引言
RNA 结合蛋白(RBPs)是一类参与 RNA 转录后调控的重要蛋白质,它能与 RNA 结合,影响 RNA 转录、编辑、剪接、多聚腺苷酸化、运输和周转等过程。肝细胞癌(HCC)是原发性肝癌的主要类型,在全球范围内发病率和死亡率较高。研究发现,RBPs 的异常表达与 HCC 的发生、发展密切相关。深入探究 RBPs 在 HCC 中的作用,有助于揭示 HCC 的发病机制,为寻找新的治疗靶点和预后标志物提供依据。
RBPs 在 HCC 中的功能与相互作用
RBPs 在癌症中通常分为促癌 RBPs 和抑癌 RBPs 两类。它们与靶标的相互作用,以及 RBP 之间的相互作用,都会影响 HCC 的进展。
- 作为癌基因的 RBPs:胰岛素样生长因子 2 mRNA 结合蛋白 1(IGF2BP1)能促进 HCC 进展,长链非编码 RNA(lncRNA)LINC01093 可通过与 IGF2BP1 相互作用抑制 HCC;微小 RNA(miR)-186 能降低 IGF2BP1 表达,发挥抑癌作用。八聚体结合转录因子 4(Oct4)在 HCC 细胞系中高表达,其缺失可抑制 HCC 进展,过表达则促进上皮 - 间质转化(EMT)和癌细胞干性。BRCA1 相关环指结构域 1(BARD1)在 HCC 组织中高表达,沉默 BARD1 可抑制 HCC 细胞增殖、侵袭和迁移。Claudin-1(CLDN1)与 HCC 生长、迁移有关,miR-29a 可下调 CLDN1 表达,抑制 HCC 发展。
- 作为抑癌基因的 RBPs:RNA 识别基序(RRM)家族的 RBM38 在 HCC 中低表达,HOX 转录反义 RNA(HOTAIR)可抑制 RBM38,促进 HCC 进展;RBM38 能抑制 mdm2 表达,恢复野生型 p53 表达,抑制 HCC 增殖和致瘤性。FUS 通过多种机制抑制 HCC 进展,如 LINC00659 招募 FUS 调节 SLC10A1 表达,FUS 还可增强 Hippo 通路中 LATS1/2 的稳定性。程序性细胞死亡 4(PDCD4)是肿瘤抑制因子,在 HCC 中表达降低,miR-93 和 miR-182 可负向调节 PDCD4,促进 HCC 细胞增殖和迁移。Sorbin 和 SH3 结构域包含蛋白 2(SORBS2)在 HCC 中表达减少,它可通过稳定视黄酸受体相关孤儿受体(RORA)mRNA,抑制 HCC 细胞增殖、侵袭、迁移和 EMT。
- RBPs 的相互作用:在 HCC 发展过程中,RBPs 不仅与 RNA 分子相互作用,还会与其他 RBPs 相互作用。如 HuR 与 CUGBP1 竞争结合 E-cadherin mRNA,影响细胞迁移;AS-NMD 机制可精细调控基因表达;LIN28B 可形成致癌胎儿调节网络,促进肝癌发生;PTBP1 与其他 RBPs 协同调节 FGFR2 可变剪接,推动肿瘤发展。
RBPs 对 HCC 的机制影响
RBPs 在 HCC 中发挥着关键作用,通过影响基因表达、细胞周期和增殖、EMT 和侵袭、血管生成、信号通路以及转录后修饰等方面,影响 HCC 的进展。
- 基因表达调控:RBPs 可结合特定 RNA 序列,影响转录后调控的多个阶段。如丝氨酸 / 精氨酸丰富的剪接因子 2(SRSF2)通过可变剪接促进 GCH1-L 的产生,推动 HCC 发展;RALY 和 SF3B3 协同调节 MTA1 的剪接,影响胆固醇合成途径,促进 HCC 细胞增殖。RPS7 可稳定 LOXL2 mRNA,促进 HCC 细胞迁移和侵袭;HNRNPL 促进 S100A9 mRNA 稳定和表达,增加铁沉积;GRSF1 增强 YY1 mRNA 稳定性,促进 HCC 发生。IGF2BP3 作为 m6A 阅读器,增强 NRF2 翻译效率;Pumilio 同源物 2(PUM2)抑制 B 细胞易位基因 3(BTG3)翻译,促进 HCC 细胞凋亡;EIF3a 通过调节 HIF1a 蛋白合成,影响 HCC 细胞代谢。
- 对细胞周期和增殖的影响:RBPs 可调节细胞周期相关蛋白的表达和稳定性,影响细胞周期进程和增殖。Musashi1(MSI1)通过抑制 p21WAF1/CIP1翻译,促进细胞周期进展和肝癌细胞增殖;精子发生相关丝氨酸丰富蛋白 2(SPATS2)通过调节细胞周期,促进 HCC 细胞增殖。
- 对 EMT 和侵袭的影响:RBPs 在 EMT 和 HCC 细胞侵袭中起重要作用。Serpine mRNA 结合蛋白 1(SERBP1)、IGF2BP2 等可促进 EMT 和 HCC 细胞侵袭;PDCD4 则抑制 HCC 细胞迁移和侵袭。
- 对血管生成的影响:血管生成对肿瘤进展至关重要,RBPs 可调节血管生成因子的表达。如 EIF4E 促进肿瘤血管生成,FUS 抑制 HCC 血管生成,NDRG2 抑制内皮细胞增殖和管状结构形成,EIF5A2 的沉默可抑制肿瘤血管生成。
- 信号通路的调节:RBPs 可调节与 HCC 发展相关的信号通路。如 MEX3C 通过降解 SOCS3 mRNA,激活 JAK2/STAT3 信号通路,促进肿瘤转移;RBM3 稳定 STAT3 mRNA,激活 STAT3 通路,增强细胞迁移和侵袭;CCDC137 等通过激活 AKT 信号通路,促进 HCC 发展;PTBP1 调节 FGFR2 可变剪接,激活 AKT 通路;PNO1、YTHDF1 等分别调节 Notch 信号通路,影响 HCC 进展。
- 转录后修饰的调节:RBPs 参与转录后修饰(PTMs)的调节。如 Dnd1 通过调节 LATS2 mRNA 稳定性,影响 YAP 磷酸化和细胞定位,抑制 HCC 干细胞特性;MEX3A 通过调节 WWC1 表达,影响 Hippo 信号通路中 LATS1 和 YAP1 的磷酸化,抑制 HCC 细胞增殖和迁移。RBPs 还可影响组蛋白乙酰化、甲基化和泛素化等修饰,进而影响 HCC 的发生和发展。
RBPs 在 HCC 治疗中的潜在作用
RBPs 在 HCC 治疗中具有重要潜在价值,可作为预后标志物和治疗靶点,相关治疗策略也在不断发展。
- 作为预后标志物:RBPs 在肿瘤组织和正常肝组织中的差异表达与疾病进展和患者预后相关。通过建立预后模型,发现多个 RBPs 可作为 HCC 的预后标志物,如 NOL12、MRPS12 等可预测 HBV 相关 HCC 的预后;SEC61A1、NOL10 等被确定为 HCC 的预后基因;RRP12、Cirp、HNRNPC 等与 HCC 不良预后相关,NDRG2、NUDT21、INTS6 等与良好预后相关。
- 作为治疗靶点:RBPs 在调节基因表达和细胞过程中的关键作用,使其成为有吸引力的治疗靶点。针对 RBPs 的治疗策略包括使用小分子或 RNA 疗法抑制过度活跃的 RBPs,如设计针对 ZCCHC4、RBMX、RBM38 等的疗法,以克服肿瘤耐药性;开发靶向 RBPs 的药物,如细胞骨架抑制剂 latrunculin A 和 blebbistatin 可靶向 HuR,发挥抗癌作用;抗 CLDN1 和抗 CLDN6 单克隆抗体可抑制肿瘤生长,与索拉非尼等药物联合使用具有协同抗癌效果。
- 基于 RBPs 的治疗策略的发展:小分子靶向疗法是目前研究的热点,如小分子化合物 VE821 可抑制 GRSF1/YY1 表达,促进 miR-30e-5p 表达,有望治疗 HCC;(-)-Gomisin M1 可靶向 TARBP2,抑制 PI3K 和 MAPK 信号通路,抑制 HCC 细胞增殖、迁移和侵袭。射频消融(RFA)联合关键靶点干预可提高治疗效果,如敲低 YTHDF1 可抑制亚致死热治疗诱导的肿瘤转移;circEYA3 与 IGF2BP2 结合可增强对 DTX3L mRNA 的稳定作用,影响 HCC 细胞对碘 - 125(125I)种子植入治疗的敏感性。
未来展望
- 机制研究:深入研究 RBPs 在 HCC 发病机制中的分子机制至关重要,包括其与靶 RNA 的精确相互作用以及对细胞通路的影响。在 HBV 相关 HCC 中,RBPs 相关 mRNA 表达变化与肿瘤预后密切相关,构建相关预后模型可发现新的生物标志物,为诊断和治疗提供理论基础。
- 药物开发和递送:开发针对 RBPs 的靶向疗法需要在药物设计和递送系统上取得进展。纳米技术为核酸药物递送带来新机遇,如 pH 响应性纳米颗粒可将药物靶向递送至肿瘤细胞。同时,需要探索新的递送机制,确保 RBP 疗法有效、靶向地作用于肿瘤细胞。
- 临床转化:将基础研究成果转化为临床应用面临诸多挑战,需要进行严格的临床试验,评估 RBP 靶向疗法的安全性、有效性和潜在副作用。将 RBPs 整合到个性化治疗方案中,结合多学科团队协作,有望提高治疗效果。但针对 DAZAP1、ZCCHC4 等复杂机制的 RBPs,需要精确优化治疗策略。
- 与其他组学数据的整合:将 RBPs 纳入多组学方法,包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学,有助于更全面地了解其在 HCC 中的作用。通过高通量测序和多组学数据整合,可揭示 RBPs 与其他分子通路的相互作用,发现新的治疗靶点,为 HCC 治疗提供新的思路。
讨论和结论
RBPs 在 HCC 的发生、发展中起着关键作用,通过多种分子机制影响肿瘤细胞的增殖、迁移、血管生成等过程。其在 HCC 预后评估中也具有重要价值,基于 RBPs 的预后模型可有效预测患者生存结果。随着研究的深入,越来越多与 HCC 相关的 RBPs 被发现,针对 RBPs 的治疗策略逐渐发展,如靶向 RBPs 的药物开发和纳米药物递送系统展现出潜在的应用前景。然而,不同 RBPs 影响 HCC 发病机制的多样性和变异性需要进一步研究,药物递送系统的优化、临床转化的评估以及与现有治疗策略的整合等方面仍面临挑战。未来,结合免疫疗法和靶向疗法等策略,可能为 HCC 治疗带来新突破。同时,加强多组学研究,深入了解 RBPs 在 HCC 中的复杂调控网络,将为开发更有效的个性化治疗方案提供有力支持。