鲍曼不动杆菌（Acinetobacter baumannii）中高风险国际克隆的全基因组研究揭示了其独特的毒力特征和抗菌素耐药性谱型

鲍曼不动杆菌基因组学分析揭示地理分布与耐药性关联，不同克隆（IC5/IC2）携带特异性毒力基因（ompA、pgaA）及耐药基因（blaOXA-239、tetA），西北农业区菌株耐药谱更广，存在可移动遗传元件介导的耐药基因转移风险。

摘要

细菌病原体鲍曼不动杆菌（Acinetobacter baumannii）是一种机会性细菌，是全球多重耐药性感染的医院内致病因子。本研究通过比较基因组分析，识别了来自墨西哥不同临床样本和地理区域的鲍曼不动杆菌菌株中的关键致病性特征。全基因组分析将这些菌株分为四个系统发育支系，涵盖了多种国际克隆类型。其中，主要来自中部地区血液和呼吸道感染的I支系和II支系与拉丁美洲的IC5克隆显著相关（P = 0.0002）；而主要来自西北部地区多种样本的III支系则与欧洲的IC2克隆显著相关（P = 0.0030）。在所有支系和地理区域的鲍曼不动杆菌菌株中，发现了与致病性相关的多种因子，包括黏附相关因子（ompA, omp38）、生物膜形成相关因子（pgaA-D, csuA/BABCDE）、运动能力相关因子（pil, fim）、调控系统相关因子（bfmRS, barAB, abaR/abaI）、铁摄取相关因子（bas, bau）以及外排泵相关因子（adeFGH）。对抗微生物耐药性的分析显示，I支系和II支系的菌株对β-内酰胺酶（blaADC-6, blaOXA-239, blaOXA-65）、磺胺类药物（sul2）和氯霉素（cmlB1）具有显著耐药性（P = 0.0001）。值得注意的是，主要来自农业区的西北部地区的III支系对氨基糖苷类（aac(6’)-Ib’, aph(3’)-Ia, armA, aadA）、β-内酰胺酶（blaTEM-4, blaADC-25, blaOXA-66）、磺胺类药物（sul1）、四环素（tetA）和大环内酯类（mphD, msrE）也表现出广泛的耐药性（P = 0.0001）。对可移动遗传元件的进一步分析表明该菌具有遗传可塑性，并可能传递抗微生物耐药性。这些基础信息有助于改善对鲍曼不动杆菌的流行病学监测和干预策略。