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本研究首次对马耳他传统猎犬（KTKM）进行了系统的表型与基因组特征分析，揭示其作为遗传学上独特且均匀的犬种，与欧洲指示犬（pointing dogs）聚类，并存在与原始犬种（如Kelb tal-Fenek）和西班牙猎犬（spaniels）的历史基因交流。研究通过形态测量（如中头型mesocephalic、中长体型meso-dolicomorphic）和基因组多样性指标（如观察杂合度Ho=0.324、近交系数FROH=11.06%），证实KTKM具有适度的遗传变异性和低近交水平，支持其作为独立犬种的官方认可，并为制定保护策略（如育种计划、基因库管理）提供了科学依据，对维护犬类生物多样性和文化遗产具有重要意义。
摘要
马耳他传统猎犬（Kelb tal-Kaċċa ta’ Malta, KTKM）是马耳他历史与文化身份的重要组成部分，以其在传统狩猎中的多功能性而受到重视，通常用于惊飞和检索小型候鸟。本研究旨在通过表型和基因组特征分析，支持KTKM作为独立犬种的官方认可，并为其品种标准的制定提供依据。对36只成年KTKM的形态学检查表明，其与欧洲布拉科型犬（Braque-type dogs）相似，表现为中等体型、中长体型（meso-dolicomorphic）、中头型（mesocephalic）、大垂耳、厚垂唇和短毛橙白相间被毛。基因组数据分析（33只KTKM与41个犬种比较）显示，KTKM在遗传结构上归属于指示犬（pointing dogs）聚类，同时与马耳他本地犬种Kelb tal-Fenek（国际称法老猎犬，PHAR）和西班牙猎犬（spaniels）存在历史联系。遗传混合分析表明KTKM样本群体具有高度的遗传一致性和独特性，而纯合性片段（ROH）分析显示其近交系数（FROH ）相对较低。综上所述，KTKM可被视为一个独特的、遗传均匀的犬种，与指示犬亲缘关系密切，具有适度的近交水平和良好的杂合度。品种认可和保护策略对于维护其基因库和文化意义至关重要。
引言
狩猎在马耳他的文化和乡村传统中扮演着核心角色，猎犬是这一实践的重要组成部分。历史档案记录表明，早在16世纪，马耳他群岛的猎犬使用已受立法规范。1773年的一项法令中使用了“braque”型犬一词用于猎兔，暗示当时马耳他存在至少两种不同的猎犬品种，可能更接近大陆指示犬而非地中海视觉猎犬。这一犬系演变为如今的KTKM，其表型与欧洲布拉科型犬相似，但尚未获得国际或国家层面的官方认可。尽管当地组织如FKNK（马耳他狩猎与保护联合会）已开始记录KTKM种群，但其种群结构和遗传身份仍不明确。本研究旨在通过表型特征描述和遗传多样性评估，确定KTKM是否具备独立犬种的资格，从而为其保护提供科学基础。
材料与方法
所有参与本研究的饲养员均签署了合作协议，操作遵循意大利法规和ASAB（动物行为研究协会）指南。数据收集于2024年3月至2025年4月期间，由同一委员会对36只成年KTKM（16雄，20雌）进行形态评估，包括被毛特征、体重、体况评分（BCS）和线性身体测量（如肩高、头长等）。基于测量数据计算了头型指数（CI）和体型指数（BI）。基因组分析从34只无关KTKM采集样本，使用Illumina Canine 230K SNP芯片进行基因分型，并与41个犬种的公开数据比较。质量控制后，数据集包含111,155个SNP和457只犬。种群结构通过多维标度法（MDS）、PHATE降维、ADMIXTURE混合分析和Treemix基因流检测进行评估。基因组多样性指标包括观察杂合度（Ho）、预期杂合度（He）和基于ROH的近交系数（FROH ），有效种群大小（Ne）通过GONE和SNeP软件估算。
结果
形态表型评估
KTKM体型中等，被毛短密，常见毛色为橙白斑块，部分个体（27.7%）带有斑点图案。头型为中头型（CI均值约51.5），咬合以剪刀状为主（88.6%）。性别二态性明显，雄性略呈长体型（BI=86.39），雌性为中体型（BI=82.61）。体重雄性为23.43±6.98 kg，雌性为21.25±3.45 kg。肢体偏差（如牛跗）在老年或超重个体中较常见，但未影响基本功能。
基因组分析
KTKM显示良好的遗传多样性，观察杂合度（Ho=0.324）略高于预期（He=0.321），近交系数（FROH =11.06±5.33%）低于多数对比犬种。有效种群大小（Ne）估算值在GONE和SNeP中分别为62/31（KTKM）和112/19（PHAR），反映种群历史波动。MDS和PHATE分析将KTKM紧密聚类于指示犬附近，但独立于其他品种。ADMIXTURE分析（最佳K=28）显示KTKM个体几乎专属于一独特遗传簇，仅少量共享指示犬（如德国短毛指示犬）背景。系统发育树支持KTKM与指示犬的近期亲缘关系，同时揭示与PHAR的古老联系。Treemix检测到4个迁移事件，包括PHAR向KTKM的基因流。IBD共享分析显示KTKM与德国短毛指示犬（27.2 Mb）和PHAR（26.5 Mb）有最高单倍型共享。
讨论
KTKM的表型和基因组数据共同支持其作为独立犬种的资格。形态均匀性符合品种标准框架，而基因组分析揭示了其复杂历史：与指示犬的功能相似性、与西班牙猎犬的潜在基因交流，以及与PHAR的地理联系。尽管存在混合背景，KTKM表现出高度的遗传独特性，且近交水平可控，有利于长期保护。有效种群大小估算表明需结构化育种管理以防止遗传漂变。本研究局限性包括样本量较小（n=36）和谱系记录不完整，未来需扩大表型评估、建立正规谱系册和临床筛查以促进官方认可。
结论
KTKM是一个表型和基因组上均匀且独特的犬种，遗传上贴近指示犬，同时保留适度的多样性。官方认可和保护策略对其基因库保存和文化传承至关重要，应结合遗传监测和科学育种以维持其健康与功能。
伦理批准
所有程序遵循意大利法规和ASAB指南。
数据可用性
数据可根据要求提供。
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