综述:近期在紫色非硫光合细菌的代谢工程方面的进展,旨在提高生物氢的生产效率

时间:2026年2月5日
来源:Biotechnology Advances

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光发酵产氢、紫色非硫细菌、代谢工程、电子传递调控、抗逆性优化

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温超|纪彦璐|姜友敏|袁茂森|王敏敏|穆雪芳|高梓轩|杨思怡|李腾腾|魏轩|郭立进
西安交通大学多相流动力工程国家重点实验室,中国陕西省西安市西安宁西路710049

摘要

利用木质纤维素生物质通过光发酵产氢提供了一种可持续且碳中性的生物能源转换途径,有效缓解了化石资源的消耗和温室气体排放问题。在多种微生物中,紫色非硫细菌(PNSB)因其广泛的底物利用能力、对木质纤维素衍生抑制剂的天然耐受性以及在光照-厌氧条件下的高产氢效率而成为有前景的光合平台。它们的代谢多样性使得碳和电子流能够动态重新分配,从而促进高效的能量转换。近年来,通过靶向调控光合作用代谢、氧化还原平衡和应激响应途径,代谢工程显著提升了PNSB的产氢能力。工程策略主要集中在优化色素合成以增强光能捕获、强化氧化还原稳态和三磷酸腺苷(ATP)生成,以及提高对氨、pH值和温度波动等环境压力的耐受性。这些努力使得工程菌株在产氢量、稳定性和鲁棒性方面取得了显著提升。本文综述了PNSB光发酵产氢的基本机制,总结了代谢和系统级工程策略的最新进展,并探讨了通过综合工程策略、CRISPR-Cas等先进工具和适应性实验室进化方法开发接近理论产氢极限菌株的前景。

引言

氢能日益被视为全球脱碳的关键组成部分。然而,目前的氢生产仍主要依赖于蒸汽甲烷重整和煤制氢等化石燃料技术(Lin和Wu,2024;Malerod-Fjeld等人,2017)。尽管这些技术具有成本效益,但它们会排放大量二氧化碳,并且对气候的改善作用有限(Li等人,2025)。此外,现有和计划中的化石燃料基础设施的累积排放量可能已经超过了与1.5°C温控目标相容的碳预算,这凸显了能源系统脱碳的迫切需求(Tong等人,2019)。
与化石燃料路线相比,生物氢具有明显的环境优势。例如,暗光联合发酵的全球变暖潜力约为9.37吨二氧化碳当量/吨氢气,远低于煤制氢(超过30吨二氧化碳当量/吨氢气)(Zhang等人,2024)。生物氢生产过程还具有操作条件温和、系统要求简单以及能够利用有机废物的优点(Yang等人,2025)。在生物路线中,光合细菌的光发酵因其广泛的底物谱和直接将光能转化为氢气的能力而受到广泛关注(Jiang等人,2024;Li等人,2024)。光发酵产氢率通常是暗发酵的1.5-2倍,远高于微藻系统(Cheng等人,2022;Khetkorn等人,2017;Mishra等人,2019)。
在光合细菌中,紫色非硫细菌(PNSB)已成为光发酵产氢最有前景的微生物之一(Tiang等人,2020)。PNSB具有多种代谢模式,可以根据光照、氧气和营养物质的可用性进行切换(Wu等人,2012)。其高度的代谢灵活性使菌株能够适应不同的基因工程策略。在光发酵过程中,它们的碳代谢可以与氮酶驱动的产氢过程耦合,实现高效的氢气生产(Openshaw和Bagnato,2026)。此外,PNSB能够高效利用多种碳源,并对降解后的农业废弃物表现出高适应性(Ren等人,2024)。另外,PNSB在可见光谱范围内具有多个吸收峰,能够有效捕获太阳能用于产氢(Zhang等人,2024)。尽管具有这些优势,但由于各种生物学和环境限制,PNSB的光发酵产氢效率仍远低于其理论最大值。不同菌株和培养条件下的产氢量差异显著。例如,Rhodopseudomonas palustris GCA009的产氢量为1.15摩尔氢气/摩尔葡萄糖,而Rhodobacter capsulatus JP91的产氢量可达5.50摩尔氢气/摩尔葡萄糖(Ghosh等人,2012;Wang等人,2019)。然而,这些数值仍远低于理论最大值12摩尔氢气/摩尔葡萄糖,这表明当前研究需要重点提高代谢效率并优化途径调控。大多数PNSB并不直接以葡萄糖作为光发酵的碳底物(Bayon-Vicente等人,2025)。在使用葡萄糖的系统中,氢气生产通常通过暗光-光联合发酵过程实现,其中葡萄糖首先被暗发酵微生物转化为有机酸,然后在光照条件下被PNSB消耗(Liu等人,2010;Sagir等人,2018)。
PNSB的光发酵产氢过程本质上与碳底物的代谢转化和光驱动的电子传输相关。来自有机底物氧化的电子进入以光合系统为中心的循环电子传输链(Gu和Milton,2020)。这一光驱动过程建立了质子梯度,推动三磷酸腺苷(ATP)的合成,并为氮酶提供高能电子(Zhang等人,2016)。氮酶随后利用ATP水解释放的能量将质子还原为氢气(Seefeldt等人,2020)。然而,来自底物氧化和光化学反应的还原力和ATP同时被多个竞争性代谢途径消耗,包括通过Calvin-Benson-Bassham(CBB)循环的二氧化碳固定、通过聚羟基丁酸(PHB)生物合成的碳储存以及细胞维持代谢(Feng等人,2018;Huang等人,2025)。这些途径对还原力和ATP的激烈竞争显著限制了野生型(WT)菌株的产氢量。因此,通过代谢工程策略分析和重构这些代谢流网络对于克服光发酵产氢的效率瓶颈至关重要。
基于这些见解,研究人员通过靶向优化碳代谢、电子传输、ATP合成、氮酶活性和细胞应激耐受性,成功开发了多种PNSB突变菌株。通过增强电子传输并将多余的还原力重新导向氮酶而非竞争性途径,突变菌株实现了光合电子流与氮酶活性之间的有效耦合(Feng等人,2024;Gao等人,2025)。同时,加强的ATP合成酶调控确保了光驱动的质子动力高效转化为生化能量,从而维持了依赖ATP的氢气生产(Mu等人,2025)。CBB循环和PHB合成途径的代谢重构进一步减少了碳的浪费,将碳和能量流导向氢气生产(Öztürk和Gökçe,2012)。此外,优化的色素组成和光捕获天线结构在不同光照条件下提高了光子捕获效率,扩展了适合氢生产的有效光照强度范围。赋予对氨、pH值和温度波动耐受性的适应性突变使氮酶在次优光发酵环境中保持活性(Feng等人,2024;Gao等人,2023;Gao等人,2025)。总体而言,这些遗传和生理突破使工程化的PNSB突变菌株实现了卓越的光能转换效率、氧化还原平衡和环境鲁棒性,为高效且可扩展的光发酵产氢奠定了坚实基础。
光合细菌的代谢工程为通过重构细胞能量和氧化还原代谢来提高生物氢产量提供了强有力的方法。然而,由于光捕获、碳代谢、电子传输和氮酶活性之间的复杂耦合,调控氢生产的机制尚未完全阐明。本文全面总结了PNSB生物氢生产的代谢工程最新进展,重点介绍了PNSB光发酵产氢的机制。它强调了优化光捕获色素合成、电子传输和还原力分配的基因工程策略,以及提高对氨浓度、温度和pH值等环境因素耐受性的方法,从而提高产氢量。此外,还从系统代谢工程的角度分析了能量转换和氧化还原平衡的内在机制。最后,基于分子生物学和合成生物学提出了光发酵产氢的未来优化方向。

部分摘录

PNSB中的光捕获和反应中心复合体

为了将光能转化为可用的化学能,光合细菌依赖于位于细胞内膜(ICM)上的良好组织的光合装置(Mullineaux和Liu,2020)。该装置通过一系列紧密耦合的反应运作,涉及电子传输和质子转运,如图1所示。首先,嵌入在光捕获复合体(LHCs)中的色素分子吸收光子并产生电子激发态(激子)(Jang和

优化光合能量转换的代谢调控策略

优化光合能量转换的代谢调控策略已成为提高PNSB光发酵产氢的核心。代谢工程和分子生物学的进展使得能够精确调控PNSB中的关键途径,包括光捕获、碳代谢、还原力分配和ATP合成。通过工程化这些生物过程,细胞内能量和还原力可以更有效地导向氮酶,从而

提高光发酵产氢的应激耐受性工程策略

光发酵产氢对环境压力非常敏感,包括铵积累、pH值波动和温度变化,这些因素会干扰光合电子传输、氮酶活性和整体能量代谢。为了克服这些限制,最近的研究集中在增强PNSB应激耐受性的分子和遗传策略上。这些方法包括调节氮酶调控途径、氧化还原相关

应用代谢工程中的挑战和未来方向

尽管在修改PNSB中的单个基因和途径以提高光发酵产氢方面取得了显著进展,但将实验室成果转化为实际应用仍受到代谢、工程和经济领域系统性瓶颈的限制。这些限制不仅源于WT菌株本身的代谢效率低下,还与放大、操作稳定性、过程整合和经济因素相关

结论

本文总结了PNSB光发酵产氢的机制,并阐明了光合能量转换和氧化还原调控如何协同驱动氢生产。代谢工程通过优化光捕获色素合成、平衡细胞内氧化还原状态以及增强ATP生成和利用显著提高了产氢量。增强应激耐受性的工程策略,包括减轻氨的影响

未引用的参考文献

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利益冲突声明

作者声明他们没有已知的竞争性财务利益或个人关系可能影响本文所述的工作。

致谢

本工作得到了国家自然科学基金有序能量转换基础科学中心项目(编号:52488201)的财政支持。

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