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摘要背景结直肠癌(CRC)是全球癌症死亡的第三大原因,在晚期阶段的预后较差。目前,有效的CRC生物标志物仍然有限。本研究旨在探讨免疫相关基因和铁死亡相关基因(IFRGs)的潜在预后价值。方法相关CRC数据从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达组学数据库(GEO)中提取。使用Kap
结直肠癌(CRC)是全球癌症死亡的第三大原因,在晚期阶段的预后较差。目前,有效的CRC生物标志物仍然有限。本研究旨在探讨免疫相关基因和铁死亡相关基因(IFRGs)的潜在预后价值。
相关CRC数据从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达组学数据库(GEO)中提取。使用Kaplan-Meier曲线、接收者操作特征(ROC)分析和多变量Cox回归分析来评估IFRGs的预后价值。同时进行了免疫细胞浸润和免疫治疗反应的预测分析。通过定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和Western blotting分析分别检测了CRC组织和正常组织中半胱氨酸双加氧酶1型(CDO1)mRNA和蛋白质的表达水平。
通过差异表达基因分析和交叉分析,共鉴定出38个IFRGs。其中,CRC组织中的CDO1 mRNA和蛋白质表达水平显著低于正常组织。多变量Cox回归分析显示CDO1仍是一个独立的预后生物标志物。此外,CDO1的高甲基化与CRC患者的较差预后相关。CDO1表达或甲基化状态不同的CRC患者表现出显著不同的免疫细胞浸润和免疫治疗反应。
我们的研究表明CDO1在CRC中具有预后作用,这为开发新的治疗策略提供了依据,例如使用去甲基化药物或联合免疫治疗方案。
结直肠癌(CRC)是全球癌症死亡的第三大原因,在晚期阶段的预后较差。目前,有效的CRC生物标志物仍然有限。本研究旨在探讨免疫相关基因和铁死亡相关基因(IFRGs)的潜在预后价值。
相关CRC数据从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达组学数据库(GEO)中提取。使用Kaplan-Meier曲线、接收者操作特征(ROC)分析和多变量Cox回归分析来评估IFRGs的预后价值。同时进行了免疫细胞浸润和免疫治疗反应的预测分析。通过定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和Western blotting分析分别检测了CRC组织和正常组织中半胱氨酸双加氧酶1型(CDO1)mRNA和蛋白质的表达水平。
通过差异表达基因分析和交叉分析,共鉴定出38个IFRGs。其中,CRC组织中的CDO1 mRNA和蛋白质表达水平显著低于正常组织。多变量Cox回归分析显示CDO1仍是一个独立的预后生物标志物。此外,CDO1的高甲基化与CRC患者的较差预后相关。CDO1表达或甲基化状态不同的CRC患者表现出显著不同的免疫细胞浸润和免疫治疗反应。
我们的研究表明CDO1在CRC中具有预后作用,这为开发新的治疗策略提供了依据,例如使用去甲基化药物或联合免疫治疗方案。
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