靶向由SIN1介导的TTK/LDHA-H3K18la-GLUT3轴可破坏代谢-表观遗传之间的相互作用,并抑制高糖代谢型乳腺癌的进展

时间:2026年2月18日
来源:Cancer Letters

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本研究揭示乳腺癌中SIN1通过招募TTK磷酸化LDHA,增强乳酸生成和H3K18la修饰,进而上调GLUT3促进糖酵解,形成自强化代谢-表观遗传环路,并证实LR-90抑制剂可协同化疗抑制肿瘤生长。

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赵泽伟|贾文斌|李泽坤|史尚恒|周家琪|宁春兰|于志豪|刘晓峰|曹旭晨|郑洪|王欣|王秀超|于月
天津医科大学肿瘤医院乳腺外科一科,国家癌症临床研究中心,中国天津300060

摘要

代谢-表观遗传相互作用加速了乳腺癌(BC)的进展;然而,将糖酵解通量与染色质重塑联系起来的机制尚未完全阐明。在本研究中,我们揭示了一个以丝裂原活化蛋白激酶相关蛋白1(MAPKAP1,也称为SIN1)为中心的激酶-代谢-表观遗传轴。通过对高度侵袭性肿瘤进行单细胞转录组分析,发现SIN1是与上皮-间质转化和增殖程序共富集的关键节点。生化图谱分析和质谱技术表明,SIN1通过促进乳酸脱氢酶A(LDHA)在Tyr239位的磷酸化(p-LDHAˆ239),从而增强糖酵解和乳酸的产生。由此产生的乳酸积累增加了组蛋白H3K18的乳酸化(H3K18la),ChIP-seq结果显示,H3K18la在溶质转运蛋白家族2成员3(SLC2A3,也称为GLUT3)的启动子区域富集,进而上调GLUT3的表达,增强了葡萄糖的摄取,从而形成了一个自我强化的SIN1/TTK/LDHA-H3K18la-GLUT3正反馈环路。通过结构功能分析、分子对接和高通量虚拟筛选,我们确定了LR-90作为SIN1/TTK/LDHA复合物的小分子抑制剂。LR-90能够降低p-LDHAˆ239的水平、乳酸水平、H3K18la在GLUT3启动子区域的结合强度、葡萄糖摄取以及肿瘤生长,并且在患者来源的类器官和小鼠异种移植模型中与标准化疗具有协同作用。临床研究表明,SIN1表达升高与不良病理特征和较差的整体生存率相关。综上所述,这些发现将SIN1介导的TTK招募用于LDHA磷酸化与组蛋白乳酸化和GLUT3驱动的代谢重编程联系起来,提示使用LR-90单独或与标准化疗联合使用可能为高糖酵解、高乳酸水平的乳腺癌提供一种治疗策略。

引言

乳腺癌(BC)仍然是全球女性中最常见的恶性肿瘤,每年新增病例超过230万例,约占女性所有恶性肿瘤的24.5%[1, 2。尽管通过手术、化疗、放疗和靶向治疗,患者的预后有了显著改善,但肿瘤异质性、侵袭性生物学行为和药物耐药性仍然阻碍着长期生存[3。单细胞测序技术的出现为解析肿瘤异质性、识别恶性亚克隆中的罕见驱动突变以及发现具有一致促肿瘤功能的潜在治疗靶点提供了强大且高分辨率的方法[4
在肿瘤发生调控因子中,丝裂原活化蛋白激酶相关蛋白1(MAPKAP1,也称为SIN1)因其多方面的作用而受到广泛关注。作为mTORC2复合体的核心组成部分,SIN1通过调节信号通路(包括AKT和JNK1[5, 6, 7)来驱动肿瘤增殖、转移、免疫微环境重塑和药物耐药性。例如,SIN1维持Foxp3+调节性T细胞群体,通过与PCBP2相互作用来对抗氧化应激,并在营养匮乏和缺氧条件下增强肿瘤存活和转移[8, 9, 10。此外,SIN1通过与MEKK2和AURKA等蛋白质的结合,进一步促进肺癌和肝癌的侵袭性和化疗耐药性[11, 12。然而,SIN1在乳腺癌中的功能网络仍不明确,这对其治疗潜力留下了重要的知识空白。
与此同时,乳酸脱氢酶A(LDHA)作为糖酵解最终步骤中的限速酶,因其在通过代谢重编程、肿瘤微环境重塑以及促进细胞增殖、转移和药物耐药性方面的关键作用而受到关注[13, 14, 15。异常的糖酵解活动是许多恶性表型的核心,包括生长、侵袭、转移和治疗耐药性。即使在充足的氧气条件下,许多肿瘤细胞仍偏好通过糖酵解产生三磷酸腺苷(ATP),这种现象被称为“瓦尔堡效应”[16。LDHA通过维持ATP生成、支持生物合成前体的合成以及保持氧化还原平衡来支撑瓦尔堡效应[17, 18
乳酸曾被认为只是代谢副产物,但它也可以作为表观遗传修饰的底物,直接影响基因表达[19, 20。最近的研究揭示了一种新的组蛋白修饰方式——乳酸化。其中,组蛋白H3赖氨酸18(H3K18la)的乳酸化因其能够连接细胞代谢和基因调控而受到越来越多的关注。LDHA的活性和产生的乳酸水平动态调节H3K18la,形成了一个将细胞代谢与基因表达联系起来的“分子传感器”[21, 22, 23, 24。H3K18la影响多种生物学行为,从重塑免疫微环境到维持干细胞潜能,再到促进肿瘤形成和介导治疗耐药性,突显了代谢-表观遗传相互作用在驱动乳腺癌中的核心作用[25, 26, 27, 28, 29
在本研究中,我们探讨了SIN1在这个代谢-表观遗传网络中的作用。我们发现SIN1在侵袭性乳腺癌亚型中过表达,并与不良临床预后相关。机制上,SIN1招募TTK来磷酸化LDHA,从而增加乳酸的产生和H3K18la的水平,进而促进SLC2A3(GLUT3)的转录,建立了糖酵解和葡萄糖摄取之间的正反馈环路。重要的是,靶向SIN1/TTK/LDHA复合物显著提高了化疗的效果。我们的发现揭示了乳腺癌中的一个关键代谢-表观遗传轴,为精准治疗提供了有力依据。

部分内容摘要

单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析

原始scRNA-seq数据集(GSE190559和GSE195861)来自GEO数据库。原始scRNA-seq读段经过标准处理流程:计数矩阵经过标准化以考虑测序深度和其他技术变异,并筛选出高度变异的基因以捕捉真实的生物学变异。主成分分析进行了初步的降维处理,随后应用非线性整合方法对不同批次的数据进行对齐。

SIN1与乳腺癌中的上皮-间质转化(EMT)和增殖的关系

在本研究中,我们通过分析GEO数据集GSE190559中的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,系统地解析了高度侵袭性乳腺癌进展的分子基础。通过UMAP/t-SNE降维分析,我们识别出具有不同转录特征的多个细胞簇(图1A)。一些簇表现出较高的EMT评分(图1B),而另一些簇则以高增殖活性为特征(图1C)。

讨论

在本研究中,我们系统地阐明了SIN1/TTK/LDHA信号复合体作为乳腺癌中代谢-表观遗传调控的关键枢纽的分子机制。通过整合单细胞转录组学、表观遗传分析和功能验证,我们确定SIN1通过招募TTK激酶来促进LDHA在Tyr239位的磷酸化,从而增强糖酵解通量和乳酸的产生。随后,乳酸水平的升高进一步上调了GLUT3的表达

结论

总之,我们的发现揭示了乳腺癌中的一个关键代谢-表观遗传轴:SIN1招募TTK来磷酸化LDHA在Tyr239位,从而增加乳酸的产生并驱动组蛋白H3K18的乳酸化。这种乳酸化事件上调了GLUT3的表达,形成了一个支持强糖酵解通量和侵袭性肿瘤表型的正反馈环路。通过结合单细胞测序(scRNA-seq)、体外功能测定和体内实验的综合性方法,

CRediT作者贡献声明

郑洪:数据可视化。曹旭晨:实验研究。刘晓峰:数据分析。李泽坤:资源获取。贾文斌:数据可视化。于月:撰写、审稿与编辑、监督、软件使用、资金申请。赵泽伟:初稿撰写、概念构思。王秀超:撰写、审稿与编辑、资源管理、项目协调。王欣:监督、资金申请。于志豪:监督。宁春兰:方法学设计。周家琪:数据整理。史尚恒:资源提供

伦理审批和参与同意

本研究获得了天津医科大学肿瘤医院伦理委员会的批准。所有参与者在纳入研究前均签署了自愿书面知情同意书。

出版同意

不适用

数据和材料的可用性

本研究生成或分析的所有数据均包含在本文及其补充信息文件中。

利益冲突

作者声明没有利益冲突

资助

本研究得到了国家自然科学基金(项目编号:82172827和82172835)和天津重点医学学科建设项目(项目编号TJYXZDXK-3-003A)的资助。

利益冲突声明

作者声明没有已知的可能影响本文工作的财务利益或个人关系。

致谢

无。

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