一种曾在2022年引发全球疫情的猴痘病毒（Monkeypox virus, MPXV）谱系，悄然出现在一个本不应出现的地方。猴痘作为一种在非洲中西部地区流行的疾病，历史上由两种主要谱系的病毒引起：谱系I（可进一步分为亚谱系Ia和Ib）和谱系II（可进一步分为亚谱系IIa和IIb）。2022年，谱系IIb的暴发在全球范围内造成了大规模的疫情，传播途径主要是通过性接触，尤其在男男性行为者群体中。然而，关于谱系IIb在中非地区的流行情况，此前一直缺乏公开发表的数据。与此同时，在刚果民主共和国（DRC）及其邻国，由谱系Ia和Ib引起的猴痘病例数在2024年迅速上升，促使非洲疾病预防控制中心（Africa CDC）和世界卫生组织（WHO）先后宣布猴痘为区域性乃至国际关注的突发公共卫生事件。而在西非，特别是塞拉利昂，一种源自尼日利亚A.2.2病毒的新谱系IIb分支A.2.2.1病毒正引发重大疫情。病毒谱系的复杂性和传播的动态变化，使得监测工作变得前所未有的重要。在此背景下，研究人员在刚果共和国（Republic of the Congo, RoC）开展了一项研究，以揭示该国猴痘病毒的流行状况。
研究人员利用在刚果共和国建立的被动监测系统，对2025年1月至8月期间收集的疑似猴痘病例样本进行了检测和分析。他们通过分子诊断确定病毒谱系，并对阳性样本进行全基因组测序和系统发育分析，以追溯病毒的来源和进化关系。
关键实验技术方法
本研究主要采用了以下技术方法：1) 病例识别与样本采集：通过国家公共卫生实验室网络进行被动监测，收集疑似病例的皮肤损伤和血液样本。2) 分子检测：使用GeneXpert XpertMpox检测试剂盒和RADI FAST Mpox检测试剂盒进行实时聚合酶链式反应（PCR）检测，以确诊MPXV并区分谱系I和谱系II。3) 全基因组测序：使用针对MPXV基因组设计的特异性引物组进行扩增，并利用牛津纳米孔技术（Oxford Nanopore Technologies）的GridION测序仪进行测序。4) 生物信息学与系统发育分析：通过Nextclade进行序列注释和谱系分配，使用MAFFT进行序列比对，通过IQ-TREE2构建最大似然系统发育树，并采用贝叶斯马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）方法估算进化动力学和时间。
研究结果
首次在刚果共和国检测到谱系IIb病例
研究在刚果共和国第二大城市黑角市（Pointe-Noire）发现了一例实验室确诊的谱系IIb分支A.2.2猴痘病例。患者为一名43岁男性，有近期前往法国和科特迪瓦的旅行史。样本的分子检测结果呈MPXV谱系II阳性。全基因组测序和系统发育分析将该病毒序列确认为MPXV谱系IIb，分支A.2.2。该序列与来自多哥、美国和澳大利亚的近期A.2.2序列聚为一簇，并进一步与主要由塞拉利昂序列组成的新G.1集群分支。系统发育和进化动力学分析表明，导致刚果共和国毒株的谱系起源时间可能在2024年8月至2025年3月之间，这与近期发生的跨境输入事件相符，而非持续的本地传播。
多谱系在刚果共和国共同流行
除了上述谱系IIb病例，研究在2025年于刚果共和国共发现了56例猴痘病例，分布在7个行政省份。对这些病例的分析显示，其中16例为谱系Ia，32例为谱系Ib，另外还有2次谱系IIb的输入事件（包括上述病例）。流行病学数据表明，在2025年期间，谱系Ia的多个分支以及谱系Ib在刚果共和国的主要行政中心（布拉柴维尔）和经济中心（黑角市）共同流行。
监测系统的建立与应对
自2022年起，刚果共和国建立了MPXV分子诊断能力，并实施了全国性的被动猴痘监测系统。2023年增加了下一代测序能力。该监测系统成功识别了2025年刚果共和国多种谱系Ia分支的共同流行、2024年谱系Ib从刚果民主共和国的两次独立输入，以及本次谱系IIb的输入。相关数据被直接共享给卫生部，并促使在黑角市实施了包括加强本地实验室诊断、增强分子流行病学监测、提高医疗机构对猴痘的认识以及改善感染预防控制措施在内的防控策略。
研究结论与意义
本研究提供了在刚果共和国出现实验室确诊的MPXV谱系IIb分支A.2.2病例的流行病学和系统发育特征证据。这一发现标志着第三种不同的MPXV谱系（与谱系Ia和Ib一起）在人类中共同流行，突显了在这个历史上就是流行区的地区，MPXV流行病学正变得日益复杂。
研究的核心结论是，在刚果共和国的人类群体中，MPXV谱系Ia、Ib和IIb正在共同传播。这种多谱系病毒在一个相对有限的区域内共同循环，极大地增加了这些不同谱系病毒之间发生重组事件的风险，可能导致新表型病毒的出现，对公共卫生构成潜在威胁。
因此，研究强调了加强监测和诊断策略以识别流行谱系的迫切需要。这包括扩大可及性诊断、提升（分子）流行病学能力、大幅增加疫苗可及性、实施隔离和接触者追踪策略以及开展社区宣传。特别是在刚果共和国、刚果民主共和国和中非共和国之间的边境地区，需要加强监测，以应对新发和再发传染病的挑战。这项研究凸显了在猴痘病毒持续演变的背景下，区域协调应对和强化卫生系统能力建设的极端重要性。该论文已发表在《自然-医学》（Nature Medicine）期刊上。
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