综述:基于DNA平台的单分子传感器的研究进展

时间:2026年1月26日
来源:Talanta

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DNA作为纳米材料在电化学和光学传感器中的应用及系统构建研究。

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余黄|穆罕默德·齐尚·塔希尔|维斯娜·安蒂奇|米利卡·巴拉班|林远伟|史海霞|李高
中国江苏省镇江市江苏大学生命科学学院,212013

摘要

脱氧核糖核酸(DNA)是生物体的遗传蓝图,也是跨物种最基本的分子之一。材料科学领域的最新研究和开发表明,DNA不仅具有高度的可编程性,还是一种能够精确自组装的纳米材料。将多种单分子检测技术与先进的DNA纳米技术相结合,可以直接探究DNA及其他分子实体的性质。本文旨在解释电学和光学检测策略的工作原理,探讨系统构建方法,并评估其应用性能。此外,本综述系统总结了基于DNA的单分子生物传感平台的发展历程。电学单分子传感器包括单分子结(SMJs)、场效应晶体管(FETs)和纳米孔技术,通过监测单分子水平的电子传输、场效应调制和离子电流波动实现无标记检测。光学传感器则是另一个主要方向,包括表面增强拉曼散射(SERS)、基于荧光的传感方法和电化学发光(ECL),通过光学信号的变化实现超灵敏的生物分子识别。当DNA作为识别元件时,光学传感平台具有高特异性、易于编程和出色的信号稳定性。尽管仍存在挑战,例如在复杂环境中的稳定性和重复性限制,但集成多模式分析为开发稳健、灵敏和选择性的单分子传感平台提供了可行的框架。

引言

信息技术的进步和数字化推动了传感器向更紧凑的架构、更高的检测灵敏度和更快的响应时间发展。样本体积的持续减小使得单分子测量成为越来越重要的发展趋势[1,2]。单分子传感器的研究技术是分析科学领域的创新突破方向,它可以揭示传统整体检测方法无法观察到的分子异质性和动态过程[[3], [4], [5], [6], [7]]。单分子传感器能够提供纳米尺度分子相互作用的详细见解,允许在单个分子水平上研究构象变化和分子间相互作用。在某些情况下,这类传感器可以揭示常规集合测量无法获得的信息[[8], [9], [10], [11]]。单分子平台检测技术可以有效放大收集到的微弱信号,并将其转换为可检测的光学[12]、电学[13]或机械[14]信号。放大的信号与分子状态密切相关,为涉及反应中间体的随机过程提供了宝贵的见解,并能够实时捕获和分析瞬态构象动态[[15], [16], [17]]。因此,单分子检测已成为一个主要的研究焦点,并有望在生物化学及相关研究领域获得持续关注。由此产生的数据允许系统地研究随机反应过程。与传统分析方法相比,单分子检测具有单事件分辨率、高特异性、快速分析和最小样本消耗量[18]。在过去的几十年中,已经开发了许多技术,其中一些技术实现了具有足够通量和统计可靠性的单分子测量。单分子传感和检测领域持续稳步发展。本综述主要介绍了两个研究方向,即光学和电学检测[12,[19], [20], [21]]。
DNA是一种由长链脱氧核苷酸组成的生物分子,每个脱氧核苷酸由一个氮碱基、脱氧核糖和一个磷酸基团组成。DNA是自然界中最重要的生物分子之一,用于存储、携带和调节生物体内的遗传信息。在过去的几十年里,DNA作为功能性纳米材料展现了强大的潜力,其合成设计的链被广泛应用于生物传感、分子计算、信息处理、分子传输和催化等纳米设备的构建[[22], [23], [24]]。DNA被用作传感器中的识别元件,将设计好的探针与其目标之间的识别事件转换为可测量的信号,同时也用于基于DNA模板和超分子DNA组装的生物传感器[25]。与纳米材料结合的DNA传感器表现出显著的特性,包括高灵敏度、易于微型化和高效的信号转导。此外,DNA可以以相对较低的成本和高序列保真度进行化学合成,从而实现可扩展的生产。与其他生物分子(如酶和抗体)相比,DNA具有更好的化学稳定性和对恶劣温度和pH条件的耐受性[26]。另外,当DNA作为识别元件时,它在传感应用中具有高度的多样性和适应性。分子科学的进步使得可以将多种分子开关集成到DNA传感器的设计和制造中。除了环境监测和诊断之外,DNA传感器还越来越多地用于检测RNA、金属离子、代谢物、蛋白酶和细胞表面受体。基于DNA的传感器的两种主要转导策略包括电学(电子或离子)和光学生物传感方法[[27], [28], [29], [30], [31], [32]]。传感器中使用的适配体是一种能够高亲和力结合特定分子的功能性单链核酸。这些适配体通常是通过指数富集法(SELEX)从随机库中筛选获得的[33]。适配体筛选过程完全可以在体外进行,从而为广泛的分析物选择合适的配体。其主要优势包括简化的检测程序、操作便利性、强抗干扰能力和有利的输入输出特性,这些共同构成了单分子DNA检测策略开发的功能基础[34,35]。
本综述重点介绍了过去十年基于DNA的单分子分析传感器的最新进展,特别关注光学和电学生物传感技术的创新进展。

部分摘录

单分子电学DNA传感器

单分子电学DNA传感器是一类固态或纳米级设备,它们将生物分子识别事件转换为可测量的电信号,而不依赖于界面氧化还原反应。电学生物传感器是分析设备,能够在电极上识别特定生物分子,并通过电子转导将其转换为可测量的输出信号。这种转换过程通常依赖于生成或

基于光学DNA平台的单分子传感器

基于光学DNA的单分子传感器通过监测分析物引起的光学响应变化来实现目标识别,并通过折射率、颜色和荧光强度等关键参数的变化实现超高灵敏度[[108], [109], [110], [111]]。光学单分子传感器能够将入射光限制在纳米级电磁场内,从而提高了多种分析技术的灵敏度。

其他DNA平台单分子传感器

除了光学和电化学平台之外,还可以通过基于DNA适配体和纳米结构的各种替代机制实现高特异性的单分子生物传感器。这些方法的基本工作原理是将探针与其目标之间的生物分子识别事件直接转换为可量化和易于检测的物理或化学信号。

单分子检测的进展

在过去十年中,基于DNA的单分子传感在目标多样性和应用范围上都有了显著扩展,从概念验证演示发展成能够分析复杂生物矩阵的稳健分析平台。得益于适配体工程、DNA纳米结构设计以及无需放大的电学和光学读出的进步,可检测的目标范围已经从小型代谢物和离子扩展到结构复杂的分子。

结论

本综述系统地研究了高效的基于单分子适配体的生物传感器,特别强调了电学、光学和电化学发光检测策略。一些DNA生物传感器利用了先进的纳米材料,而其他传感器则利用了多维DNA纳米结构进行构建。在单分子检测和传感领域取得了实质性进展。尽管单分子传感器的制备尚未完全成熟

CRediT作者贡献声明

余黄:撰写——原始草稿、研究、形式分析、概念化。穆罕默德·齐尚·塔希尔:撰写——审稿与编辑、研究。维斯娜·安蒂奇:撰写——审稿与编辑、监督、研究。米利卡·巴拉班:撰写——审稿与编辑、研究。林远伟:撰写——审稿与编辑、研究。史海霞:撰写——审稿与编辑、研究。李高:撰写——审稿与编辑、监督、资源管理、项目协调、资金获取

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的竞争性财务利益或个人关系可能影响本文所述的工作。

致谢

本工作得到了国家自然科学基金(NSAF,编号U2230132)、安徽省信息材料与智能传感实验室的开放基金(授权号IMIS202209)、镇江市社会发展引导科技计划项目(FZ2022052)和镇江市科技计划(社会发展,SH2024098)以及中国国家外国专家计划项目(H20240553)的支持。

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