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来自国际团队的研究人员通过单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)分析，揭示了肝脏细胞状态交互eQTL(ieQTL)在代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)中的关键作用。研究对48例肝脏活检样本进行测序，鉴定出3,500余个跨细胞类型的sc-eQTL，发现ieQTL显著富集疾病遗传力(OR=10.27)，并构建了包含转录因子、细胞状态、ieSNP和ieGene的601个功能"四联体"。特别揭示了FOXO1基因型特异性调控EFHD1的eQTL丢失现象，为个体化治疗提供了新靶点。
这项突破性研究采用单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)分析技术，对25例代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者和23例健康对照者的肝脏活检样本进行深度解析。研究发现跨越主要肝脏细胞类型的3,500多个sc-eQTL，其中细胞状态交互eQTL(ieQTL)显示出对疾病遗传力的显著富集(MASLD性状的ieQTL富集优势比高达10.27)。
研究团队创新性地将转录因子整合为ieQTL的上游调控元件，成功构建601个功能"四联体"——每个单元包含转录因子、特定细胞状态、ieQTL的单核苷酸多态性(ieSNP)组分和基因(ieGene)组分。特别值得注意的是，在肝细胞适应不良过程中观察到EFHD1基因的eQTL丢失现象，该过程受到FOXO1转录因子的基因型特异性调控，这一发现为理解MASLD发病机制提供了新的遗传学视角。
该研究开创性地展示了sc-eQTL分析在解析复杂疾病基因表达调控网络中的强大能力，通过揭示遗传变异如何通过细胞状态特异性方式影响基因表达，为开发精准治疗策略奠定了重要理论基础。研究采用的"四联体"分析框架，为理解遗传变异-转录调控-细胞功能-疾病表型之间的多维关系提供了全新研究范式。
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