TIPRL 基因：癌症研究的新突破 —— 泛癌生物信息学分析揭示其关键作用

时间：2025年3月17日

来源：Discover Oncology

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研究人员针对 TIPRL 基因在癌症中的作用开展泛癌分析，发现其与多种癌症相关，或可作诊疗新靶点。

在生命科学与医学领域，癌症一直是人类健康的巨大威胁。随着科技的进步，癌症研究不断深入，但仍有许多未知等待探索。TOR 信号通路调节蛋白样（TIPRL）基因在癌症发生发展中的作用逐渐受到关注，然而其在多种癌症中的全面特征尚未被充分研究。为了更深入地了解 TIPRL 基因在癌症中的角色，来自淄博市中心医院和滨州医学院等机构的研究人员展开了一项泛癌生物信息学分析研究，相关成果发表在《Discover Oncology》杂志上。

这项研究具有重要意义，它系统地探究了 TIPRL 基因在多种癌症中的表达特征、遗传变异、预后价值以及在免疫微环境中的潜在作用，为深入理解 TIPRL 基因在肿瘤生长、侵袭和治疗反应中的分子机制提供了全面视角，也为将 TIPRL 作为肿瘤生物标志物和治疗靶点提供了理论依据。

研究人员主要运用了以下关键技术方法：利用 R 软件、GEPIA2、UALCAN 平台等分析 TIPRL 基因在肿瘤和正常组织中的表达情况；借助 cBioPortal 评估 TIPRL 基因的遗传变异；通过 R 软件结合相关数据库和算法，研究 TIPRL 与 RNA 修饰、免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷（TMB）、微卫星不稳定（MSI）、同源重组缺陷（HRD）等的关联，并进行基因富集分析；使用 TCGA_GTEx 和 CPTAC 等数据集作为样本队列来源。

研究结果如下：

基因表达分析：通过对 TCGA_GTEx 数据集的分析，发现 TIPRL 在大多数癌症中表达升高，但在肾嫌色细胞癌（KICH）和急性髓系白血病（LAML）中表达显著降低。利用 CPTAC 数据集进一步评估蛋白质水平，发现其在部分癌症中高于正常组织，在部分癌症中低于正常组织。此外，在 KICH、肾乳头状细胞癌（KIRP）和肺鳞状细胞癌（LUSC）中，TIPRL 表达与肿瘤分期显著相关。
生存预后分析：将癌症样本分为高表达和低表达组，分析发现高 TIPRL 表达与肾上腺皮质癌（ACC）、乳腺癌（BRCA）、头颈部鳞状细胞癌（HNSC）、KICH、肝细胞癌（LIHC）和间皮瘤（MESO）等多种癌症的总生存期（OS）较差相关；还与 ACC、膀胱癌（BLCA）和 KIRP 的疾病特异性生存期（DSS）不良以及多个癌症的无进展生存期（PFI）较短有关，表明 TIPRL 可作为多种癌症预后的潜在标志物。
遗传变异分析：运用 cBioPortal 对 TCGA 数据进行评估，发现胆管癌（CHOL）中 TIPRL 基因改变频率最高，主要为扩增，肝癌（LIHC）、膀胱癌（BLCA）等多种癌症也存在不同频率的改变。错义突变是 TIPRL 最常见的遗传变异，且 TIPRL 改变对不同癌症的临床意义存在差异，如在胰腺癌（PAAD）中对 OS 和 DSS 影响不显著。
RNA 修饰分析：研究发现 TIPRL 与 RNA 修饰相关基因，尤其是参与 m¹A、m⁵C 和 m⁶A 修饰的基因，在多种癌症中呈强正相关，这表明 RNA 修饰可能影响 TIPRL 表达，并在癌症相关通路中发挥作用。
免疫浸润分析：TIPRL 表达与多种免疫细胞存在相关性，在不同癌症中与辅助性 T 细胞等呈正相关，与细胞毒性细胞等呈负相关。其与基质评分（StromalScore）、免疫评分（ImmuneScore）和 ESTIMATE 评分在部分癌症中呈负相关，在部分癌症中呈正相关，显示了 TIPRL 在肿瘤免疫微环境中的复杂作用。
TIPRL 与免疫检查点及调节基因分析：通过相关性分析，发现 TIPRL 在不同癌症中与多种免疫检查点和调节基因存在复杂的相关性，在部分癌症中呈正相关，在部分癌症中呈负相关，这体现了 TIPRL 在免疫调节中的复杂作用。
TIPRL 与 TMB、MSI 和 HRD 分析：研究表明 TIPRL 与 TMB、MSI 和 HRD 在多种癌症中存在相关性，如在 ACC、胶质母细胞瘤（GBM）等癌症中与 TMB 呈正相关，在部分癌症中与 HRD 呈正相关，这暗示 TIPRL 可能影响基因组的稳定性。
TIPRL 相关基因富集分析：利用 STRING 数据库和相关分析方法，发现 TIPRL 与多个基因存在显著相关性，并参与氧化磷酸化、mRNA 监测途径和自噬等关键过程，这些过程对肿瘤发生发展具有重要意义。

研究结论和讨论部分指出，TIPRL 在多种癌症中发挥着多方面的作用，它既可以作为预后标志物，也具有成为治疗靶点的潜力。TIPRL 基因的扩增、表达变化以及与 RNA 修饰、免疫细胞浸润、基因组稳定性和关键信号通路的关联，为癌症的诊断、治疗和预后评估提供了新的思路。虽然目前直接针对 TIPRL 的治疗策略尚未广泛应用于临床，但基于其在肿瘤相关过程中的关键作用，未来可探索多种潜在的治疗方法，如靶向相关通路、利用基因沉默技术等。然而，该研究也存在一定的局限性，如 TIPRL 表达在不同癌症中的差异较大，缺乏功能验证，其作为预后标志物可能受到多种因素的干扰等。尽管如此，这项研究依然为癌症领域的研究提供了重要的参考，为后续进一步探究 TIPRL 在癌症中的作用奠定了坚实的基础，有望推动精准肿瘤学的发展。