靶向降解HDAC8的PROTAC技术:胶质母细胞瘤治疗新策略

时间:2026年1月25日
来源:Drug Design, Development and Therapy

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本文系统评估了HDAC8靶向蛋白降解嵌合体(PROTAC)在胶质母细胞瘤治疗中的潜力。研究表明,该降解剂通过诱导内质网(ER)应激介导的IRE1α/XBP1s–JNK–CHOP通路凋亡及S期阻滞,选择性抑制肿瘤细胞生长,其疗效优于传统HDAC8抑制剂(HDAC8i)和帕比司他(Vorinostat),为克服当前治疗挑战提供了新方向。

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靶向降解组蛋白去乙酰化酶8(HDAC8)的蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)在胶质母细胞瘤治疗中的潜力评估
摘要
组蛋白去乙酰化酶8(HDAC8)在胶质母细胞瘤进展中发挥重要作用,使其成为有前景的治疗靶点。虽然HDAC8抑制剂(HDAC8is)在动物模型中能抑制胶质母细胞瘤生长并延长生存期,但它们并不能消除HDAC8蛋白。相比之下,HDAC8靶向PROTAC作为一种选择性HDAC8降解剂,可诱导HDAC8的蛋白酶体降解,从而消除其所有功能。本研究旨在探讨先前报道的一种HDAC8 PROTAC在胶质母细胞瘤细胞中的抗肿瘤活性及其潜在机制。
引言
胶质母细胞瘤是最常见且具侵袭性的脑癌类型,预后差,全球5年生存率低于17%。标准治疗方案替莫唑胺(TMZ)联合放疗的中位总生存期仅为14.6个月,无进展生存期(PFS)为6.9个月。因此,迫切需要开发新的治疗策略以克服这些挑战并改善患者预后。
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是一类能够去乙酰化组蛋白和非组蛋白的酶。HDAC抑制剂(HDACis)已在多种癌症中显示出抗癌效果。帕比司他(Vorinostat,suberoylanilide hydroxamic acid)作为一种泛HDACi,对人胶质母细胞瘤U-87 MG细胞具有活性,并且是首个进入胶质母细胞瘤治疗临床试验的HDACi。然而,其非选择性导致了显著的3-4级毒性,特别是血小板减少症、中性粒细胞减少症、白细胞减少症和疲劳,这凸显了开发亚型特异性HDACis以减少不良事件的必要性。
HDAC8是I类HDAC,能够去乙酰化非组蛋白。其抑制或敲低可降低U-87 MG和T98G胶质母细胞瘤细胞的活力,而抑制HDAC8能延长胶质母细胞瘤荷瘤小鼠的生存期,表明HDAC8在胶质母细胞瘤中的关键作用。值得注意的是,除了其酶活性外,HDAC8还具有支架功能。它与其它转录因子相互作用,这些因子参与癌症的发生发展。在胶质母细胞瘤中,HDAC8与蛋白酶体受体粘附调节分子1(ADRM1)相互作用,促进DNA损伤修复并导致TMZ耐药。因此,传统抑制剂对HDAC8催化功能的破坏可能无法完全抑制该酶的致瘤活性。
为克服此局限,本研究团队开发了一种选择性HDAC8 PROTAC(化合物1),其通过连接NCC-149衍生的HDAC8选择性抑制剂(化合物2)与常用于PROTACs的E3连接酶招募部分泊马度胺(Pomalidomide,化合物3)而构成。该HDAC8 PROTAC能通过泛素-蛋白酶体系统选择性诱导HDAC8降解,并在T细胞白血病(Jurkat)细胞中显著抑制细胞生长。这种选择性通过酶催化实验和细胞实验均得到证实。自该HDAC8 PROTAC报道以来,其他几种HDAC8 PROTACs也被开发出来,并显示出能抑制HDAC8的催化和支架功能。鉴于已报道HDAC8 PROTACs取得的可喜成果,其在HDAC8驱动癌症(包括T细胞白血病、乳腺癌和神经母细胞瘤)中的抗癌效果正在被研究。然而,HDAC8 PROTACs在胶质母细胞瘤细胞中的抗癌效果尚未见报道。因此,本研究评估了先前开发的HDAC8 PROTAC(化合物1)在胶质母细胞瘤细胞中的抗癌效果。
材料与方法
化学品与试剂:HDAC8 PROTAC(1)、NCC-149衍生的HDAC8i(2)和帕比司他均在日本大阪大学SANKEN研究所的Takayoshi Suzuki博士实验室合成。泊马度胺购自MedChemExpress。所有试剂均溶于二甲基亚砜(DMSO)。
细胞系与培养:人胶质母细胞瘤细胞系U-87 MG、A172和T98G购自美国典型培养物保藏中心(ATCC)。原代人星形胶质细胞(PHA)作为正常星形胶质细胞代表,在加拿大阿尔伯塔大学Christopher Power博士实验室制备。细胞在含10%胎牛血清(FBS)及相应补充物的培养基中,于37°C、5% CO2湿润环境下培养。
细胞活力测定:采用MTT法评估测试化合物在U-87 MG、A172、T98G细胞和PHA中的细胞毒性。计算半数抑制浓度(IC50)。
细胞增殖分析:使用CytoLabeling Deep Red试剂,通过Incucyte®活细胞分析系统和流式细胞术评估测试化合物的抗增殖效果。
细胞周期分析:通过碘化丙啶(PI)染色和流式细胞术分析U-87 MG细胞的细胞周期分布。
凋亡细胞检测:使用Annexin V-PE和7-AAD染色,通过流式细胞术检测凋亡细胞。
Caspase-3/7活性检测:使用Caspase-3/7染料,通过Incucyte®活细胞分析系统实时监测caspase-3/7的激活。
蛋白质印迹法(Western Blotting):用于定量HDAC8、细胞周期和凋亡关键调节蛋白(如Cdks、cyclins、Bcl-2、Bax、LC3、XBP1s、BiP、CHOP、p-JNK、JNK、p-ERK、ERK)的水平。计算半数降解浓度(DC50)。
统计分析:数据以均值±标准差表示,使用GraphPad Prism进行单因素方差分析及Tukey-Kramer事后检验,p < 0.05认为有统计学意义。
结果
HDAC8 PROTAC(1)降低胶质母细胞瘤细胞活力
HDAC8 PROTAC(1)以剂量依赖方式降低U-87 MG、A172和T98G细胞的活力,其IC50值分别为6.12 ± 1.52 μM、6.25 ± 1.83 μM和22.68 ± 10.36 μM。在U-87 MG细胞中,其细胞毒性作用强于HDAC8i(2)和帕比司他,效力分别约为HDAC8i(2)的10倍和帕比司他的3倍,而泊马度胺(3)无细胞毒性作用。联合使用HDAC8i(2)和泊马度胺(3)对细胞活力无影响,表明细胞毒性作用特异性地由HDAC8 PROTAC(1)介导。
HDAC8 PROTAC(1)对胶质母细胞瘤细胞显示出选择性细胞毒性
与PHA相比,HDAC8 PROTAC(1)(5 μM和10 μM)处理能显著降低U-87 MG细胞的活力,但对PHA的活力影响极小。在5 μM和10 μM浓度下,PHA的活力分别比U-87 MG细胞高约2倍和3倍。HDAC8i(2)和泊马度胺(3)在胶质母细胞瘤细胞和PHA间无选择性细胞毒性差异。帕比司他在两种细胞中均导致活力下降,但其对癌细胞的选择性低于HDAC8 PROTAC(1)。
HDAC8 PROTAC(1)抑制胶质母细胞瘤细胞增殖
活细胞成像和流式细胞术分析显示,HDAC8 PROTAC(1)处理导致U-87 MG细胞数量随时间减少,同时荧光强度保持高位,表明细胞增殖受到抑制。HDAC8i(2)或泊马度胺(3)处理未观察到类似现象。帕比司他处理也减少了细胞数量,但伴随荧光信号的轻微下降。定量分析证实,HDAC8 PROTAC(1)处理组的平均荧光强度显著高于对照组及其他化合物处理组。
HDAC8 PROTAC(1)通过调控Cdk和Cyclin水平介导胶质母细胞瘤细胞S期阻滞
流式细胞术分析显示,HDAC8 PROTAC(1)以剂量依赖方式增加U-87 MG细胞S期比例。HDAC8i(2)、泊马度胺(3)或帕比司他处理未引起细胞周期阻滞。蛋白质印迹分析表明,仅HDAC8 PROTAC(1)处理能显著降低HDAC8、Cdk1、Cdk2、Cdk4、Cdk6和cyclin B1的水平,而对cyclin A2和cyclin E水平无影响。这表明HDAC8 PROTAC(1)通过调节Cdks和cyclins的表达影响细胞周期调控,介导S期阻滞。
HDAC8 PROTAC(1)诱导胶质母细胞瘤细胞凋亡
流式细胞术分析显示,HDAC8 PROTAC(1)处理显著增加U-87 MG细胞的凋亡比例,其诱导的凋亡水平高于帕比司他(1.3倍)。同时,也引起较低水平的坏死。活细胞成像检测caspase-3/7活性显示,HDAC8 PROTAC(1)以剂量和时间依赖方式增强caspase-3/7活性。HDAC8 PROTAC(1)诱导caspase-3/7激活的能力强于帕比司他,而HDAC8i(2)和泊马度胺(3)无此作用。
HDAC8 PROTAC(1)在胶质母细胞瘤细胞中降解HDAC8的能力
蛋白质印迹分析显示,HDAC8 PROTAC(1)以时间和剂量依赖方式降低U-87 MG细胞中HDAC8的水平,其DC50为77.7 ± 24.12 nM。HDAC8i(2)、泊马度胺(3)或其组合均不能降低HDAC8水平,证实HDAC8降解由HDAC8 PROTAC(1)特异性介导。
HDAC8 PROTAC(1)降低Bcl-2并触发胶质母细胞瘤细胞内质网(ER)应激
蛋白质印迹分析显示,HDAC8 PROTAC(1)处理显著降低抗凋亡蛋白Bcl-2和HDAC8的水平,但不影响促凋亡蛋白Bax和自噬标志物LC3的水平。此外,HDAC8 PROTAC(1)处理上调了ER应激标志物BiP、IRE1α激活标志XBP1s以及下游促凋亡介质CHOP的表达。HDAC8i(2)或泊马度胺(3)处理对这些蛋白水平无影响。
HDAC8 PROTAC(1)激活胶质母细胞瘤细胞中的JNK通路
蛋白质印迹分析显示,HDAC8 PROTAC(1)处理24小时后,磷酸化JNK(p-JNK)与总JNK的比值显著升高。而磷酸化ERK(p-ERK)与总ERK的比值在各处理组间无差异。这表明HDAC8 PROTAC(1)激活了IRE1α/XBP1s介导的ER应激通路下游的JNK信号通路,而非ERK通路。
讨论
本研究显示,HDAC8 PROTAC(1)在胶质母细胞瘤细胞中表现出比传统HDAC8抑制剂(2)和帕比司他更强的细胞毒性,该作用主要通过诱导IRE1α/XBP1s–JNK–CHOP通路介导的ER应激性凋亡实现。此外,HDAC8 PROTAC(1)通过下调Cdk1、Cdk2、Cdk4、Cdk6和cyclin B1,有效抑制细胞增殖并诱导S期阻滞。值得注意的是,PHA对HDAC8 PROTAC(1)不敏感,突出了其作为胶质母细胞瘤选择性靶向治疗的潜力。
HDAC8 PROTAC(1)有效降解HDAC8的发现与其他研究一致。其在胶质母细胞瘤细胞中的细胞毒性作用在微摩尔范围内,与其他报道的HDAC8 PROTACs在实体瘤细胞中的效果相似。HDAC8 PROTAC(1)比帕比司他和HDAC8i(2)具有更强的细胞毒性和抗增殖作用,提示HDAC8的非催化功能对胶质母细胞瘤进展至关重要。这与HDAC8在其它癌症中通过支架功能发挥作用的报道相符。本研究首次提示HDAC8可能在胶质母细胞瘤细胞存活中具有非催化功能,需进一步研究验证。
HDAC8 PROTAC(1)诱导的S期阻滞可能源于Cdk2、Cdk1和cyclin B1的缺失(这些蛋白对S期进程和完成以及G2/M期启动至关重要),以及HDAC8功能破坏可能恢复p53活性和p21介导的细胞周期阻滞。HDAC8 PROTAC(1)诱导的凋亡与Bcl-2下调相关,且未影响自噬。ER应激的触发以及IRE1α/XBP1s–JNK–CHOP通路的激活表明,HDAC8 PROTAC(1)通过该通路诱导胶质母细胞瘤细胞发生ER应激介导的凋亡。
HDAC8 PROTAC(1)对胶质母细胞瘤细胞的选择性细胞毒性可能归因于其靶向降解HDAC8。帕比司他因其非选择性抑制与显著血小板减少症相关,而HDAC8 PROTAC(1)的亚型特异性降解可能提供更好的安全性,但仍需进一步评估其对血细胞的影响。
本研究调查了HDAC8 PROTAC(1)在胶质母细胞瘤细胞中的药理作用,结果支持其作为有前景的胶质母细胞瘤治疗候选药物。尽管包括PROTACs在内的高分子量化合物通常脑渗透性有限,但一种脑渗透性PROTAC目前正处于临床研究阶段。HDAC8靶向PROTAC是否能穿透血脑屏障值得关注。然而,当前研究仅基于体外实验,需要进一步的体内研究(包括效力、药代动力学、脑渗透性和毒性评估)来评估HDAC8 PROTAC(1)的治疗潜力并支持其进入临床开发。
结论
HDAC8 PROTAC(1)诱导的HDAC8降解通过调节Cdks和cyclins水平、抑制细胞周期调节蛋白、诱导S期阻滞,对人胶质母细胞瘤细胞产生强效和选择性的抗增殖及细胞毒性作用。同时,它激活IRE1α/XBP1s–JNK–CHOP通路,下调Bcl-2,诱导人胶质母细胞瘤细胞发生ER应激介导的凋亡。值得注意的是,HDAC8 PROTAC(1)对癌细胞表现出比原代人星形胶质细胞更大的选择性细胞毒性。这种对PHA的有限毒性提示了其安全性,并凸显了HDAC8 PROTAC(1)治疗胶质母细胞瘤的潜力。

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