基于表面增强拉曼光谱(SERS)与机器学习(ML)的耳垢分析:头颈癌即时检测新曙光

时间:2025年4月3日
来源:npj Biosensing

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为解决头颈癌(HNC)早期诊断难题,研究人员开展了基于表面增强拉曼光谱(SERS)结合机器学习(ML),通过分析耳垢诊断 HNC 的研究。结果显示该方法诊断准确率达 87.2% ,为 HNC 的快速诊断提供了新途径。

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在全球范围内,癌症始终是严重威胁人类健康的重大挑战,而头颈癌(Head and Neck Cancer,HNC)作为全球第七大常见癌症类型,每年新发病例约 65 万,死亡人数约 33 万。HNC 起源于头颈部黏膜表面的鳞状细胞,涵盖口腔、咽、喉、鼻腔和鼻窦等部位的恶性肿瘤。早期诊断对于改善 HNC 患者的预后和生存率至关重要,然而,其初始症状隐匿,头颈部解剖结构复杂,使得临床检查和活检困难重重,许多患者确诊时已处于晚期。传统诊断方法,如组织活检和影像学检查,虽有一定效果,但存在侵入性强、费用高、耗时长等缺点。因此,开发一种无创、可靠且快速的即时检测(Point-of-Care,POC)诊断方法迫在眉睫。
在这样的背景下,来自德国耶拿弗里德里希・席勒大学物理化学研究所(Institute of Physical Chemistry,IPC)、耶拿莱布尼茨光子技术研究所等机构的研究人员,开展了一项极具创新性的研究。他们利用表面增强拉曼光谱(Surface-Enhanced Raman Spectroscopy,SERS)技术结合机器学习(Machine Learning,ML)算法,以耳垢为样本,旨在实现 HNC 的快速筛查诊断。该研究成果发表于《npj Biosensing》杂志。

研究人员在这项研究中运用了多种关键技术方法。样本方面,选取了德国耶拿大学医院 6 名健康志愿者和 7 名 HNC 患者的耳垢样本。样本预处理时,先将耳垢解冻,加入磷酸盐缓冲液(PBS),经过超声处理和离心,获取上清液用于后续检测。检测采用银涂层硅纳米柱 SERS 芯片,通过特定的孵育和干燥过程,利用表面张力使纳米柱倾斜,增强拉曼信号。光谱采集使用 WITec alpha300 R 共聚焦拉曼显微镜和 785nm 激光,在 600 - 2200 指纹区域收集光谱。光谱分析利用 Origin Pro 2022 软件进行基线校正、平滑和面积归一化处理。机器学习分析时,先对光谱数据进行裁剪和归一化,再运用主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)、t 分布随机邻域嵌入(t-SNE)和均匀流形近似与投影(UMAP)等降维算法处理数据,最后采用 PCA 结合线性判别分析(Linear Discriminant Analysis,LDA)构建分类模型,并通过留两人交叉验证评估模型性能 。

研究结果主要包含以下两方面:

  • 耳垢 SERS 分析:对 13 例耳垢样本(6 例健康对照,7 例 HNC 患者)进行 SERS 检测,发现健康样本和 HNC 样本的 SERS 光谱存在显著差异。在 1440 和 1208 处的主要谱带,分别对应蛋白质 / 脂质的/弯曲和 C - C 拉伸振动模式,其相对强度在两组样本间变化明显。此外,1004 、1131 和 1682 等特征峰在 HNC 患者样本中强度降低,这表明 HNC 患者耳垢中蛋白质浓度相对脂质较低,可能反映了癌症相关的代谢重编程。
  • 机器学习处理:运用 PCA、t-SNE 和 UMAP 等算法对光谱数据进行降维分析,结果显示 PCA 算法在后续分析中更具可解释性,因此被选用。进一步采用 PCA-LDA 构建分类模型,经交叉验证发现,当使用 10 - 15 个主成分时,模型性能最佳,此时灵敏度达 80%,特异性约 87%,平衡准确率为 85%,受试者工作特征曲线下面积(ROC AUC)约 90%。最终基于 10 个主成分训练的 PCA-LDA 模型对患者的预测结果显示,所有患者均被正确预测,但结合个体多次测量可能会进一步提高预测准确性。

在研究结论和讨论部分,该研究表明,基于 SERS 和 PCA-LDA 的耳垢分析有望成为 HNC 的有效 POC 诊断工具。与常用的唾液检测相比,耳垢受外部因素影响小,稳定性高,且采集无创、便捷。不过,当前研究存在一定局限性,如患者队列同质性较高,主要为 50 岁以上男性 HNC 患者,限制了对人口统计学和临床因素影响的研究。未来研究需扩大样本规模,纳入更多不同年龄、性别和肿瘤特征的患者,优化分析模型,进一步探究基于耳垢的 POC 诊断在 HNC 临床应用中的潜力。同时,还需规范样本采集、预处理和 SERS 分析流程,开发适用于临床的便携式、低成本 SERS 仪器,推动该技术从概念验证研究走向临床实践。总之,这项研究为 HNC 的早期诊断开辟了新方向,具有重要的临床意义和应用前景。

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