综述:器官芯片、类器官与微肿瘤:推进药物开发和精准医学的仿生三维肿瘤模型

时间:2026年3月14日
来源:Acta Pharmaceutica Sinica B

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这篇综述聚焦于类器官、器官芯片和微肿瘤三种前沿的仿生三维肿瘤模型,系统阐述它们如何克服传统二维细胞系和动物模型的局限性,更好地重现肿瘤的结构、异质性及微环境。文章详细剖析了各类模型在药物高通量筛选、临床疗效预测(如PDOs)及精准医学中的应用潜力,并探讨了人工智能(AI)驱动其智能化发展的前景,为相关研究和临床实践提供了有力证据与前瞻指引。

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器官芯片、类器官与微肿瘤:推进药物开发和精准医学的仿生三维肿瘤模型
全球癌症负担日益加重,开发更有效的药物和个性化疗法迫在眉睫。传统的二维细胞系和患者来源异种移植模型等筛选平台,难以充分模拟人类肿瘤的复杂结构、异质性和动态微环境,限制了其临床转化价值。为应对这一挑战,一系列源于人类的仿生平台应运而生,包括类器官、器官芯片和微肿瘤。它们凭借三维仿生工程和微流控技术,有望弥合临床前研究与临床实践之间的鸿沟。
传统模型的局限与新兴平台的定位
常规药物筛选模型存在精度和时效性上的根本缺陷。永生化细胞系在长期培养中会发生基因型和表型漂变,且其二维结构无法再现肿瘤微环境中细胞、胞外基质、免疫细胞和细胞因子间的动态相互作用。传统动物模型则因物种差异,导致超过90%在动物实验中有效的药物在人体临床试验中失败,造成巨大的时间和经济成本损耗。患者来源异种移植模型虽然能保留大部分肿瘤基因组,但建立周期漫长(3-6个月),且缺乏功能性的免疫微环境,使得多达40%的晚期癌症患者可能错过最佳治疗窗口。
相比之下,类器官、器官芯片和微肿瘤等新兴技术,其核心价值并非体现在靶点或生物标志物的初始发现阶段,而是集中应用于下游的临床前测试和临床疗效预测这一关键转化瓶颈。这些平台能够动态再现复杂的生理功能和患者特异性病理状态,为肿瘤建模、临床药物筛选、精准药物开发和个性化治疗提供了新工具。
类器官:高保真的“患者替身”
类器官是在三维培养环境中,由多能干细胞、祖细胞或分化细胞通过自我组织形成的微生理系统。它们能高度模拟源器官的空间结构、细胞谱系分化和功能活动,已成为发育生物学、疾病建模和精准医学的宝贵平台。
其发展经历了几个关键阶段:从2009年汉斯·克利弗斯团队建立首个自我组织的肠隐窝-绒毛结构,到2015-2018年间扩展到精准肿瘤学并建立全面的患者来源类器官生物库,再到近年来的标准化与临床转化推进。一项有影响力的研究引入了类器官微球平台,在保留驱动基因突变方面显示出97%的保真度,临床预测准确率超过80%。
类器官的生成始于患者来源组织或诱导多能干细胞。标准流程包括组织解离、基质胶包埋和定向诱导培养。以结直肠癌类器官为例,培养基中会精准添加Wnt激动剂、BMP信号抑制剂NOG和表皮生长因子EGF等关键成分,以维持癌症干细胞池并驱动分层分化。通过此流程生成的类器官保真度高,能保留原发肿瘤的关键驱动基因突变(如KRAS、TP53),并维持超过20代的遗传稳定性。
与二维细胞系和动物模型相比,患者来源类器官在重现原发肿瘤的遗传和表型特征方面具有显著优势。它们能保留高达90%的体细胞突变,并再现关键的组织病理学特征,如腺体极性和间质浸润模式。在双人鼠模型中,PDOs的整体突变谱与原始肿瘤的一致性达到80%-90%。因此,PDOs可作为每位患者肿瘤的“活体生物库”,为个性化医疗和肿瘤进化研究提供不可或缺的平台。
在药物筛选中,类器官凭借其快速扩增能力和适合微型化培养的特性,已成为下一代高通量筛选平台。其核心优势在于可扩展性和临床相关性。单个患者样本可扩增产生成百上千个培养单元,便于在96或384孔板中平行测试多种药物组合。PDOs能忠实保留原始肿瘤的特异性基因组特征,确保其药物敏感性谱与体内临床结果强相关。
关键应用包括:加速新药靶点识别(如在SARS-CoV-2疫情期间筛选出伊马替尼等抑制剂);建立标准化药物筛选平台(如头颈鳞状细胞癌类器官生物库);通过临床前验证和临床预测改变监管范式(如基于类器官数据推动双特异性抗体MCLA-158进入临床试验);以及实现药物筛选的机制整合(如绘制胰腺癌PDOs的药物敏感性图谱)。
肿瘤来源PDOs预测治疗反应的能力是其临床转化的基石。通过离体药物敏感性测试为个性化治疗提供功能学基础,其预测效能已在多项研究中得到广泛验证。例如,一项发表于《科学》的研究表明,用紫杉醇、西妥昔单抗等药物筛选转移性胃肠道癌症的PDOs,预测临床结果的灵敏度达100%,特异性达93%,阳性预测值88%,阴性预测值100%。其中100%的阴性预测值强烈提示,类器官模型显示耐药的肿瘤患者可免于无效治疗。另一项利用微流控平台的研究,成功将类器官生成时间压缩至7天,用于对消化系统肿瘤的31种抗癌药物进行高通量筛选,在21名患者中实现了81.0%的预测准确率。
此外,PDOs通过功能测试补充了下一代测序的临床应用。NGS能对全外显子组、转录组和全基因组变异进行高通量分析,为个体化治疗提供分子基础,但仅有约33%的患者能从NGS指导的治疗中获益。类器官模型通过直接测量药物敏感性,解决了基因组学的功能解释缺口,有助于解释意义未明的变异,并能再现多因素耐药机制。
然而,类器官的临床实施仍面临挑战,包括癌症类型依赖的培养成功率、免疫微环境表征不完整以及成本效益欠佳。例如,传统类器官模型通常从上皮干细胞扩增而来,缺乏天然免疫成分,通过共培养重建肿瘤微环境面临免疫细胞寿命短、细胞比例偏离生理水平以及缺乏原位抗原呈递环境等障碍。与体内15%-40%的基准相比,类器官系统中CD8+T细胞浸润率低于5%,这限制了对免疫疗法的评估。
器官芯片:动态模拟生理与病理
器官芯片是再现人体器官关键功能单元的微流控装置。通过将活细胞与精确设计的微环境整合,这些芯片在动态灌注和机械刺激下为组织水平生理和病理生理建模提供了平台,这是其相对于类器官等静态培养模型的主要优势。
自2010年唐纳德·E·英伯团队首创肺泡-毛细血管屏障芯片以来,该领域经历了单器官建模、多器官相互作用以及自动化与临床转化三个主要技术发展阶段。器官芯片的制造主要采用软光刻、光刻和增材制造技术。软光刻通常使用聚二甲基硅氧烷等弹性材料,其特点是光学透明度高、透气性好、生物相容性好,但疏水性和对小分子的非特异性吸附是药物筛选检测的重要限制。
器官芯片平台的核心技术优势在于其对剪切应力、循环拉伸等机械力、生化梯度以及通过微流控灌注室和多孔膜结构实现的细胞-细胞相互作用的集成控制,从而动态重建接近生理状态的组织微环境。
例如,一个嵌入生物传感器的肝脏芯片能够实时双重监测血管化和肝功能。该微流控系统显示,流体机械刺激同步促进了内皮细胞和肝细胞的共成熟。三维电化学传感器在第5天检测到一个临界拐点,与理论预测的移植窗口一致。在此窗口内移植,可使肝硬化小鼠模型的纤维化消退93%并重建肝小叶,而在窗口之前或之后移植则使疗效降低50%-70%。这些发现验证了移植窗口假说,并为类器官再生疗法的质量控制提供了量化框架。
在器官间相互作用层面,多孔膜共培养(如肠-肝芯片)以低于15%的生物利用度预测误差再现了首过效应;微流连接的多器官系统(如心-肝-肾芯片)实现了长达28天的完整ADME(吸收、分布、代谢、排泄)过程功能模拟。特别是循环免疫细胞的加入,使得探究器官间信号传导和阐明细胞因子风暴等病理成为可能。
这种高度仿生的环境带来了切实的转化收益。在药物开发中,利用肺水肿模型开发的血管渗漏抑制剂GSK2193874,预测抑制率达到92%(动物模型中为85%)。几种多器官芯片将临床前毒性预测准确率提高至89%,而传统模型为70%。
器官芯片在疾病建模与药物反应预测中的应用
器官芯片平台擅长重现肿瘤微环境的特异性并准确预测药物反应。其优势在于重建传统模型中常丢失的器官特异性癌症行为。例如,将非小细胞肺癌细胞注入原代肺泡和小气道芯片表明,癌细胞在肺泡芯片中增殖更旺盛,忠实地反映了NSCLC在肺泡区域生长的临床偏好。
然而,模拟癌症的全部复杂性不仅需要器官特异性,还需要忠实地重建肿瘤微环境。TME是肿瘤进展的核心引擎,通过物理屏障、信号串扰和免疫抑制驱动治疗耐药。类似地,一个硬度可调的胆管癌芯片证明,生理性的基质硬化显著增强了化疗耐药并促进上皮-间质转化。
虽然上述肺癌模型捕捉了增殖行为,但在基质区室重建方面存在局限。为解决此问题,研究人员通过将脱细胞肝基质与明胶甲基丙烯酰结合,开发了一种仿生肝肿瘤芯片。该平台精确调控基质硬度和流体剪切力,显著提高了微环境保真度。与标准的纯GelMA芯片相比,DLM-GelMA环境中的肝细胞癌细胞表现出更高的活力、更强的功能蛋白表达,以及关键的、改变了的药物反应。它们对索拉非尼的反应与先前报告一致,但对乙酰氨基酚的敏感性显著增强,这凸显了仿生TME如何调节药物药代动力学。
器官芯片系统动态的微环境使其适合模拟依赖机械或运输过程的癌症特征。例如,它们可以通过施加流体剪切应力来模拟激活侵袭和转移,这种刺激可使癌细胞侵袭增加超过3倍。这些平台同样适用于模拟诱导血管生成,它们可在工程化微血管网络中实现超过85%的血管化效率,为剖析静态模型无法捕捉的机制提供了基础。
器官芯片催化药物开发范式转变
器官芯片现已深度整合到药物开发的整个流程中。例如,在加速神经治疗发现方面,一个整合了微电极阵列和微流控的神经芯片重建了自身免疫性脱髓鞘模型,并发现了可恢复突触传递的单克隆抗体TNT005;基于芯片数据推进的临床试验已获得FDA突破性疗法认定。在高通量抗病毒筛选中,唐纳德·E·英伯团队在双通道人气道芯片中建立了SARS-CoV-2感染模型,发现阿莫地喹、托瑞米芬和氯米芬显著抑制病毒复制,推动了两项临床试验。在优化转移性癌症治疗制剂方面,研究者结合器官芯片平台和器官特异性脱细胞胞外基质,构建了3D转移芯片来模拟肾细胞癌向肝脏的扩散并预测治疗反应。改变Caki-1和HepLL细胞的比例以模拟肝转移的不同阶段,揭示了5-氟尿嘧啶的疗效与Caki-1细胞比例呈线性负相关。此外,与游离的5-氟尿嘧啶相比,负载5-氟尿嘧啶的PLGA–PEG纳米颗粒在同等浓度下产生了更强的细胞毒性。
总而言之,器官芯片不仅加速了包括小分子抑制剂和抗体药物在内的传统化疗药物的高通量筛选和功能验证,还为评估新兴治疗策略提供了不可或缺的优势。然而,器官芯片的广泛采用受到关键挑战的阻碍,包括缺乏标准化、通量低,以及最显著的是过于简化的生物学限制了临床相关性。为了专门解决这种生物学保真度差距,类器官芯片代表了重大飞跃。
类器官芯片:整合优势,重塑体外模型
类器官芯片平台代表了跨学科生物工程的前沿,通过将干细胞自组织形成的3D类器官与微流控器官芯片平台整合而构建。该系统的本质在于利用干细胞多向分化和自发空间组织的先天能力。在由微流控系统精确调节的微环境(包括流体剪切应力、溶解氧梯度和生化信号分子浓度等参数)内,这些平台促进了具有高生理相关性的功能器官单元的体外重建。与依赖人工组装细胞群的常规器官芯片策略相比,类器官芯片能够产生更忠实地再现天然器官的细胞异质性和复杂组织结构。
近年来该领域见证了一系列重大突破。其核心技术革新包括:重建器官特异性功能、微流控调节组织成熟、自动化高通量药物筛选与动态给药、多器官分区共培养系统、个性化精准治疗以及环境病理学建模平台。
这些发现表明,类器官芯片结合了类器官和器官芯片系统的优点,推动了多个领域的突破。其基于干细胞自组织和精确微环境控制的高保真器官模拟能力,显著加深了我们对疾病机制的理解,并促进了动物试验的替代。依赖集成多室微流控设计的动态多器官相互作用建模能力,为评估全身药物毒性和预测治疗结果提供了关键支持。通过传感器和流体控制系统的协同集成,自动化、高通量平台极大地加速了个体化治疗策略的生成,并提高了精准给药决策的效率。利用疾病相关因子的受控递送重建病理微环境的技术,赋能了环境医学研究,并有助于建立有毒物质的安全阈值。此外,使用PDO系统的患者特异性建模促进向数据驱动范式的转变,使预测成为可能。

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