沙门氏菌病是一种由肠炎沙门氏菌（Salmonella enterica subsp. enterica）引起的高度传染性的动物源性疾病，已知有超过2500种血清型。这种细菌既可感染人类也可感染动物，尤其常见于幼体。在人类中，Enteritidis和Typhimurium血清型最为常见。由Saintpaul血清型引起的人类疫情与受污染的禽肉（Galbraith等人，1962年）、豆芽及其他生食（Jain等人，2009年）有关。2008年美国的一次疫情中，Saintpaul血清型导致了近1500例胃肠炎病例，与该疫情相关的原因是人们食用了生蔬菜（CDC，2008年）。多项研究表明，Saintpaul血清型是零售禽肉产品中常见的多重耐药性菌株（Zhao等人，2006年；Gad等人，2018年）。全基因组测序显示，Saintpaul血清型在禽类中的流行率很高，尤其是在火鸡中，这表明禽类可能是人类和动物感染的潜在宿主（Panzenhagen等人，2025年）。
在马匹中，沙门氏菌病是导致威胁生命的结肠炎的主要原因，并因治疗费用、管理中断和死亡而造成重大经济损失（Feary等人，2006年）。马匹沙门氏菌疫情通常发生在马群集中的地区，在兽医医院和大型马场较为常见（Ward等人，2005年）。在美国，马匹病例中最常报告的沙门氏菌血清型包括Typhimurium、Newport、Javiana和Anatum（Leon等人，2018年）。在一家兽医教学医院，Saintpaul血清型的检出率仅次于Typhimurium和Anatum血清型，其病例死亡率为33.3%（Carter等人，1986年）。1981年6月至1982年3月期间，该医院爆发了沙门氏菌疫情，共有44匹马被感染（Ikeda等人，1985年）。最初，这些菌株对大多数抗菌药物敏感；然而到疫情结束时，它们已对多种药物产生耐药性，包括氨苄西林、头孢噻吩、氯霉素、庆大霉素、卡那霉素、磺胺嘧啶和复方磺胺甲噁唑，这表明耐药性的传播可能是通过接合R质粒介导的（Ikeda等人，1985年）。
亚临床感染的马匹可能在压力、并发疾病或胃肠道紊乱期间间歇性地排出沙门氏菌（美国马医协会（AAEP）传染病指南，2017年）。腹泻是最常见的临床症状，常伴有发热、嗜睡、厌食、腹痛、局部感染、败血症或败血性休克、蹄叶炎和流产。幼驹通常受影响更严重，常表现为出血性腹泻、肺炎、脑膜炎和化脓性关节炎（AAEP传染病指南，2017年）。在一项关于1981-1982年马匹沙门氏菌疫情的病例对照研究中，接受过静脉注射抗生素和鼻胃插管治疗的、出现腹痛症状的马匹感染风险更高（Hird等人，1984年）。Saintpaul血清型还与犊牛腹泻疫情有关，有些犊牛可长期（长达18个月）排出这种细菌（Jones等人，1983年）。此外，还在啮齿动物、鼩鼱、蟑螂和蚂蚁中发现了Saintpaul血清型（Singh等人，1980年）。
为了更好地了解遗传多样性、抗菌素耐药性和细菌毒力如何影响马匹感染，我们使用全基因组测序和抗菌素耐药性表型分析来研究临床感染马匹的Saintpaul菌株。研究结果揭示了广泛存在的多重耐药性，并确定了多种促进宿主定植的毒力因子，强调了持续临床监测和合理使用抗菌药物的重要性，以降低人畜共患风险并改善马匹健康。
