金银花中发现新型细胞弹状病毒:分类与基因组结构解析
时间:2025年3月8日
来源:Archives of Virology
编辑推荐:
研究人员通过高通量测序研究金银花病毒,发现新病毒 HaCV,明确其分类及基因组结构。
研究人员通过高通量测序,在表现出褪绿和斑驳症状的金银花植株中,鉴定出一种假定的新型细胞弹状病毒,暂时命名为 “金银花相关细胞弹状病毒”(HaCV)。本研究获得了 5 个分离株,它们均具有相似的基因组结构,长度在 13,891 到 13,930 个核苷酸之间,包含 8 个开放阅读框(ORFs)。除了编码 5 种典型蛋白核衣壳蛋白(N)、磷蛋白(P)、基质蛋白(M)、糖蛋白(G)和聚合酶蛋白(L)的 ORFs 外,这些分离株在 P 基因内有 1 个 ORF,在 P 和 M 基因之间有 1 个 ORF,在 G 和 L 基因之间有 1 个 ORF,分别编码假定蛋白 P′、P3 和 P6。尽管系统发育分析表明,这 5 个分离株都与小麦 α 细胞弹状病毒 1(TriACRV1)亲缘关系最近,但基因组序列比较显示,分离株 FQ3 与 TriACRV1 以及其他分离株的序列一致性水平低于细胞弹状病毒属(Cytorhabdovirus)的物种划分阈值(<75%),而其他 4 个分离株 ——FQ1、FQ2、FQ4 和 FQ5 与 TriACRV1 的序列一致性大于 75%。因此,根据目前的标准,分离株 FQ1、FQ2、FQ4 和 FQ5 应被视为 TriACRV1 的分离株,而分离株 FQ3 应被归类为一个新物种的成员。
生物通微信公众号
生物通新浪微博