测结合位点,该结合在野生型小鼠肾脏中存在,而在Prdm16 KO小鼠中缺失。
在D-gal诱导的衰老HK-2细胞中,沉默PRDM16增加衰老和纤维化标志物表达,而过表达GSTM1可逆转这一效应。沉默PRDM16加剧照射引起的SA-β-gal、γ-H2AX和ROS水平升高,GSTM1过表达可挽救这些损伤。在照射的Prdm16fl/fl和Ksp-Cre/Prdm16fl/fl小鼠肾脏中注射GSTM1过表达慢病毒,可增加GSTM1表达,减轻Prdm16缺失导致的衰老标志物、8-oxo-dG表达升高和肾脏纤维化。
本研究首次揭示PRDM16在衰老过程中表达下调,其缺失加速多器官衰老和相关疾病,而PRDM16基因递送可延缓衰老。机制上,PRDM16通过上调GSTM1转录,增强谷胱甘肽代谢,抑制氧化DNA损伤。GSTM1过表达能挽救PRDM16缺失引起的衰老表型。这些发现为抗衰老治疗提供了新靶点。未来研究方向包括开发靶向PRDM16的基因疗法或小分子化合物。
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