基于SPAAC的抗体-aDNA信号转导机制以及空间限制性的CRISPR-Cas12a-TdT级联放大技术,用于检测谷物中的黄曲霉毒素B1和DON

时间:2026年3月17日
来源:Microchemical Journal

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CRISPR-Cas12a与TdT联用构建级联放大免疫传感器,通过SPAAC点击化学固定抗体-激活DNA,结合磁珠纳米颗粒实现高灵敏检测黄曲霉毒素B1(LOD 2.63×10⁻⁵ ng/mL)和脱氧雪腐镰刀菌烯醇(LOD 6.23×10⁻⁴ ng/mL),突破抗体直接激活Cas12a的技术瓶颈。

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余春雷|任凯云|徐学珍|马金苗|李法兰|张艳艳|杨青青
山东工业大学农业工程与食品科学学院,中国淄博市新村镇西路266号,255049

摘要

大多数利用CRISPR-Cas12a技术检测霉菌毒素的应用都依赖于适配体作为识别元件。然而,尽管抗体具有高亲和力和特异性,但它们需要将免疫信号转化为核酸信号,并且不能直接激活CRISPR-Cas12a系统,这限制了它们在检测高灵敏度小分子目标物方面的应用。在这项工作中,我们通过菌株诱导的叠氮-炔烃环加成(SPAAC)反应将CRISPR-Cas12a激活剂DNA(aDNA)与抗体结合,实现了双重功能:将小分子目标信号转化为核酸信号,并部分固定Cas12a蛋白。磁性球形核酸(MSNAs)作为CRISPR-Cas12a系统的切割底物。末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)通过向众多切割的DNA片段的3’-OH末端添加dATP来延长polyA序列。这一过程结合高浓度NaCl诱导的金纳米颗粒(AuNPs)聚集和颜色变化,建立了一个级联信号放大系统。我们开发了一种新型的超灵敏免疫传感器,称为Cas12a-TdT级联放大抗原-毒素免疫测定(CTCA-ATI),用于霉菌毒素的定量。黄曲霉毒素B1和脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)的检测限分别为2.63×10−5 ng/mL和6.23×10−4 ng/mL,线性范围分别为1×10−4–10 ng/mL(黄曲霉毒素B1)和1×10−3–10 ng/mL(DON)。本研究为使用CRISPR-Cas12a开发级联放大生物传感器提供了新的见解,并展示了将抗体与CRISPR-Cas技术结合以检测其他关键目标物的巨大潜力。

引言

黄曲霉毒素,特别是黄曲霉毒素B1(AFB1),是毒性最强的霉菌毒素之一,由于其致癌、致突变和致畸特性,被归类为1类致癌物[1]、[2]。脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON),也称为呕吐毒素,是由镰刀菌产生的一种霉菌毒素,具有免疫毒性[3]。它在储存过程中会污染谷物,从而损害谷物并对整个食物链中的动物和人类健康构成风险,这两种毒素都是普遍存在的污染物[4]。欧盟委员会为谷物及其衍生物中的脱氧雪腐镰刀菌烯醇DON和AFB1制定了最大限量(MLs),分别为750 μg/kg和2 μg/kg。相比之下,中国的法规标准将各种谷物中的AFB1限量设定在5至20 μg/kg之间,而禽类复合饲料中DON的最大允许水平为≤5000 μg/kg。因此,开发AFB1和DON的检测方法对于减轻人类健康风险和防止因污染造成的重大经济损失至关重要[5]、[6]。
利用基因编辑原理的CRISPR-Cas检测技术由于其高灵敏度、特异性和可编程性,在霉菌毒素检测领域得到了越来越多的应用[7]、[8]。已经开发了多种基于CRISPR-Cas12a的平台来检测黄曲霉毒素、脱氧雪腐镰刀菌烯醇、伏马菌素B1和赭曲霉毒素A[9]、[10]、[11]。然而,这些平台大多使用适配体作为识别元件,霉菌毒素与适配体的结合会激活或抑制Cas12a的切割活性,从而调节报告核酸的切割以生成可检测的信号。虽然抗体相比适配体具有更好的稳定性和亲和力,并广泛用于免疫测定,但将抗体整合到CRISPR-Cas12a系统中受到从非核酸目标高效信号转导的挑战。抗体-寡核苷酸结合技术通过实现核酸介导的Cas12a激活克服了这一障碍[12]。然而,大多数现有方法依赖于生物素-链霉亲和素连接,尽管多价性提供了有限的放大效果,但容易发生非共价解离、空间阻碍和可变结合效率等问题,这些问题会影响信号转导的稳定性[13]、[14]。相比之下,无铜点击化学——特别是菌株诱导的叠氮-炔烃环加成(SPAAC)反应,使用二苯并环辛炔(DBCO)和叠氮化物——能够形成稳定的共价三唑键,具有出色的生物正交性和效率[15]。这种方法提高了抗体-DNA结合的可靠性,从而优化了CRISPR-Cas12a系统中的信号转导和级联放大,最终提高了霉菌毒素检测的性能。
核酸放大技术,包括聚合酶链反应(PCR)、杂交链反应(HCR)、催化发夹组装(CHA)和重组酶聚合酶放大(RPA),已广泛与CRISPR-Cas12a系统结合,以实现超灵敏检测[16]、[17]、[18]。然而,这些方法通常需要复杂的核酸序列设计,这限制了它们的广泛应用。相比之下,末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)是一种模板独立的聚合酶,可以利用dNTP池延长3’-OH末端,通过更简单的设计实现可编程放大[19]。磁性球形核酸(MSNAs)在磁核上具有密集修饰的核酸,与传统球形核酸相比,具有更好的目标识别能力、磁分离能力和信号放大效果[20]。因此,将它们与CRISPR-Cas12a系统结合可以产生更优越的检测性能。
在这项工作中,我们开发了一种超灵敏的比色传感器,使用CRISPR-Cas12a进行初级信号放大,并结合TdT进行级联放大。该传感器采用无铜点击化学合成抗体-aDNA用于目标识别和信号转导,通过间接竞争反应实现。CRISPR-Cas12a系统与MSNAs作为报告分子进行切割放大。产生的具有3’-OH末端的DNA片段通过TdT使用dATP池延长形成polyA序列。polyA在AuNPs上的非特异性吸附保护它们免受盐诱导的聚集,基于AuNPs的特性实现无标记的比色检测和高信号输出。这实现了AFB1和DON的超灵敏比色检测。我们选择了AFB1和DON作为典型的霉菌毒素目标。在优化过程中,我们评估了检测限、线性范围、特异性、批间变异系数和实际样品中的回收率。该方法作为一种CRISPR-Cas12a级联放大生物传感器,适用于食品安全监测、环境检测和医疗保健中的多种目标。

部分摘录

化学物质和材料

所有DNA和RNA寡核苷酸序列均基于先前的报告,并由Sangon Biotech(上海)有限公司合成和修饰。详细序列信息见表S1。黄曲霉毒素AFB1和DON购自Sigma-Aldrich Chemical Co.(美国密苏里州圣路易斯)。抗黄曲霉毒素mAb 1C11和DON由李培武教授实验室慷慨提供。LbCas12a购自Tolo Biotech Co.(中国上海)。NEBuffer™ r2.1购自America New England

CTCA-ATI传感器平台原理

AFB1和DON的检测机制如图1所示。在检测过程中,微孔板预先涂有AFB1或DON抗原。在测试样品中不存在目标分析物的情况下,固定的抗原与Ab-aDNA结合,将免疫识别信号转化为核酸信号。未结合的Ab-aDNA通过洗涤去除。加入CRISPR-Cas12a蛋白和crRNA后,预组装的crRNA-Cas12a复合物与aDNA结合,形成三元复合物并激活

结论

在这项研究中,我们开发了一个高灵敏度检测平台,整合了CRISPR-Cas12a和TdT,可以同时定量多种小分子分析物。对于食品安全等领域的复杂样品矩阵,CTCA-ATI表现出优异的特性,包括低检测限、宽线性范围、高回收率和出色的批次内一致性。与现有的比色检测方法相比,该平台在皮克级别提供了更高的灵敏度

CRediT作者贡献声明

余春雷:撰写 – 审稿与编辑,撰写 – 原始草稿,可视化,数据管理,概念化。任凯云:方法学,数据管理。徐学珍:验证,研究。马金苗:方法学,正式分析。李法兰:监督。张艳艳:正式分析。杨青青:撰写 – 审稿与编辑,资源管理,项目协调,资金获取。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的可能会影响本文工作的财务利益或个人关系。

致谢

本工作得到了山东省自然科学基金(ZR2025MS367)和国家自然科学基金(32161133008)的支持。

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