p53通过增强磷脂头基回收调控细胞衰老的代谢稳态新机制

时间:2026年1月8日
来源:Nature Cell Biology

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本文揭示p53激活通过上调自噬(autophagy)和溶酶体(lysosome)代谢程序,促进磷脂酰乙醇胺(PE)合成关键中间体磷酸乙醇胺(PEtn)的回收利用,为衰老细胞膜磷脂合成提供头基来源。研究通过CRISPR-Cas9筛选发现p53激活细胞特异性依赖脂代谢基因,阐明转录因子调控细胞状态转换中代谢适应的新机制。

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细胞状态转换中的代谢适应
细胞状态改变往往伴随代谢需求的转变,维持稳态需要细胞适应变化。衰老(senescence)作为重要细胞状态改变,与代谢的显著变化相关,包括脂代谢增强。然而细胞如何适应这些改变尚不清楚。本研究揭示转录因子p53通过增加磷脂头基回收,满足衰老期间膜磷脂需求上升的机制。
p53激活诱导磷酸乙醇胺积累
为系统研究p53激活的代谢效应,研究采用两种胰腺导管腺癌(PDAC)细胞模型:KPsh细胞(多西环素(dox)撤除诱导p53激活)和KPfloxRIK细胞(dox诱导p53表达)。代谢组学分析发现,p53激活后最显著变化的代谢物是磷酸乙醇胺(PEtn)。这一现象在结直肠癌细胞HCT116(Nutlin-3a处理)和野生型p53小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)中得到验证,表明p53诱导PEtn积累不依赖于细胞谱系或致癌突变。
进一步实验表明,PEtn积累与p53诱导的衰老密切相关:依托泊苷诱导的p53非依赖性衰老足以增加PEtn;而Navitoclax将p53激活结果从衰老转变为凋亡时,PEtn积累被抑制。
p53增强膜磷脂合成
PEtn是Kennedy通路中磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰胆碱(PC)合成的关键中间体。脂质组学显示p53激活后PE、PC和磷脂酰丝氨酸(PS)均增加,且几乎所有膜脂质物种均升高。13C-葡萄糖示踪实验证实p53激活增强PE和PC的从头合成,代谢通量分析(MFA)表明葡萄糖来源碳对脂肪酸合成的贡献增加。
值得注意的是,胆碱(Cho)和丝氨酸在培养基中丰富,但乙醇胺(Etn)相对稀缺。在无外源Etn时,p53激活细胞仍能维持PEtn池,提示存在内源性Etn来源。13C-乙醇胺标记实验显示p53激活细胞中外源Etn对PEtn的贡献比例下降,证实内源性来源增强。
p53增加乙醇胺供应机制
研究发现p53通过多种途径增加PEtn供应:
  1. 1.
    鞘脂代谢:p53激活上调鞘脂合成和降解相关基因表达。肌素(Myriocin)抑制鞘脂合成或SPHK1基因敲除均特异性降低p53激活细胞的PEtn水平;而伏马菌素B1(Fumonisin B1)抑制鞘脂向神经酰胺转化则增加PEtn。
  2. 2.
    自噬-溶酶体途径:RNA-seq显示p53显著诱导自噬和溶酶体相关基因表达,包括直接靶点ATG7。氯喹(CQ)或巴弗洛霉素A1(BafA1)抑制溶酶体酸化和ATG7敲除均削弱p53诱导的PEtn积累。MEK抑制剂联合p53激活可协同增强PEtn积累,且依赖溶酶体功能。
乙醇胺回收支持p53激活细胞适应性
PCYT2是PEtn转化为CDP-乙醇胺的关键酶。PCYT2敲除导致PEtn积累,但在p53沉默细胞中仅引起轻微转录变化;而在p53激活背景下,PCYT2缺失触发显著转录重编程,内质网(ER)和线粒体相关基因上调。电镜显示p53激活的PCYT2缺失细胞出现线粒体被粗面内质网包裹的特殊结构,提示细胞通过增强细胞器接触补偿Kennedy通路缺陷。
功能上,PCYT2缺失在p53沉默时不影响细胞增殖和体内成瘤;但在p53激活时,体外增殖进一步抑制,体内肿瘤生长受阻。衰老相关β-半乳糖苷酶(SA-βgal)染色阳性率增加,表明PCYT2缺失增强p53激活细胞的衰老表型。
遗传筛选揭示p53特异性脆弱性
代谢基因CRISPR-Cas9筛选发现,p53激活细胞特异性依赖脂代谢、溶酶体V型ATP酶等功能基因。验证实验证实CERS2(神经酰胺合成酶2)和HNF4A(肝细胞核因子4α)在p53激活后成为必需基因:在p53沉默时敲除不影响生长,而在p53激活时导致增殖缺陷。
讨论
本研究阐明p53激活通过转录重编程增强膜磷脂合成,并通过自噬-溶酶体途径和鞘脂代谢回收磷脂头基,满足衰老细胞膜合成需求。这一机制揭示细胞状态特异性代谢适应,并为靶向p53激活细胞(如衰老细胞或特定肿瘤背景)提供潜在代谢脆弱性。

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