综述:CRISPR辅助的细胞因子生物分析传感

时间:2025年6月18日
来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry

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这篇综述系统阐述了CRISPR-Cas(成簇规律间隔短回文重复序列-相关蛋白)技术在细胞因子检测领域的突破性应用。通过整合抗体/适配体识别与CRISPR信号放大技术(如Cas12/Cas13的trans -切割活性),实现了对IL-6、IFN-γ等低丰度细胞因子的超灵敏检测(灵敏度达fg/mL级),为免疫监测、疾病诊断(如COVID-19细胞因子风暴)及个性化医疗提供了创新工具。

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Abstract
细胞因子作为先天性和适应性免疫反应的关键介质,其定量检测对疾病诊断和治疗监测至关重要。传统免疫分析法(如ELISA)存在操作繁琐、灵敏度有限等缺陷。CRISPR-Cas技术的出现为细胞因子检测带来革命性突破——通过将蛋白质信号转化为核酸信号,并利用Cas12a/Cas13a的trans
-切割活性实现指数级信号放大,灵敏度较传统方法提升102
倍以上。

Introduction
细胞因子网络的高度复杂性和低浓度特性(6–70 kDa)使其检测面临挑战。CRISPR-Cas系统凭借其精准的核酸识别能力,通过"抗体-ssDNA转换探针"或"适配体-DNAzyme"等设计,将IL-4、TNF-α等非核酸靶标转化为可被Cas蛋白识别的核酸信号。例如,CLISA(CRISPR-Linked Immunosorbent Assay)通过T7 RNA聚合酶扩增DNA模板,触发Cas13对RNA报告分子的非特异性切割,实现IL-6的飞克级检测。

技术原理
CRISPR-Cas系统分为Class 1(多蛋白复合体)和Class 2(单一效应蛋白,如Cas9/Cas12/Cas13)。其中Cas12a/dCas13a通过crRNA引导识别目标核酸后,激活对单链DNA/RNA(ssDNA/ssRNA)的" collateral cleavage"(旁路切割)活性,释放荧光标记物产生信号。例如:

  • 电化学平台E-CRISPR通过TGF-β适配体竞争结合触发Cas12a切割ssDNA报告分子
  • 光激活纳米器件利用UV切割的PC-DNA探针结合IFN-γ后激活Cas12a
  • 多路检测系统GUSCI可同步分析IL-6/IL-8/MMP-3等5种炎症标志物

应用案例

  1. CLISA技术:将传统ELISA的酶标抗体替换为DNA标记抗体,被捕获的IL-6通过链霉亲和素-生物素系统连接触发DNA,激活Cas12a切割荧光报告分子,灵敏度达58.8 aM。
  2. 光电化学传感器:基于2D TAPP-DHTA COF材料构建的IL-4检测系统,通过免疫-HCR反应产生DNA激活链,驱动Cas12a切割MoS2
    量子点标记的ssDNA,催化聚苯胺(PANI)沉积增强信号。
  3. CRUISE通用平台:整合CRISPR与常规免疫分析,通过抗体-ssDNA偶联物实现IFN-γ的pg/mL级检测,线性范围跨越5个数量级。

技术优势
相较于传统方法,CRISPR-Cas传感系统具有:

  • 超高灵敏度:CAFI技术对IFN-γ的检测限较ELISA提升1000倍
  • 多路复用能力:CRISPR-ELISA可同步检测IL-6/IL-8/IL-10
  • 实时监测:光激活纳米器件实现T细胞IFN-γ分泌的动态追踪
  • 成本效益:Cas蛋白与gRNA可大规模合成,适配体探针可重复使用

未来展望
前沿研究方向包括:

  1. 体内实时监测:开发CRISPR整合的微针贴片用于细胞因子动态捕获
  2. 穿戴式设备:将Cas13a传感器嵌入柔性电子器件实现持续炎症监测
  3. 人工智能辅助设计:通过机器学习优化gRNA序列提升检测特异性
  4. 临床转化:推动CRISPR检测试剂盒在脓毒症、肿瘤免疫治疗中的应用

Conclusion
CRISPR-Cas技术通过精准的分子识别与高效的信号放大机制,正在重塑细胞因子检测范式。尽管在标准化、自动化方面仍需突破,其卓越的性能指标和模块化设计理念,必将推动个性化医疗和精准诊断进入新纪元。

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